聯(lián)系電話
- 聯(lián)系人:
- 曹女士
- 電話:
- 400-6111-883
- 手機(jī):
- 售后:
- 4006-111-883
- 傳真:
- 86-21-34615995
- 地址:
- 上海市浦東新區(qū)天雄路166弄1號3樓
- 網(wǎng)址:
- www.yeasen.com
掃一掃訪問手機(jī)商鋪
在上期的“基因編輯探秘系列之原理篇"中,小翌已經(jīng)詳細(xì)介紹了CRISPR系統(tǒng)的分類、機(jī)制和原理。本篇文章將為大家介紹CRISPR技術(shù)的生物形式和遞送技術(shù)。
CRISPR技術(shù)的生物形式
為了實現(xiàn)基因組編輯,CRISPR/Cas系統(tǒng)的組件需要進(jìn)入靶細(xì)胞的細(xì)胞核中發(fā)揮作用,可以通過遞送不同形式的Cas和向?qū)NA(gRNA)來實現(xiàn),包括質(zhì)粒DNA(pDNA),mRNA或Cas核糖核蛋白(RNP)三種生物形式。
pDNA形式
pDNA通常被用作非病毒DNA傳遞的載體,其介導(dǎo)的CRISPR技術(shù)是將Cas9蛋白和gRNA的基因序列融入單個或多個pDNA載體之中。因pDNA具有易構(gòu)建、操作簡便以及成本效益高等優(yōu)點,成為了備受矚目的基因編輯方法。目前廣泛應(yīng)用的Cas9質(zhì)粒包含兩個表達(dá)盒,一個是密碼子優(yōu)化的Cas9,一個是嵌合的gRNA。與我們細(xì)胞內(nèi)遺傳信息的流動一致,含有CRISPR系統(tǒng)元件的pDNA需先進(jìn)入細(xì)胞核,隨后轉(zhuǎn)錄成相應(yīng)的mRNA,最后被轉(zhuǎn)移到細(xì)胞質(zhì)中以啟動后續(xù)的蛋白質(zhì)合成過程。
mRNA形式
mRNA介導(dǎo)的CRISPR基因編輯技術(shù),其核心在于將Cas9 mRNA與gRNA共同精準(zhǔn)地遞送至靶細(xì)胞。相較于傳統(tǒng)的pDNA轉(zhuǎn)染方式,mRNA的遞送方式能夠更為迅速地啟動蛋白質(zhì)表達(dá)過程。與pDNA的應(yīng)用策略不同,基于mRNA的編輯策略要求同時遞送Cas9 mRNA和gRNA這兩種關(guān)鍵的組分。Cas9 mRNA的制備主要依賴于體外轉(zhuǎn)錄(IVT)技術(shù),并經(jīng)過加帽和加尾修飾,以確保其穩(wěn)定性和翻譯效率。gRNA作為另一重要組件,存在雙鏈和單鏈兩種形式。雙鏈形式的gRNA由crRNA和tracrRNA共同構(gòu)成,這兩部分需要通過退火過程形成穩(wěn)定的復(fù)合物。在實際應(yīng)用中,可以通過化學(xué)合成的方式分別制備crRNA和tracrRNA,進(jìn)而組裝成完整的雙鏈gRNA。而單鏈形式的gRNA則是將crRNA和tracrRNA巧妙地融合成一個單一的分子,無需退火過程。單鏈gRNA可以通IVT或化學(xué)合成的方式獲得,兩種方法各有利弊,可根據(jù)實驗需求進(jìn)行靈活選擇。
IVT作為一種廣泛應(yīng)用的gRNA生產(chǎn)方法,因其成本效益高、產(chǎn)量大以及操作簡便等優(yōu)點,在實驗室中得到了廣泛的推廣和應(yīng)用。化學(xué)合成gRNA是利用高通量化學(xué)合成平臺來完成的,通過在gRNA的5’和3’端各加入3個硫代和甲氧基修飾,不僅可以提高gRNA的穩(wěn)定性,還能有效降低脫靶效應(yīng),從而提高基因編輯的精確性和安全性。
