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大腸桿菌概述及菌株的分型
閱讀:817 發(fā)布時間:2023-7-17大腸桿菌作為外源基因表達(dá)的宿主,遺傳背景清楚,技術(shù)操作簡單,培養(yǎng)條件簡單,大規(guī)模發(fā)酵經(jīng)濟(jì),倍受遺傳工程專家的重視.目前大腸桿菌是應(yīng)用zui 廣泛,最成功的表達(dá)體系,常做高效表達(dá)的shou 選體系。真核基因在大腸桿菌中表達(dá),必須有合適的表達(dá)載體(Vector),常用載體:pBV220,pET系統(tǒng)。
一、目的基因在大腸桿菌中表達(dá)的情況:
大腸桿菌更適合原核基因的表達(dá),外源基因表達(dá)產(chǎn)量與單位體積產(chǎn)量是正相相關(guān)的,而單位體積產(chǎn)量與細(xì)胞濃度和每個細(xì)胞平均表達(dá)產(chǎn)量呈正相相關(guān).細(xì)胞濃度與生長速率,外源基因拷貝數(shù)和表達(dá) 產(chǎn)物產(chǎn)量之間存在動態(tài)平衡,單個細(xì)胞的產(chǎn)量又與外源基因拷貝數(shù),基因表達(dá)效率,表達(dá)產(chǎn)物的穩(wěn)定性和細(xì)胞代謝負(fù)荷等因素有關(guān)。
二、大腸桿菌的菌落形態(tài):
大腸桿菌在普通瓊脂培養(yǎng)基上面都是一樣的,圓形邊緣整齊,表面光滑,半透明,小凸起;典型的大腸桿菌在伊紅美藍(lán)瓊脂平板上的特征為:深紫黑色、光滑、濕潤、帶有金屬光澤的圓形菌落。
大腸桿菌是動物腸道中的正常寄居菌,其中很小一部分在一定條件下引起疾病 。大腸桿菌的血清型能夠引起人體或動物胃腸道感染,主要是由特定的菌毛抗原、致病性毒素等感染引起的,除胃腸道感染以外,還會引起尿道感染、關(guān)節(jié)炎、腦膜炎以及敗血型感染等。
三、大腸桿菌菌株的分型:
1:DH5a菌株
DH5a是一種常用于質(zhì)??寺〉木?。E.coliDH5a在使用pUC系列質(zhì)粒載體轉(zhuǎn)化時,可與載體編碼的β-半乳糖苷酶氨基端實(shí)現(xiàn)α-互補(bǔ)??捎糜谒{(lán)白斑篩選鑒別重組菌株。
基因型:F-,φ80dlacZΔM15,Δ(lacZYA-argF)U169,deoR,recA1,endA1,hsdR17(rk-,mk+),phoA,supE44,λ-,thi-1,gyrA96,relA1
2:BL21(DE3)菌株
該菌株用于高效表達(dá)克隆于含有噬菌體T7啟動子的表達(dá)載體(如pET系列)的基因。T7噬菌體RNA聚合酶位于λ噬菌體DE3區(qū),該區(qū)整合于BL21的染色體上。該菌適合表達(dá)非毒性蛋白。
基因型:F-,ompT,hsdS(rBB-mB-),gal,dcm(DE3)
3:BL21(DE3)pLysS菌株
該菌株含有質(zhì)粒pLysS,因此具有氯霉素抗性。PLysS含有表達(dá)T7溶菌酶的基因,能夠降低目的基因的背景表達(dá)水平,但不干擾目的蛋白的表達(dá)。該菌適合表達(dá)毒性蛋白和非毒性蛋白。
基因型:F-,ompThsdS(rBB-mB-),gal,dcm(DE3,pLysS,Camr
4:JM109菌株
該菌株在使用pUC系列質(zhì)粒載體進(jìn)行DNA轉(zhuǎn)化或用M13phage載體進(jìn)行轉(zhuǎn)染時,由于載體DNA產(chǎn)生的LacZa多肽和JM09編碼的LacZΔM15進(jìn)行α-互補(bǔ),從而顯示β-半乳糖苷酶活性,由此很容易鑒別重組體菌株
基因型:recA1,endA1,gyrA96,thi-1,hsdR17,supE44,relA1,Δ(lac-proAB)/F’
5:TOP 10菌株
該菌株適用于高效的DNA克隆和質(zhì)粒擴(kuò)增,能保證高拷貝質(zhì)粒的穩(wěn)定遺傳。
基因型:F-,mcrAΔ(mrr-hsdRMS-mcrBC),φ80,lacZΔM15,△lacⅩ74,recA1,araΔ139Δ(ara-leu)7697,galU,galK,rps,(Strr)endA1,nupG
6:HB101菌株
該菌株遺傳性能穩(wěn)定,使用方便,適用于各種基因重組實(shí)驗(yàn)
基因型:supE44,hsdS20(rB-mB-),recA13,ara-14,proA2,lacY1,galK2,rpsL20,xyl-5,mtl-1,leuB6,thi-1M110或SCS110
大多數(shù)大腸桿菌菌株中含有Dam甲基化酶和Dcm甲基化酶,前者可以在GATC序列中腺嘌呤N-6位上引入甲基,后者在CCA/TGC序列的第一個胞嘧啶C-5位置上引入甲基。常用的菌株都會產(chǎn)生dam,dcm,從而受到甲基化的影響.部分限制性內(nèi)切酶對甲基化的DNA不能切割,如FbaI和MboI等,一般生物公司提供的內(nèi)切酶說明中均有說明。大多數(shù)酶切位點(diǎn)的甲基化不影響切割,而有些會影響,如XbaI,BclI等。而且甲基化只發(fā)生在特定序列,以XbaI為例,只有在位點(diǎn)序列旁出現(xiàn)GA或TC,該XbaI位才會被甲基化。而要解除這種限制修飾作用通常有兩種方法:
?。?)選用上述酶的同功酶,如Sau3AI,DNA識別切割位點(diǎn)與MboI相同;但不受甲基化影響;
?。?)利用甲基化酶缺失的受體細(xì)胞進(jìn)行DNA的制備,如E.coliJM110和鏈霉菌等,前者Dam和Dcm甲基化酶已敲出,而后者細(xì)胞內(nèi)本就沒有甲基化酶,從這些細(xì)胞中抽提的DNA就能被上述酶切割。