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當(dāng)前位置:武漢艾美捷科技有限公司>>技術(shù)文章>>高分辨率熔解曲線(HRM)分析預(yù)混Mix(PCR),*敏感性!
高分辨率熔解曲線(high-resolution melting,HRM)是一種基于單核苷酸熔解溫度不同而形成不同形態(tài)熔解曲線的基因分析新技術(shù),具有*的敏感性,可以檢測(cè)出單個(gè)堿基的差異。
作為一種穩(wěn)健的"post-PCR"技術(shù),它不受突變堿基位置與類型的限制,無(wú)需序列特異性探針,在PCR結(jié)束后直接運(yùn)行高分辨熔解即可完成對(duì)樣品的分析。HRM技術(shù)因操作簡(jiǎn)便快捷、成本低廉、結(jié)果準(zhǔn)確,并且實(shí)現(xiàn)了真正的閉管操作而受到普遍關(guān)注。
HRM原理:
在PCR反應(yīng)前將新型DNA飽和熒光染料加入反應(yīng)體系,然后將PCR產(chǎn)物直接導(dǎo)入高分辨熔解分析儀中,在一定的溫度范圍內(nèi)將PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行加熱變性,儀器的光學(xué)檢測(cè)系統(tǒng)采集、分析熒光信號(hào)并繪制溫度熔解曲線,根據(jù)不同熔解曲線形狀來(lái)區(qū)分(單個(gè))堿基差異。
廣泛的 HRM 分析應(yīng)用領(lǐng)域是基因篩查?;蚝Y查是搜索 PCR 擴(kuò)增片段中是否存在未知變異,它可在測(cè)序步驟之前進(jìn)行或者作為替代測(cè)序方法。由于 PCR 產(chǎn)物突變可導(dǎo)致 DNA 熔解曲線的形狀改變,因此它可以利用 HRM分析檢測(cè)。雜交雙鏈 DNA 樣本擴(kuò)增并熔解時(shí),其熔解曲線不同于純合野生型或突變樣本。如果操作得當(dāng),可以減少至少95%的測(cè)序工作量。隨著DNA染料和分析儀器的發(fā)展,HRM技術(shù)還將繼續(xù)完善和改進(jìn),在遺傳病分子診斷領(lǐng)域發(fā)揮更多的作用。
HRM應(yīng)用:
• 基因篩查 (突變研究) | • 雜合性研究 |
• 突變分析 | • 物種鑒定 |
• 單核苷酸多態(tài)性 (SNP) 檢測(cè) | • 甲基化分析 |
作為專注于PCR領(lǐng)域超過(guò)24年的高品質(zhì)試劑供應(yīng)商,Solis BioDyne為您推薦,5X熱啟動(dòng)EvaGreen高分辨率熔解曲線分析-預(yù)混Mix(PCR):
名稱 | 貨號(hào) | 兼容的PCR儀器 |
5x HOT FIREPol EvaGreen HRM Mix (NO ROX) | 08-31-00001 | Bio-Rad: CFX96™ & CFX384™ |
* 不含參比染料ROX,如需要含ROX,請(qǐng)選擇:08-33-00001
5X熱啟動(dòng)EvaGreen高分辨率熔解曲線分析-預(yù)混Mix(PCR)提供如下組分:
(客戶僅需準(zhǔn)備水,模板DNA,引物即可) |
*的性價(jià)比(進(jìn)口品質(zhì),國(guó)產(chǎn)價(jià)格):
Solis BioDyne | 08-31-00001 | 1ml(250次) | 386 | 1.54 |
Thermo | 4415452 | 5*5ml(2500次) | 18856 | 7.54 |
Qiagen | 206546 | 25ml(2000次) | 21810 | 10.9 |
DBI | DBI-2232 | 1000次 | 11000 | 11 |
天根(Tiangen) | FP210-02 | 500次 | 2480 | 4.96 |
宇恒生物(UE) | S2013 | 500次 | 2300 | 4.6 |
推薦的qPCR反應(yīng)體系配置:
5x HOT FIREPol® EvaGreen® HRM Mix | 4 µl | 1x |
正向引物 (10 pmol/µl) | 0.16-0.5 µl | 80-250 nM |
反向引物 (10 pmol/µl) | 0.16-0.5 µl | 80-250 nM |
DNA模板 | 可變 | 可變 |
H2O(PCR級(jí)) | up to 20 µl |
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Total | 20 µl |
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* DNA模板濃度:cDNA 0.1 pg/μl -10 ng/μl ; gDNA 10 pg/μl – 4 ng/μl
推薦的qPCR反應(yīng)程序:
起始激活(熱啟動(dòng)) | 95ºC | 12 min | 1 |
變性 | 95ºC | 15 s | 40 |
退火 | 60º-65ºC | 20 s | |
延伸 | 72ºC | 20 s |
發(fā)表文章實(shí)驗(yàn)結(jié)果展示:
【1】Negrisolo, Susanna et al. “Could the interaction between LMX1B and PAX2 influence the severity of renal symptoms?” European Journal of Human Genetics 26 (2018): 1708-1712.