RNP形式
在CRISPR/Cas系統(tǒng)的應(yīng)用中,直接遞送Cas9蛋白與gRNA,從而繞過pDNA或mRNA在細(xì)胞內(nèi)部的轉(zhuǎn)錄與翻譯過程,無疑是實現(xiàn)高效基因編輯的優(yōu)選方法。這種基于蛋白的遞送方式同樣依賴于兩個核心成分:Cas9核酸酶與gRNA,首先將Cas9蛋白與gRNA結(jié)合,形成帶有負(fù)電荷的Cas9/gRNA核糖核蛋白(Cas9 RNP)復(fù)合物,隨后將Cas9 RNP作為單一組分進(jìn)行遞送。這種技術(shù)不僅簡化了操作過程,更提高了基因編輯的效率和準(zhǔn)確性。
圖1. CRISPR-Cas9的三種生物形式[1]
三種生物形式的差異
每種CRISPR系統(tǒng)的生物形式都有的物理、化學(xué)、生理特性。
穩(wěn)定性
Cas9 pDNA表現(xiàn)出最高的穩(wěn)定性,相比之下,mRNA的穩(wěn)定性較差,可通過對其核苷酸進(jìn)行化學(xué)修飾提升mRNA的穩(wěn)定性。Cas9 RNP由蛋白質(zhì)和gRNA組成,其結(jié)構(gòu)使得它容易受到蛋白酶和RNases的降解,因此是最不穩(wěn)定的形式。
遞送方式
當(dāng)Cas9的pDNA進(jìn)入細(xì)胞后,它需經(jīng)過轉(zhuǎn)錄和翻譯的過程,最終產(chǎn)生Cas9蛋白。而Cas9的mRNA則更為直接,僅需被傳遞至細(xì)胞質(zhì)中,便可啟動翻譯過程生成Cas9蛋白。隨后Cas9蛋白與gRNA組裝為復(fù)合體發(fā)揮編輯作用。相較之下,RNP形式能夠直接入核進(jìn)行編輯,無需經(jīng)歷上述復(fù)雜的轉(zhuǎn)錄和翻譯過程。因此,遞送Cas9 RNP成為了細(xì)胞基因組編輯中最為直接且高效的策略,通常也被認(rèn)為是最為理想的編輯方法。
脫靶風(fēng)險
在基因組編輯應(yīng)用中,CRISPR/Cas復(fù)合物僅在基因組修飾發(fā)生期間暫時需要,其在細(xì)胞中過度存在會增加脫靶事件的風(fēng)險。Cas9 RNP和mRNA在細(xì)胞內(nèi)的存在時間相對較短,有助于降低脫靶效應(yīng)的潛在風(fēng)險。而Cas9 pDNA能夠介導(dǎo)更長時間的基因表達(dá),可能會增加脫靶編輯事件發(fā)生的風(fēng)險。
Cas蛋白尺寸
由于常用的Cas9, Cas12a和Cas13a大小接近4kb, 而用于遞送基因編輯器到體內(nèi)的AAV系統(tǒng)的包裝上限約為4.7 kb,因此尋找更小的基因編輯系統(tǒng)對于其高效體內(nèi)遞送具有重要意義。目前不同的Cas系統(tǒng)均有小型Cas蛋白被開發(fā),如Cas9系統(tǒng)中來自金黃色釀膿葡萄球菌中的SaCas9(1000多個氨基酸);Cas12系統(tǒng)中的AaCas12b和BhCas12b(1100多個氨基酸);Cas14(又稱Cas12f1,500個氨基酸) 、Cas12j(又稱CasΦ,700氨基酸);Cas13系統(tǒng)中的Cas13bt(~800氨基酸),基因編輯已進(jìn)入迷你時代。
CRISPR/Cas系統(tǒng)常見的三種應(yīng)用模式pDNA、mRNA和RNP各有優(yōu)缺點。從張鋒、劉如謙的最新發(fā)文來看,未來RNP形式的蛋白遞送或?qū)⒊蔀槔^mRNA之后的下一個焦點。
表1.CRISPRs生物形式對比
