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技術(shù)文章

科學(xué)家揭示肝癌免疫微環(huán)境動態(tài)特征

點(diǎn)擊次數(shù):989 發(fā)布時(shí)間:2019-12-27

 

 

肝細(xì)胞癌是世界范圍內(nèi)死亡率*三的癌癥,其中中國的肝癌發(fā)病率居世界。HBV(乙肝病毒)的慢性感染是中國肝細(xì)胞癌發(fā)生的主要原因,其感染導(dǎo)致腫瘤微環(huán)境常伴隨慢性炎癥。免疫逃逸被認(rèn)為是癌癥發(fā)展的標(biāo)志之一,目前研究表明,腫瘤存在多種免疫逃逸機(jī)制。日前,中國學(xué)者指出研究腫瘤微環(huán)境中不同免疫細(xì)胞狀態(tài)的重要性,而不同類型的單細(xì)胞測序技術(shù)則是研究不同類型免疫細(xì)胞狀態(tài)和動態(tài)的有力手段。相關(guān)成果于11月1日發(fā)表于《細(xì)胞》雜志上。

此成果是北京大學(xué)生物醫(yī)學(xué)前沿創(chuàng)新中心(BIOPIC)、生命科學(xué)學(xué)院張澤民課題組聯(lián)合首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京世紀(jì)壇醫(yī)院彭吉潤課題組以及德國藥企勃林格殷格翰公司多位科學(xué)家聯(lián)合完成。他們對肝癌患者多個組織的免疫細(xì)胞作出了系統(tǒng)性的刻畫,分析了免疫細(xì)胞動態(tài)遷移和狀態(tài)轉(zhuǎn)化的特征,探索了它們在肝癌治療上的潛在價(jià)值。

研究者結(jié)合通量相對較高的10x Genomics和基因捕獲率高的SMART-seq2測序技術(shù),從肝癌患者的肝癌組織、癌旁正常組織、肝淋巴結(jié)、血液和腹水五個組織器官中分離、測序和分析了CD45+免疫細(xì)胞的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組。通過整合兩組數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,研究者充分發(fā)揮了兩種數(shù)據(jù)的優(yōu)勢,刻畫了高分辨率的肝癌免疫圖譜。因此,聯(lián)合使用具有不同優(yōu)勢的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)進(jìn)行細(xì)胞異質(zhì)性的研究或可成為相關(guān)研究的范式策略之一。

隨后,研究發(fā)現(xiàn),高表達(dá)LAMP3的樹突狀細(xì)胞無論在體內(nèi)還是體外都具有激活和成熟的特征,可以從腫瘤遷移到周淋巴結(jié),表達(dá)多種免疫配體基因,并具有與多種T淋巴細(xì)胞類型相互作用的潛力。通過轉(zhuǎn)錄組相似性分析,研究者發(fā)現(xiàn)腫瘤中巨噬細(xì)胞亞群表現(xiàn)出不同的轉(zhuǎn)錄狀態(tài)和向腹水轉(zhuǎn)移的能力。后,結(jié)合多種生物信息學(xué)分析方法,研究者發(fā)現(xiàn)腹水中的髓系細(xì)胞和淋巴細(xì)胞分別主要來源于腫瘤和血液,但腫瘤中的增殖性T細(xì)胞往往在腹水中積累。

該論文的共同通訊作者副研究員任仙文指出,本項(xiàng)研究*對肝癌臨床樣本進(jìn)行包括病理組織在內(nèi)的多組織位點(diǎn)的收集,并利用前沿的生物信息學(xué)分析方法,通過自體對照,不僅描述了肝癌微環(huán)境的免疫組分和狀態(tài),而且描繪了腫瘤浸潤免疫細(xì)胞跨組織的動態(tài)過程。此項(xiàng)的開創(chuàng)性工作,可為人們研究肝癌和其他疾病中的免疫細(xì)胞,以及開發(fā)新的臨床檢測與治療方案提供新的思路

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