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盡管FITC仍然是制備綠色熒光生物復合物zui常用的熒光標記染料,但是FITC也存在一定的局限性,如顯微鏡成像的嚴重光漂白和pH敏感熒光。用iFluor制備蛋白質(zhì)結(jié)合物™ 488染料遠遠優(yōu)于熒光素衍生物的共軛物,如FITC。iFluor 488共軛物明顯比熒光素共軛物更亮,并且更容易光照。
另外,iFluor的熒光™ 488不受pH(4-10)的影響。這種pH不敏感是對熒光素的一個重大改進,熒光素只有在pH高于9時才會發(fā)出zui大的熒光™ 488se染料穩(wěn)定,與蛋白質(zhì)氨基具有良好的反應性和選擇性。這個iFluor™ 488具有與Alexa Fluor®488 NHS酯類似的光譜性質(zhì)和反應活性(Alexa Fluor®是Invitrogen的商標)。
名稱 | iFluor 488琥珀酰SE |
Cat# | AAT-1023 |
描述 | iFluor 488琥珀酰SE產(chǎn)品的光譜學相關(guān)參數(shù)為Ex=491/ Em=514;其對應分子量大小為1513。82。 |
形式 | 為固體形式,建議將其溶解到DMSO溶液中使用或保存。 |
保存建議 | 推薦使用常溫進行運輸。建議在低于-15℃溫度下冷凍保存,要求儲存環(huán)境干燥并避免光照。 |
來源 | 艾美捷 |
一、儲備溶液的制備
除非另有說明,否則所有未使用的儲備溶液應分為一次性等份,并在制備后在-20°C下儲存。避免反復凍融循環(huán)。
1.蛋白質(zhì)原液(溶液A)
將100µL反應緩沖液(例如,1 M碳酸鈉溶液或pH~9.0的1 M磷酸鹽緩沖液)與900µL目標蛋白質(zhì)溶液(例如,抗體,蛋白質(zhì)濃度>2 mg/mL,如果可能)混合,得到1 mL蛋白質(zhì)標記儲備溶液。
注:
1)蛋白質(zhì)溶液(溶液A)的pH值應為8.5±0.5。如果蛋白質(zhì)溶液的pH值低于8.0,則使用1 M碳酸氫鈉溶液或1 M pH 9.0磷酸鹽緩沖液將pH值調(diào)節(jié)至8.0-9.0。
2)蛋白質(zhì)應溶解在1X磷酸鹽緩沖鹽水(PBS)中,pH值為7.2-7.4。如果蛋白質(zhì)溶解在Tris或甘氨酸緩沖液中,則必須針對1X PBS(pH 7.2-7.4)進行透析,以去除廣泛用于蛋白質(zhì)沉淀的游離胺或銨鹽(例如硫酸銨和醋酸銨)。
3)不純抗體或用牛血清白蛋白(BSA)或明膠穩(wěn)定的抗體將不能很好地標記。疊丨氮丨化丨鈉或硫柳汞的存在也可能干擾共軛反應。疊丨氮丨化丨鈉或硫柳汞可通過透析或旋轉(zhuǎn)柱去除,以獲得zui佳的標記結(jié)果。
4)如果蛋白質(zhì)濃度小于2 mg/mL,則接合效率會顯著降低。為獲得zui佳標記效率,建議zui終蛋白質(zhì)濃度范圍為2-10 mg/mL。
2.熒光燈™ 488硒儲備液(溶液B)
將無水二甲基亞砜加入iFluor瓶中™ 350 SE制成10 mM儲備溶液。用移液管或旋渦攪拌均勻。
注:開始接合前,制備染料儲備溶液(溶液B)。及時使用。染料原液的長期儲存可能會降低染料的活性。溶液B在避光防潮的情況下,可在冰箱中保存兩周。避免凍融循環(huán)。
二、樣本實驗方案
該標記方案是針對山羊抗鼠IgG與iFluor的結(jié)合物而建立的™ 350東南。你可能需要進一步優(yōu)化你的特定蛋白質(zhì)。
注:每種蛋白質(zhì)都需要不同的染料/蛋白質(zhì)比率,這也取決于染料的性質(zhì)。蛋白質(zhì)的過度標記會有害地影響其結(jié)合親和力,而低染料/蛋白質(zhì)比率的蛋白質(zhì)結(jié)合物會降低靈敏度。
運行共軛反應