CRISPR系統(tǒng)的三種遞送技術(shù)
CRISPR系統(tǒng)的生物形式各異,因此其遞送方法也呈現(xiàn)出多樣性。目前,CRISPR/Cas9系統(tǒng)的遞送策略已發(fā)展出多種方法,主要分為三大類別:生物遞送方法、化學(xué)遞送方法以及物理遞送方法。
在生物遞送方法中,常利用腺相關(guān)病毒(AAV)載體、慢病毒載體等作為傳遞CRISPR/Cas9系統(tǒng)的媒介,這些載體具有生物相容性好、轉(zhuǎn)染效率高等優(yōu)點,被廣泛應(yīng)用于基因編輯領(lǐng)域。
化學(xué)遞送方法則主要依賴脂質(zhì)納米顆粒(LNP)等納米材料作為載體,它們能夠高效地封裝CRISPR/Cas9系統(tǒng)并將其遞送至細(xì)胞內(nèi),同時具有較高的靶向性和生物安全性。
物理遞送方法則包括電穿孔、顯微注射等技術(shù),這些方法通過物理手段將CRISPR/Cas9系統(tǒng)直接導(dǎo)入細(xì)胞內(nèi)部,雖然操作復(fù)雜且對細(xì)胞損傷較大,但在某些特定應(yīng)用場景下仍具有的優(yōu)勢。
圖2. CRISPR技術(shù)不同的遞送方式[2]
病毒載體
在CRISPR-Cas9系統(tǒng)中,病毒載體扮演著至關(guān)重要的角色。其中,AAV、慢病毒以及桿狀病毒載體都是常用的遞送工具。值得一提的是,AAV已經(jīng)成為體內(nèi)基因治療領(lǐng)域廣泛應(yīng)用的遞送載體,并成功獲得批準(zhǔn),遞送CRISPR組件至人體用于疾病治療。
AAV之所以備受青睞,源于它能夠輕易地跨越物種屏障感染細(xì)胞,同時其免疫原性極低,大大降低了引發(fā)炎癥反應(yīng)的風(fēng)險。然而,任何事物都有其局限性,AAV載體的最大包裝容量僅為4.7kb,這對于體積龐大的CRISPR/Cas9基因編輯系統(tǒng)來說,無疑是一個巨大的挑戰(zhàn)。尤其是當(dāng)Cas9蛋白攜帶效應(yīng)蛋白時,更是需要采取特殊的修改措施,如使用體積較小的SaCas9或?qū)⑦f送系統(tǒng)分割為兩個載體,才能實現(xiàn)在AAV載體中的有效加載。
慢病毒作為能感染分裂和非分裂細(xì)胞的逆轉(zhuǎn)錄病毒,也常用作遞送載體。由于慢病毒的10kb負(fù)載能力,整個CRISPR/Cas9系統(tǒng)都可以加載到其中,但慢病毒隨機(jī)整合入宿主基因組可能引發(fā)免疫反應(yīng),甚至致癌。
脂質(zhì)納米顆粒(LNP)
盡管病毒載體遞送系統(tǒng)已將CRISPR技術(shù)應(yīng)用于臨床,但其療效仍受限于多重因素,如患者免疫反應(yīng)、載荷大小限制、重復(fù)給藥難度及長期基因表達(dá)等問題。因此,科研人員正積極探索新的遞送策略,其中LNP-mRNA等非病毒系統(tǒng)備受矚目。
脂質(zhì)載體是一種很有前景的CRISPR-Cas9系統(tǒng)遞送載體,通常由四種脂類組成:陽離子型(或電離型)脂類、聚乙二醇脂類、輔助磷脂和膽固醇。LNP的核心技術(shù)在于其具有pH依賴性的陽離子化脂質(zhì)。在遞送階段,這種脂質(zhì)能夠在中性pH環(huán)境下保持中性狀態(tài),與周圍的成分和諧共處。然而,一旦進(jìn)入酸性環(huán)境,如細(xì)胞內(nèi)的內(nèi)體,它便會迅速轉(zhuǎn)變?yōu)殛栯x子狀態(tài)。這種電荷狀態(tài)的轉(zhuǎn)變不僅能夠誘導(dǎo)粒子解離,還能夠破壞核內(nèi)體膜,從而大大增強(qiáng)其從核內(nèi)體逃逸的能力。這種機(jī)制不僅提高了遞送效率,還有效地降低了全身毒性,使得LNP成為一種安全且高效的遞送工具。
