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技術(shù)文章

非編碼DNA變異也會(huì)增加自閉癥風(fēng)險(xiǎn)

點(diǎn)擊次數(shù):1022 發(fā)布時(shí)間:2018-9-18

近年來,科學(xué)家們已明確指出出現(xiàn)的基因突變(即新生突變)導(dǎo)致大約三分之一的自閉癥譜系障礙(autism spectrum disorder, ASD)病例。在一項(xiàng)新的研究中,來自美國加州大學(xué)圣地亞哥分校等研究機(jī)構(gòu)的研究人員發(fā)現(xiàn)了一類新的罪魁禍?zhǔn)祝悍蔷幋aDNA區(qū)域中發(fā)生的罕見的遺傳性變異,它們可能解釋著余下風(fēng)險(xiǎn)因素(即除新生突變之外的風(fēng)險(xiǎn)因素)中的一些。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在2018年4月20日的Science期刊上,論文標(biāo)題為“Paternally inherited cis-regulatory structural variants are associated with autism”。 

這些新發(fā)現(xiàn)的風(fēng)險(xiǎn)因素與已知的自閉癥遺傳原因有兩種重要的不同之處。首先,這些遺傳性變異并不直接改變基因,而是破壞打開和關(guān)閉基因的DNA控制元件,即順式調(diào)控元件(cis-regulatory element, CRE)。其次,這些遺傳性變異不是作為自閉癥兒童的新突變發(fā)生的,而是從他們的父母遺傳下來的。

為了研究ASD患者基因組中剩下的98%的DNA序列,Sebat和他的同事們分析了來自2600個(gè)家庭的9274名受試者的完整基因組。在圣地亞哥的人類長壽公司(Human Longevity Inc.)和Illumina公司測(cè)序了一千名受試者的基因組序列,并在加州大學(xué)圣地亞哥分校的圣地亞哥超級(jí)計(jì)算中心分析了這些被測(cè)序出的DNA序列。這些數(shù)據(jù)隨后與來自Simons Simplex Collection自閉癥數(shù)據(jù)庫和Autism Speaks MSSNG全基因組測(cè)序項(xiàng)目(Autism Speaks MSSNG Whole Genome Sequencing Project)的其他大型研究相結(jié)合在一起。

這些研究人員隨后分析了結(jié)構(gòu)變異(structural variant, SV):缺失的或重復(fù)的DNA片段,這些片段的缺失或重復(fù)破壞了基因的順式調(diào)控元件(CRE),因而這些結(jié)構(gòu)變異被稱作CRE-SV。這些研究人員從完整的家族基因組中發(fā)現(xiàn)從父母中遺傳的CRE-SV也會(huì)促進(jìn)ASD產(chǎn)生。

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