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參考價 | ¥175 |
- 11175ES 型號
- Yeasen/翌圣生物 品牌
- 生產(chǎn)商 廠商性質(zhì)
- 上海市 所在地
20 T | 175元 | 70 件 可售 |
訪問次數(shù):236更新時間:2023-10-21 22:53:34
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- 地址:
- 上海市浦東新區(qū)天雄路166弄1號3樓
- 網(wǎng)址:
- www.yeasen.com
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供貨周期 | 現(xiàn)貨 | 應(yīng)用領(lǐng)域 | 醫(yī)療衛(wèi)生,制藥 |
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產(chǎn)品簡介
Hifair® Advanced One Step RT-qPCR SYBR Green Kit是一款基于SYBR Green I染料進(jìn)行熒光定量的試劑盒。使用基因特異性引物,反轉(zhuǎn)錄和qPCR反應(yīng)在一管內(nèi)完成,無需反復(fù)的開蓋和移液操作,大大提高了檢測效率,并降低了污染的風(fēng)險。對于RNA樣本,試劑盒采用耐熱Hifair® V Reverse Transcriptase高效合成cDNA,同時采用UNICON® HotStart Taq DNA Polymerase進(jìn)行定量擴增。在優(yōu)化的緩沖體系下,該試劑盒的檢測靈敏度針對高表達(dá)的靶標(biāo), 可以檢至0.1 pg,中等表達(dá)的靶標(biāo),可以檢至1 pg。該試劑盒同時也適用于DNA樣本的擴增定量。該試劑盒可實現(xiàn)不同動植物樣本、細(xì)胞、微生物核酸的高靈敏檢測和定量。
產(chǎn)品信息
貨號 | 11175ES20 / 11175ES70 |
規(guī)格 | 20 T / 200 T |
組分信息
組分編號 | 組分名稱 | 11175ES20 | 11175ES70 |
11175-A | 2× Hifair® Advanced SG Buffer | 250 μL | 2×1.25 mL |
11175-B | Hifair® Advanced UH Enzyme Mix | 20 μL | 200 μL |
11175-C | RNase free H2O | 250 μL | 2×1.25 mL |
儲存條件
-25~-15℃避光儲存,有效期1年。
使用說明
推薦反應(yīng)體系
組分 | 體積(μL)**** | 體積(μL) | 終濃度 |
12.5 | 25 | 1× | |
Hifair® Advanced UH Enzyme Mix | 1 | 2 | - |
Forward Primer (10 μM)** | 0.5 | 1 | 0.2 μM |
Reverse Primer (10 μM)** | 0.5 | 1 | 0.2 μM |
模板 RNA*** | X | X | |
RNase-free ddH2O | to 25 | to 50 |
表1反應(yīng)體系*****
** 通常引物終濃度為0.2 μM,也可根據(jù)情況在0.1-1 μM之間進(jìn)行調(diào)整。
*** 該試劑靈敏度,Total RNA在1 pg – 1 μg,人源樣本測試顯示最佳投入量為1 pg – 100 ng,控制Ct值整體在15-30之間為宜。
**** 推薦使用20 μL或 50 μL,以保證目的基因擴增的有效性和重復(fù)性。
***** 請于超凈工作臺內(nèi)配制,并使用無核酸酶殘留的槍頭、反應(yīng)管;推薦使用帶濾芯的槍頭。避免交叉污染和氣溶膠污染。
反應(yīng)程序
循環(huán)步驟 | 溫度 | 時間 | 循環(huán)數(shù) |
反轉(zhuǎn)錄 | 50℃* | 6 min | 1 |
預(yù)變性 | 95℃ | 5 min | 1 |
擴增反應(yīng) | 95℃ | 15 sec | 40 |
60℃** | 30 sec | ||
熔解曲線 | 儀器默認(rèn)設(shè)置 | 1 |
表2 標(biāo)準(zhǔn)擴增程序
* 反轉(zhuǎn)錄溫度可根據(jù)實驗需求在50-55℃之間進(jìn)行選擇。對于DNA樣本,反轉(zhuǎn)錄過程可省去。
** 特殊情況下退火/延伸溫度可根據(jù)引物Tm值進(jìn)行調(diào)整,建議使用60℃。
3. 適用機型
不需要Rox校正的儀器型號:
Bio-Rad: CFX96, CFX384, iCycler iQ, iQ5, MyiQ, MiniOpticon, Opticon, Opticon 2, Chromo4;
Eppendorf: Mastercycler ep realplex, realplex 2 s;
Qiagen: Corbett Rotor-Gene Q, Rotor-Gene 3000, Rotor-Gene 6000;
Roche Applied Science: LightCycler 480, LightCycler2.0, Lightcycler 96;
Thermo Scientific: PikoReal Cycler; Cepheid: SmartCycler; Illumina: Eco qPCR;
Low Rox適用機型: ABI 7500, 7500 Fast, ViiA7, QuantStudio 3 and 5, QuantStudio 6, 7, 12k Flex;
Stratagene MX3000P, MX3005P, MX4000P;
High Rox適用機型: ABI 5700, 7000, 7300, 7700, 7900HT Fast, StepOne, StepOne Plus.