目前,已有多款基于LNP-RNA的療法成功獲得FDA的批準(zhǔn),這充分證明了LNP技術(shù)在實際應(yīng)用中的可行性和有效性。
圖3. LNP組成[2]
新興遞送系統(tǒng)
盡管LNP在臨床實踐中已展現(xiàn)出作為基因編輯納米顆粒遞送系統(tǒng)的先進(jìn)性,然而,眾多其他類型的納米載體同樣具備潛力,可巧妙地設(shè)計以進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)部。例如,聚合物納米顆粒、蛋白質(zhì)衣殼遞送系統(tǒng)以及類病毒顆粒(VLP)等,均為這一領(lǐng)域的研究者提供了新的遞送策略。
在本文中,我們向您介紹了CRISPR/Cas系統(tǒng)的三種生物形式及遞送方法,這些基礎(chǔ)知識鋪墊了對CRISPR技術(shù)的理解,為我們了解其在廣泛領(lǐng)域應(yīng)用奠定了基礎(chǔ)。請繼續(xù)關(guān)注我們的系列文章,在接下來的文章中,我們將帶您了解CRISPR/Cas技術(shù)在細(xì)胞基因治療、農(nóng)業(yè)等不同領(lǐng)域中的應(yīng)用,更多精彩內(nèi)容,不容錯過,敬請期待!
Cas RNP相關(guān)產(chǎn)品
產(chǎn)品分類 | 產(chǎn)品定位 | 產(chǎn)品名稱 | 產(chǎn)品貨號 |
Cas9蛋白 | spCas9含核定位信號 | Cas9 Nuclease | 14701ES |
spCas9+EGFP標(biāo)簽 | NLS-Cas9-EGFP Nuclease | 11364ES | |
dCas9,無切割活性 | dCas9 Nuclease | 11351ES | |
Cas12a蛋白 | Agathobacter rectalis細(xì)菌來源 | ArCas12a Nuclease | 14702ES |
氨基酸球菌來源 | Ascpf1(Cas12) Nuclease | 11352ES | |
新兇手弗朗西斯菌來源 | Fncpf1(Cas12) Nuclease | 11353ES | |
螺科菌來源 | Lbcpf1(Cas12) Nuclease | 11354ES | |
Cas12b蛋白 | 嗜酸耐熱菌來源 | AapCas12b Nuclease | 14808ES |
sgRNA合成 | 體外轉(zhuǎn)錄合成sgRNA | Hifair® Precision sgRNA Synthesis Kit | 11355ES |
參考文獻(xiàn):
[1] Yi Lin, Ernst Wagner and Ulrich L?chelt, Non-viral delivery of the CRISPR/Cas system: DNA versus RNA versus RNP, Biomater. Sci., 2022, 10, 1166–1192
[2] Taha EA, Lee J, Hotta A. Delivery of CRISPR-Cas tools for in vivo genome editing therapy: Trends and challenges. J Control Release. 2022;342:345-361.