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背景介紹
隨著生物醫(yī)學的發(fā)展,DNA甲基化(DNA methylation)標志物在癌癥診斷、治療選擇及預后評估中的重要性日益凸顯。在現(xiàn)代腫瘤治療領域,腫瘤 DNA 甲基化標志物作為一種重要的生物標志物,在癌癥的早期診斷、治療選擇及預后評估中扮演著越來越關鍵的角色。
圖1.正常細胞與腫瘤細胞DNA甲基化的狀態(tài)
DNA 甲基化是一種 DNA 的共價修飾,具體是指DNA 甲基轉移酶(DNA methyltransferases,DNMTs)將甲基加到 DNA CpG 序列中胞嘧啶的 5'碳位,形成 5?甲基胞嘧啶的過程。成簇的 CpG被稱為 CpG島(CpG islands,CGIs),主要位于結構基因的啟動子和第一外顯子區(qū)域。DNA 甲基化標志物是癌細胞中的 DNA異常甲基化改變,這種異常甲基化貫穿于癌癥發(fā)生和發(fā)展的全過程。
腫瘤DNA甲基化標志物檢測及臨床應用專家共識(2024版)指出:與傳統(tǒng)的腫瘤標志物相比,DNA甲基化標志物具有更早期、更無創(chuàng)、更精準等優(yōu)點。因此,可以通過非侵入性方式獲得的痰液、血漿、血清或尿液等樣本進行 DNA 甲基化標志物檢測。一些DNA甲基化異常發(fā)生在腫瘤形成的初始階段,通過檢測與腫瘤發(fā)展相關的甲基化標志物,可以輔助癌癥早期診斷、評估進展風險。DNA 甲基化標志物甲基化水平的增加或降低與腫瘤預后密切相關,可用于治療或性手術后評估腫瘤微小殘留病灶(MRD)和監(jiān)測復發(fā)。此外,DNA甲基化標志物還可作為化療敏感性的標志,某些特定基因的甲基化可能預示著癌癥對治療的反應,可用于判斷化療藥物的療效,以更好地指導治療方案。
DNA甲基化標志物檢測技術方法
圖2.DNA甲基化標志物檢測技術方法
甲基化建庫試劑盒搭配MGI測序接頭一直以來為技術難點,MGI 測序接頭與 Illumina Y 字型接頭類型存在很大的差異,MGI 測序接頭 Linear adapter 與 Bubble adapter 長度不同但兩端互補配對,因此會產(chǎn)生小泡狀結構,小泡狀結構會降低與單鏈DNA的連接效率,影響文庫產(chǎn)出和檢測的靈敏度。
翌圣生物甲基化研發(fā)團隊基于創(chuàng)新的MGI接頭設計方式和優(yōu)化接頭連接體系,開發(fā)出DNA甲基化MGI平臺文庫構建試劑盒,性能媲美于Illumina平臺文庫構建試劑盒,擁有優(yōu)異的接頭連接效率,較高的文庫產(chǎn)出,滿足微量cfDNA樣本的甲基化建庫需求。
Hieff NGS® Methyl-seq DNA library Prep kit for MGI(Cat#12226ES)
產(chǎn)品簡介
Hieff NGS® Methyl-seq DNA Library Prep Kit for MGI 是針對 MGI 測序平臺專業(yè)開發(fā)設計的新一代 DNA 甲基化建庫試劑盒,可以滿足甲基化轉化后10 pg~250 ng DNA 樣本建庫。該試劑盒可兼容短至 40 bp 的 DNA 樣本,適應于先轉化后建庫。
產(chǎn)品亮點
投入量低:可滿足10 pg~250 ng起始量的樣本建庫
數(shù)據(jù)質(zhì)量佳:不同樣本類型及不同投入量條件下均表現(xiàn)出優(yōu)異的數(shù)據(jù)質(zhì)量
操作簡便:2小時左右可以完成建庫
產(chǎn)品性能
MGI平臺甲基化建庫試劑12226和Illumina平臺甲基化建庫試劑12221的性能相當,MGI平臺甲基化建庫試劑12226的dup率更低。
圖3.不同樣本投入量下的文庫產(chǎn)量和下機數(shù)據(jù)基本指標
2、亞硫酸氫鹽轉化和酶法轉化后,采用12226建庫,不同樣本投入量下的文庫產(chǎn)量和下機數(shù)據(jù)基本指標
相同的樣本投入量,酶法轉化搭配MGI平臺甲基化建庫試劑12226的文庫濃度和數(shù)據(jù)質(zhì)量更高,插入片段更長,文庫豐富度更高。
圖4.亞硫酸氫鹽轉化和酶法轉化后的文庫產(chǎn)量和下機數(shù)據(jù)基本指標
新品預告
產(chǎn)品名稱 | 產(chǎn)品貨號 | 產(chǎn)品應用 |
Hieff NGS® Methyl-seq DNA library Prep kit for MGI DNA 甲基化建庫MGI試劑盒 | 12226ES | 甲基化文庫構建MGI平臺 |
敲重點:申請DNA 甲基化建庫MGI試劑盒試用裝,請聯(lián)系當?shù)劁N售或技術,數(shù)量有限,試用回饋數(shù)據(jù)有獎。
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