4. 引物設(shè)計技巧
1)引物最好應(yīng)設(shè)計成跨越一個外顯子-外顯子連接,其中一條擴增引物可以潛在地跨越實際外顯子-內(nèi)含子邊界。這種設(shè)計可以減少從污染的基因組DNA中擴增到假陽性的風(fēng)險。
2)引物應(yīng)具有特異性。引物設(shè)計完成以后,應(yīng)對其進(jìn)行BLAST檢測。
3)引物長度一般在18~27 bp,不應(yīng)過長否則導(dǎo)致其延伸溫度過高,不適于Taq DNA 聚合酶反應(yīng)。
4)引物GC含量在40%~60%,GC含量過高或過低都不利于反應(yīng)。上下游引物的GC含量不能相差太大。另外,上下游引物的Tm值是寡核苷酸的解鏈溫度,即在一定鹽濃度條件下,50%寡核苷酸雙鏈解鏈的溫度。有效啟動溫度,一般高于Tm值5~10℃??砂垂絋m= 4(G+C)+2(A+T)估算引物的Tm值,也可以通過軟件計算引物Tm值。
5)PCR產(chǎn)物的長度通常控制在80-300 bp,為了保證擴增效率,在設(shè)計引物時要考慮PCR產(chǎn)物的長度。
6)引物3′端末端盡量避免為A,引物3′端錯配時,不同堿基引發(fā)效率存在著很大的差異,當(dāng)末位的堿基為A時,即使在錯配的情況下,也能有引發(fā)鏈的合成,而當(dāng)末位鏈為T時,錯配的引發(fā)效率大大降低,G、C錯配的引發(fā)效率介于A、T之間,所以3′端最好選擇T。
7)堿基要隨機分布,不要有聚嘌呤或聚嘧啶的存在。尤其3′端不應(yīng)超過3個連續(xù)的G或C,因這樣會使引物在GC富集序列區(qū)錯誤引發(fā)。
8)引物自身及引物之間避免存在互補序列,否則引物自身會折疊成發(fā)夾結(jié)構(gòu)使引物本身復(fù)性。這種二級結(jié)構(gòu)會因空間位阻而影響引物與模板的復(fù)性結(jié)合。引物自身不能有連續(xù)4個堿基的互補。兩引物之間也不應(yīng)具有互補性,尤其應(yīng)避免3′ 端的互補重疊以防止引物二聚體的形成。引物之間不能有連續(xù)4個堿基的互補。引物二聚體及發(fā)夾結(jié)構(gòu)如果不可避免的話,應(yīng)盡量使其DG值不要過高(應(yīng)小于4.5 kcal/mol)。否則易導(dǎo)致產(chǎn)生引物二聚體帶,并且降低引物有效濃度而使PCR 反應(yīng)不能正常進(jìn)行。
5. 異常結(jié)果分析
無Ct值出現(xiàn)
采集熒光信號的步驟有誤:在退火/延伸結(jié)束采集信號;
引物降解:可通過PAGE電泳檢測其完整性;
模板量不足:對未知濃度的樣品應(yīng)從原液開始測試;
模板降解:避免樣品制備中雜質(zhì)的引入及反復(fù)凍融的情況。
Ct值偏大 (Ct >35)
擴增效率低:反應(yīng)條件不夠優(yōu)化,引物設(shè)計存在問題,可試用三步法進(jìn)行反應(yīng),也可適當(dāng)降低退火溫度等;
PCR產(chǎn)物太長:一般采用80-150bp的產(chǎn)物長度。
3) 標(biāo)準(zhǔn)曲線線性關(guān)系不佳
a. 加樣存在誤差:使得標(biāo)準(zhǔn)品不呈梯度;RNA模板推薦使用1×TE緩沖液(Cat #60143ES)進(jìn)行梯度稀釋,DNA模板推薦使用ddH2O稀釋;
b. 標(biāo)準(zhǔn)品出現(xiàn)降解:應(yīng)避免標(biāo)準(zhǔn)品反復(fù)凍融,或重新制備并稀釋標(biāo)準(zhǔn)品;
c. 引物設(shè)計不佳:重新設(shè)計引物;
d. 模板中存在抑制物,或模板濃度過高。
4) NTC有擴增(Ct<32)
a. 引物設(shè)計不夠優(yōu)化:應(yīng)避免引物二聚體和發(fā)夾結(jié)構(gòu)的出現(xiàn);
b. 引物濃度不佳:適當(dāng)降低引物的濃度,并注意上下游引物的濃度配比;
c. 氣溶膠污染:擴增產(chǎn)物泄露很容易在實驗室中引發(fā)氣溶膠污染,一旦污染,定量檢測結(jié)果就會不準(zhǔn)確。推薦使用DNA/RNA Remover 核酸氣溶膠污染清除劑(Cat #19702ES)。
注意事項
1. 本產(chǎn)品僅作科研用途。
2. 為了您的安全和健康,請穿實驗服并佩戴一次性手套操作。
3. 加樣和配液步驟都盡量在冰上操作。
4. 每個組分在使用前都應(yīng)震蕩混勻,低速離心。