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參考價(jià): | 面議 |
- 12806ES08 產(chǎn)品型號(hào)
- Yeasen/翌圣生物 品牌
- 生產(chǎn)商 廠商性質(zhì)
- 上海市 所在地
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供貨周期 | 現(xiàn)貨 | 應(yīng)用領(lǐng)域 | 生物產(chǎn)業(yè) |
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Globin mRNA Depletion Probe (Human)
產(chǎn)品信息
產(chǎn)品名稱 | 產(chǎn)品編號(hào) | 規(guī)格 | 價(jià)格 |
Globin mRNA Depletion Probe (Human)
| 12806ES08 | 8 T | 285.00 |
12806ES24 | 24 T | 725.00 | |
12806ES96 | 96 T | 2655.00 |
產(chǎn)品描述
Globin mRNA Depletion Probe (Human)是針對(duì)人的珠蛋白mRNA設(shè)計(jì)的探針,能夠有效去除成年個(gè)體、嬰兒及胚胎來(lái)源的珠蛋白mRNA,包括HBA1/2, HBB,HBD,HBM,HBG1/2,HBE1,HBQ1,HBZ。該產(chǎn)品搭配Hieff NGS® MaxUp rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat) (Yeasen#12253)使用,有效去除總RNA中的rRNA及Globin mRNA以保留其他信使RNA(mRNA)和非編碼RNA。該試劑盒對(duì)于完整和部分降解的總RNA均具有良好的rRNA去除效果。經(jīng)rRNA & Globin mRNA去除所獲得的RNA樣本可用于高通量測(cè)序分析mRNA和非編碼RNA,可顯著提高測(cè)序結(jié)果中有效數(shù)據(jù)比例,也可用于cDNA合成或其它下游應(yīng)用。
適用范圍
適用于人、小鼠、大鼠血液來(lái)源的100 ng~1 μg 總RNA樣品;適用于完整或部分降解RNA樣品。
產(chǎn)品組分
組分編號(hào)和名稱 | 12806ES08 | 12806ES24 | 12806ES96 |
Globin Probe (Human) | 8 μL | 24 μL | 96 μL |
運(yùn)輸與保存方法
干冰運(yùn)輸,-20°C存放,有效期一年。
注意事項(xiàng)
1. 請(qǐng)使用無(wú)RNase污染的耗材,并對(duì)實(shí)驗(yàn)區(qū)域定期進(jìn)行清理,推薦使用Thermo Fisher公司的RNAZapTM 高效核酸去除噴霧去除RNA酶污染。
2. RNA樣品應(yīng)不含基因組DNA污染,若樣品中有g(shù)DNA殘留,應(yīng)先進(jìn)行DNase I消化并純化后再用于本試劑盒。
3. RNA樣品大投入體積為10 μL,若樣品體積較大,可先進(jìn)行濃縮。
自備材料
1. RNA純化磁珠:Hieff NGS® Cleaner(Cat#12602)或其他等效產(chǎn)品。
2. qRT-PCR質(zhì)檢rRNA去除效率:Hieff® qPCR SYBR Green Master Mix(No Rox) (Cat#11201)或其他等效產(chǎn)品;
3. 其他材料: 無(wú)水乙醇、無(wú)菌超純水、低吸附槍頭、PCR管、磁力架、PCR儀等。
操作步驟
1. 探針雜交
1.1 將探針和雜交Buffer從-20 °C 取出,解凍后顛倒混勻,置于冰上備用。
1.2 準(zhǔn)備RNA樣品:根據(jù)投入量和樣品濃度,計(jì)算RNA取樣體積,用Nuclease free H2O稀釋至10 μL。
1.3 按照表1于200 μL PCR管中配制rRNA去除反應(yīng)體系。
表 1 探針雜交反應(yīng)體系
名稱 | 體積(μL) |
Hybridization Buffer | 3 |
Probe Mix(H/M/R) | 1 |
Globin Probe(Human) | 1 |
Total RNA | 10(100 ng~1 μg) |
Total | 15 |
1.4 使用移液器輕輕吹打混勻,瞬離將反應(yīng)液離心至管底。
1.5 將上述 PCR 管置于PCR儀中,按照表2所示反應(yīng)程序,進(jìn)行探針雜交反應(yīng)。
表 2 探針雜交反應(yīng)程序
溫度 | 時(shí)間 |
熱蓋105°C | On |
95℃ | 2 min |
95℃-22℃ | 0.1℃/s |
22℃ | 5 min |
4℃ | hold |
2. RNase H消化
2.1將RNase H消化試劑從-20 °C取出,解凍后顛倒混勻,置于冰上備用。按照表 3 所示,配制RNase H消化反應(yīng)體系。
表3 RNase H消化反應(yīng)體系
名稱 | 體積(μL) |
RNase H Buffer | 3 |
RNase H | 2 |
上步產(chǎn)物 | 15 |
Total | 20 |