1.以溶液B(染料)/溶液A(蛋白質(zhì))的摩爾比為10:1為起點:將5µL染料儲備液(溶液B,假設染料儲備液為10 mM)加入蛋白溶液(95µL溶液A)小瓶中,有效搖勻。假設蛋白質(zhì)濃度為10mg/mL且蛋白質(zhì)的分子量為200KD,則蛋白質(zhì)的濃度約為0.05mm。
注:我們建議使用10:1摩爾比的溶液B(染料)/溶液A(蛋白質(zhì))。如果太少或太高,確定zui佳染料/蛋白質(zhì)比分別為5:1、15:1和20:1。
2.在室溫下繼續(xù)旋轉(zhuǎn)或搖動反應混合物30-60分鐘。
純化結(jié)合物
1.以下方案是使用Sephadex G-25柱純化染料-蛋白質(zhì)結(jié)合物的實例。
2.按照生產(chǎn)說明書制備葡聚糖凝膠G-25柱。
3.將反應混合物(從“運行共軛反應")裝入Sephadex G-25柱頂部。
4.一旦樣品剛好在樹脂頂面以下,立即添加PBS(pH 7.2-7.4)。
向所需樣品中添加更多PBS(pH 7.2-7.4)以完成柱純化。合并含有所需染料-蛋白質(zhì)結(jié)合物的部分。
注:
1)為了立即使用,染色蛋白結(jié)合物需要用染色緩沖液稀釋,并等分多次使用。
2)為了長期儲存,染料-蛋白質(zhì)結(jié)合物溶液需要濃縮或冷凍干燥。
三、示例數(shù)據(jù)分析和圖表
表征所需的染料-蛋白質(zhì)結(jié)合物
取代度(DOS)是表征染料標記蛋白質(zhì)的zui重要因素。DOS較低的蛋白質(zhì)通常具有較弱的熒光強度,但DOS較高的蛋白質(zhì)(如DOS>6)也傾向于降低熒光強度。大多數(shù)抗體的zui佳DOS推薦在2到10之間,這取決于染料和蛋白質(zhì)的性質(zhì)。為了有效的標記,取代度應控制在6-8摩爾iFluor™ 350硒相當于一摩爾抗體。以下步驟用于確定iFluor的DOS™ 350硒標記蛋白。
測量吸收率
為了測量染料-蛋白質(zhì)結(jié)合物的吸收光譜,建議根據(jù)染料的消光系數(shù)將樣品濃度保持在1-10µM的范圍內(nèi)。
讀取280 nm處的OD(吸光度)和染料zui大吸收(對于iFluor,?max=450 nm)™ 350種染料)
對于大多數(shù)分光光度計,樣品(來自色譜柱部分)需要用去離子水稀釋,以便OD值在0.1到0.9的范圍內(nèi)。280nm處的吸光度是蛋白質(zhì)的zui大吸收,450nm是熒光的zui大吸收™ 350東南。為了獲得準確的DOS,確保共軛物中沒有非共軛染料。
計算DOS
Figure 1.HeLa細胞與(微管蛋白+)或不與(微管蛋白-)小鼠抗微管蛋白一起孵育,然后用iFluor™ 488山羊抗鼠IgG結(jié)合物(綠色,左側(cè))或Alexa Fluor®488山羊抗鼠IgG結(jié)合物(綠色,右側(cè))。細胞核用hoechst33342(藍色)染色。
美國AAT Bioquest Inc。(前身是ABD Bioquest,Inc。)是一家為從事生命科學研究、診斷研發(fā)及藥物開發(fā)的科學家研發(fā)、生產(chǎn)和銷售生物分析研究試劑和試劑盒的公司。公司致力于光譜學檢測領(lǐng)域,包括顯色、熒光和生物發(fā)光技術(shù)。AAT Bioquest的產(chǎn)品幫助科學家和生物醫(yī)藥研究者更好的了解生物化學,免疫學,細胞生物學和分子生物學等領(lǐng)域。作為AAT Bioquest Inc。的中國區(qū)域代理,艾美捷科技為中國客戶提供光譜學檢測技術(shù)并應用于生化、生理代謝和細胞分析領(lǐng)域的產(chǎn)品,包括顯色,熒光和發(fā)光技術(shù)等全系列解決方案。
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