使用Solis試劑盒,分析PAX2基因4號(hào)外顯子的錯(cuò)義突變
【2】Gaczkowska, Agnieszka, et al. “Association of CDKAL1 Nucleotide Variants with the Risk of Non-Syndromic Cleft Lip with or without Cleft Palate.” Journal of Human Genetics, vol. 63, no. 4, 2018, pp. 397–406.
使用Solis試劑盒,分析CDKAL1基因SNP
HRM分析成功的關(guān)鍵:
1.保持較短的擴(kuò)增片段,實(shí)現(xiàn)高的靈敏度。與較大的擴(kuò)增片段相比,100 bp 左右的擴(kuò)增片段可簡(jiǎn)化單核苷酸熔解曲線的檢測(cè)。
2.確保 PCR 擴(kuò)增片段的特異性。錯(cuò)配產(chǎn)物和引物二聚體可使數(shù)據(jù)解釋復(fù)雜化。引物濃度低于 200nM,MgCl2 在 1.5 mM至3 mM 范圍及使用熱啟動(dòng)DNA 聚合酶將有助于獲得高特異性。
3.確保反應(yīng)使用足夠的模板。一般而言,Ct 應(yīng)低于30,以生成足夠的材料,實(shí)現(xiàn)準(zhǔn)確的熔解分析。
除了上述的穩(wěn)健的HRM分析預(yù)混Mix產(chǎn)品,Solis BioDyne為客戶提供終點(diǎn)PCR(end-point PCR),qPCR(real-time PCR),反轉(zhuǎn)錄PCR(Reverse transcription),以及其它PCR所需的配套試劑。產(chǎn)品線縱覽圖如下:
Solis BioDyne來(lái)源于歐盟-愛(ài)沙尼亞共和國(guó),專注PCR領(lǐng)域超過(guò)24年,Solis BioDyne一直致力于開(kāi)發(fā)和生產(chǎn)高品質(zhì)的生命科學(xué)試劑,現(xiàn)已成為當(dāng)今歐洲領(lǐng)xian的試劑供應(yīng)商之一。高標(biāo)準(zhǔn)的生產(chǎn)標(biāo)準(zhǔn)和服務(wù)使Solis BioDyne成為值得信賴的首xuanPCR供應(yīng)商。我們的DNA聚合酶,PCR Master Mixes,qPCR Mixes和其它試劑被110多個(gè)國(guó)家的研究者所使用,包括頂ji研究機(jī)構(gòu)和生物技術(shù)公司。
Solis BioDyne擁有獨(dú)jia的蛋白質(zhì)穩(wěn)定技術(shù)專li,確保其PCR酶與PCR Mixes產(chǎn)品具有*的穩(wěn)定性,研究者可以常溫運(yùn)輸以及常溫下配置PCR反應(yīng)體系(無(wú)需冰盒)。即使是室溫放置30天,其酶活性也沒(méi)有損耗。
作為Solis BioDyne在中國(guó)的區(qū)域總代理,艾美捷科技有限公司將為中國(guó)客戶提供全面的Solis BioDyne產(chǎn)品以及訂制服務(wù)。
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