2.2 使用移液器輕輕吹打混勻,瞬離將反應(yīng)液離心至管底。
2.3 將上述 PCR 管置于PCR儀中,設(shè)置反應(yīng)程序:(熱蓋關(guān)) 37℃,30 min; 4℃,hold,進(jìn)行RNase H消化反應(yīng)。
3. DNase I 消化
3.1將DNase I消化試劑從-20 °C 取出,解凍后顛倒混勻,置于冰上備用。按照表4所示,配制DNase I消化反應(yīng)體系。
表4 DNase I消化反應(yīng)體系
名稱 | 體積(μL) |
DNase I Buffer | 27.5 |
DNase I | 2.5 |
上一步產(chǎn)物 | 20 |
Total | 50 |
3.2 使用移液器輕輕吹打混勻,瞬離將反應(yīng)液離心至管底。
3.3 將上述 PCR 管置于PCR儀中,設(shè)置反應(yīng)程序:(熱蓋關(guān)) 37℃,30min; 4℃,hold,進(jìn)行DNase I消化反應(yīng)。
4. RNA純化
4.1 準(zhǔn)備工作:將 Hieff NGS® RNA Cleaner (Cat#12602)磁珠由冰箱中取出,室溫平衡至少 30 min。用Nuclease free H2O配制 80%乙醇。
4.2 渦旋振蕩或充分顛倒磁珠以保證充分混勻。
4.3 吸取 110 μL Hieff NGS® RNA Cleaner(2.2×,Beads:DNA=2.2:1)至上一步產(chǎn)物中,移液器充分吹打混勻,室溫孵育 5 min。
4.4 將PCR管置于磁力架中分離磁珠和液體,待溶液澄清后(約3 min),小心移除上清。
4.5 保持PCR管始終置于磁力架中,加入 200 μL Nuclease free H2O新鮮配制的80%乙醇漂洗磁珠,室溫孵育 30 sec 后,小心移除上清。
4.6 重復(fù)步驟 4.5,總計(jì)漂洗兩次。用 10 μL移液器吸干凈殘留液體。
4.7 保持 PCR 管始終置于磁力架中,室溫下開(kāi)蓋干燥磁珠(5~10 min)。
4.8 RNA洗脫:將PCR 管從磁力架上取下,加入 11 μL Nuclease free H2O(或使用適合下游實(shí)驗(yàn)的相應(yīng)體積Nuclease free H2O或洗脫緩沖液),使用移液器輕輕吹打至充分混勻,室溫靜置 5 min。
4.9將 PCR管短暫離心并置于磁力架中靜置,待溶液澄清后(約3 min),小心移取 10 μL 上清(可根據(jù)步驟4.8選擇的實(shí)際洗脫體積進(jìn)行相應(yīng)調(diào)整)至新的Nuclease free PCR 管中。
【注】洗脫后的樣品請(qǐng)立即進(jìn)行下游實(shí)驗(yàn),或置于-80℃存放。
案例展示
Human Blood Total RNA分別進(jìn)行rRNA去除、rRNA&Globin 去除后建庫(kù)測(cè)序,對(duì)比Globin mRNA含量。
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建庫(kù)試劑盒 | 產(chǎn)品編號(hào) | 規(guī)格 |
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文庫(kù)構(gòu)建磁珠 | 產(chǎn)品編號(hào) | 規(guī)格 |
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Hieff NGS® DNA Selection Beads(Superior AMPure XP alternative) | 12601ES08/56 | 5/60 mL |
Hieff NGS® RNA Cleaner | 12602ES08/56 | 5/60 mL |
Hieff NGS® mRNA Isolation Master Kit | 12603ES24/96 | 24/96 T |
建庫(kù)接頭 | 產(chǎn)品編號(hào) | 規(guī)格 |
Hieff NGS® 96 Single Index Primer Kit for Illumina®, Set 1/2 | 12611/12612ES02 | 48×2 T |
Hieff NGS® 384 CDI Primer for Illumina®, Set1/2 | 12412/12413ES02 | 96×2 T |
Hieff NGS® RNA 384 CDI Primer for Illumina®, Set1/ 2 | 12414/12415ES02 | 96×2 T |
Hieff NGS® Complete Adapter Kit for Illumina®, Set 1/2 | 12615/12616ES04/16 | 12×4/12×16 T |
Hieff NGS® Complete Adapter Kit for Illumina®, Set 3/4 | 12617/12618ES04/16 | 12×4/12×16 T |
Hieff NGS® Tagment Index Kit for Illumina®,(96 Index) | 12610ES96 | 96 T |
建庫(kù)模塊 | 產(chǎn)品編號(hào) | 規(guī)格 |
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