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新冠肺炎RT-PCR檢測試劑開發(fā)策略

2020-2-27  閱讀(1670)

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從武漢肺炎爆發(fā)以來,翊圣生物積極參與其中,基于長期儲備的分子酶雙向改造、蛋白發(fā)酵純化和高效抗體篩選技術(shù)平臺,翊圣生物已儲備有2000多萬份新型冠狀病毒檢測試劑盒酶原料,可日組裝40萬次新型冠狀病毒核酸檢測試劑盒!現(xiàn)在我們總結(jié)武漢肺炎診斷試劑盒(RT-PCR法)中的核心原料的開發(fā)策略,供讀者參閱。

一、開發(fā)目的:
利用中國CDC和WHO指導(dǎo)文件中相關(guān)基因的引物和探針,依次驗(yàn)證質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品、假病毒標(biāo)準(zhǔn)品,篩選出適合新冠病毒的RNA擴(kuò)增試劑。
二、開發(fā)策略:
1. 模擬測試質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品樣本
將檢測靈敏度和特異性作為RT-PCR探針法檢測試劑的核心指標(biāo),篩選出了靈敏度至少達(dá)到10 copies (20 μL反應(yīng)體系),高特異性判別新冠病毒ORF1ab、N gene和E gene的候選配方。

      

  圖1. 以SARS-CoV-2 ORF1ab和N gene質(zhì)粒為模板,模板投入量107-101拷貝數(shù),采用CDC建議引物和探針,進(jìn)行單管多重?cái)U(kuò)增檢測。在此過程中,根據(jù)引物和探針屬性,優(yōu)化擴(kuò)增程序
                                                                                
  圖2. 以SARS-CoV-2 ORF1ab質(zhì)粒,E gene PCR產(chǎn)物為模板,模板投入量107-101拷貝數(shù),采用WHO建議引物和探針,進(jìn)行單管多重?cái)U(kuò)增檢測。在此過程中,根據(jù)引物和探針屬性,優(yōu)化擴(kuò)增程序。


2. 模擬測試假病毒標(biāo)準(zhǔn)品樣本
模擬新冠病毒樣本核酸提取到擴(kuò)增全流程,篩選出了假病毒樣本靈敏度至少達(dá)到103 copies/mL (25 μL反應(yīng)體系)的配方。

                                                                                          

圖3. 以SARS-CoV-2 ORF1ab和N gene假病毒為模板,模板投入量107-103 copies/mL,采用中國CDC建議引物和探針,進(jìn)行單管多重?cái)U(kuò)增檢測。


3. 試劑穩(wěn)定性測試
將試劑保存條件的容忍度和批次穩(wěn)定性作為試劑穩(wěn)定性的評估指標(biāo),測定該配方批次間和批次內(nèi)CV值<5%,可反復(fù)凍融次數(shù)50次,4℃,25℃保存一周,性能無變化,保證了質(zhì)量穩(wěn)定可靠。

                                                                    

 圖4. 生產(chǎn)批次:H1029950。以SARS-CoV-2 ORF1ab和N gene假病毒為模板,模板投入量107-103 copies/mL,進(jìn)行單管多重?cái)U(kuò)增檢測,比較Ct值和擴(kuò)增曲線線型。
 

                                                             

圖5. 生產(chǎn)批次:H1029950、H1029920、H1025890。以SARS-CoV-2 ORF1ab和N gene假病毒為模板,模板投入量107-103 copies/mL,進(jìn)行單管多重?cái)U(kuò)增檢測,比較Ct值和擴(kuò)增曲線線型。

                                                                      

圖6. 以SARS-CoV-2 ORF1ab和N gene假病毒為模板,模板投入量106-103 copies/mL,進(jìn)行單管多重?cái)U(kuò)增檢測,比較4℃、25℃保存1-7天后Ct值和擴(kuò)增曲線線型。
 

                                                                              

圖7. 以SARS-CoV-2 ORF1ab和N gene假病毒為模板,模板投入量106-103 copies/mL,進(jìn)行單管多重?cái)U(kuò)增檢測,比較反復(fù)凍融50次處理后Ct值和擴(kuò)增曲線線型。

三、RT-PCR檢測試劑盒:Hifair® V nCov Multiplex One Step RT-qPCR Probe Kit
至此,即開發(fā)出基于多重?zé)晒釸T-PCR原理,可以以冠狀病毒RNA為模板進(jìn)行多重定量PCR反應(yīng)的定量試劑,并作為新型冠狀病毒核酸檢測試劑盒的核心組分,用于試劑盒組裝。

                                                                                             


產(chǎn)品信息

產(chǎn)品名稱貨號規(guī)格
Hifair® V nCov Multiplex One Step RT-qPCR Probe Kit13110ES60100 T
Hifair® V nCov Multiplex One Step RT-qPCR Probe Kit13110ES801000 T
Hifair® V nCov Multiplex One Step RT-qPCR Probe Kit13110ES9210000 T


搭配UDGase/dUTP,可預(yù)防氣溶膠污染,產(chǎn)品如下:

產(chǎn)品名稱貨號規(guī)格
Hifair® V nCov Multiplex One Step RT-qPCR Probe Kit (UDG plus)13111ES60100 T
Hifair® V nCov Multiplex One Step RT-qPCR Probe Kit (UDG plus)13111ES801000 T
Hifair® V nCov Multiplex One Step RT-qPCR Probe Kit (UDG plus)13111ES9210000 T

HB200225

 

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