全稱Single Nucleotide Polymorphisms，是指在基因組上單個核苷酸的變異，包括轉(zhuǎn)換、顛換、缺失和插入，形成的遺傳標記，其數(shù)量很多，多態(tài)性豐富。從理論上來看每一個SNP 位點都可以有4 種不同的變異形式,但實際上發(fā)生的只有兩種，即轉(zhuǎn)換和顛換,二者之比為2:1。SNP 在CG序列上出現(xiàn)為頻繁，而且多是C轉(zhuǎn)換為T ,原因是CG中的胞嘧啶常被甲基化,而后自發(fā)地脫氨成為胸腺嘧啶。

一般而言,SNP 是指變異頻率大于1 %的單核苷酸變異。在人類基因組中大概每1000 個堿基就有一個SNP ,人類基因組上的SNP 總量大概是3 ×10^6 個 。因此,SNP成為第三代遺傳標志,人體許多表型差異、對藥物或疾病的易感性等等都可能與SNP有關。

遺傳疾病診斷、致病候選基因研究、藥物篩選研究、分子標記輔助育種、群體遺傳研究等領域都會涉及到SNP分型分析。

SNP基因分型的常見方法有：

Taqman 探針法、SNaPshot法、飛行時間質(zhì)譜（MALDI-TOF MS）分型、HRM（高分辨率熔解曲線）分型等技術平臺。其中，基于時間飛行質(zhì)譜（MALDI-TOF）完成的SNP檢測準確率可達99.9%，除了準確性高、靈活性強、通量大、檢測周期短等優(yōu)勢外，有吸引力的應該還是它的性價比。飛行時間質(zhì)譜平臺（MALDI-TOF）是通用的基因單核苷酸多態(tài)性（SNP）的研究平臺，該方法憑借其科學性和準確性已經(jīng)成為該領域的新標準。

為此，我們推薦使用Solis BioDyne，增強摻入非常規(guī)核苷酸效率的TERMIPol ® DNA聚合酶，適合用于MALDI-TOF質(zhì)譜法和其他引物延伸平臺：

       * 如上TERMIPol DNA聚合酶產(chǎn)品均已通過了Bruker與 Agena BioScience平臺的驗證

以Agena 平臺為例：《MassARRA系統(tǒng)》

原理：首先通過PCR擴增出含有SNP位點的一段DNA（SNP位點前后各50bp左右），然后用SAP酶去除掉PCR 體系中剩余的脫氧核糖核苷三磷酸（dNTP）和引物，然后加入一單堿基延伸引物，其3’末端堿基緊挨SNP位點，采用四種ddNTP替代dNTP。這樣，探針在SNP位點處僅延伸一個堿基，連接上的ddNTP與SNP位點的等位基因?qū)?。用基質(zhì)輔助激光解析電離飛行時間質(zhì)譜(MALDI-TOF MS) 檢測延伸產(chǎn)物與未延伸引物間的分子量差異，確定該點處堿基。

實驗流程如下：

1.PCR擴增含有目的SNP 的DNA序列，并通過純化去除未結(jié)合的dNTPs

2.iPLEX單堿基延伸：純化后的PCR產(chǎn)物，針對每個靶點SNP設計一條延伸引物，在以ddNTPs為底物的體系中進行單堿基延伸，每個SNP的等位基因延伸產(chǎn)物僅為末端一個堿基的差異。

3.純化，并將產(chǎn)物轉(zhuǎn)移到SpectroCHIP芯片上，進行質(zhì)譜檢測，同一個SNP的等位基因由于分子量不同，形成不同的檢測峰而被區(qū)分。  

Solis BioDyne的TERMIPol® DNA Polymerase將會用于上圖中的單核苷酸延伸中

已發(fā)表文章：  

【1】Bormann, Felix Georg et al. “Epigenetic regulation of Amphiregulin and Epiregulin in colorectal cancer.” International journal of cancer 144 3 (2019): 569-581 .

【2】Wilcke, Arndt et al. “The role of gene DCDC2 in German dyslexics.” Annals of dyslexia59 1 (2009): 1-11 .

【3】Ikryannikova, L N et al. “A MALDI TOF MS-based minisequencing method for rapid detection of TEM-type extended-spectrum beta-lactamases in clinical strains of Enterobacteriaceae.” Journal of microbiological methods 75 3 (2008): 385-91 . 【4】Sauer, Sascha et al. “Single-nucleotide polymorphisms: analysis by mass spectrometry.” Nature Protocols 1 (2006): 1761-1771.

 除了上述的的分子診斷神器，Solis BioDyne為客戶提供終點PCR（end-point PCR），qPCR（real-time PCR），反轉(zhuǎn)錄PCR（Reverse transcription），以及其它PCR所需的配套試劑。產(chǎn)品線縱覽圖如下：  

 Solis BioDyne來源于歐盟-愛沙尼亞共和國，自1995年以來，Solis BioDyne一直致力于開發(fā)和生產(chǎn)高品質(zhì)的生命科學試劑，現(xiàn)已成為當今歐洲的試劑供應商之一。高標準的生產(chǎn)標準和服務使Solis BioDyne成為值得信賴的shouxuanPCR供應商。我們的DNA聚合酶，PCR Master Mixes，qPCR Mixes和其它試劑被110多個國家的研究者所使用，包括dingji研究機構和生物技術公司。

擁有dujia的蛋白質(zhì)穩(wěn)定技術zhuanli，確保其PCR酶與PCR Mixes產(chǎn)品具有*的穩(wěn)定性，研究者可以常溫運輸以及常溫下配置PCR反應體系（無需冰盒）。即使是室溫放置30天，其酶活性也沒有損耗。   作為Solis BioDyne在中國的區(qū)域總代理，艾美捷科技有限公司將為中國客戶提供全面的Solis BioDyne產(chǎn)品以及訂制服務。  

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