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土壤DNA提取,這些你不得不懂的操作流程

時間:2021/8/12閱讀:1850
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土壤中的微生物資源非常豐富,原核生物細胞含量大約1×10^7個/g,但用傳統(tǒng)技術培養(yǎng)的微生物僅占微生物總數(shù)的0.01~10%,且大部分微生物處于不可培養(yǎng)的狀態(tài),使相當多的菌種不能被充分地開發(fā)和利用。

 

由于土壤微生物成分復雜,常規(guī)提取總DNA的方法難以去除腐殖酸,而微量的腐殖酸便可抑制PCR擴增中的TaqDNA聚合酶以及酶切反應的限制性內(nèi)切酶活性。另外,土壤質地和成分的差異也會影響土壤微生物DNA的提取效果.

 

國內(nèi)外學者對不同的土壤DNA提取和純化方法進行了比較研究,現(xiàn)行土壤微生物基因組DNA提取方法可分為直接法和間接法2類,直接法采用原位裂解土壤微生物提取DNA(一般采用直接法),間接法采用速差離心回收菌體,裂解菌體提取DNA.間接法會大大降低土壤中腐殖酸,重金屬鹽對DNA提取帶來的影響,但是這種方法會丟失許多微生物,得到的DNA并非土壤樣品中的全基因組(宏基因組)。

 

如何從土壤樣本中提取純化DNA?艾美捷土壤DNA提取純化試劑盒或許可以幫你解決這個難題。

 

艾美捷土壤DNA提取試劑盒特點如下:

1.快速簡便的土壤樣品中微生物檢測方法;

2.處理所有土壤類型,包括常見的土壤樣品和腐植酸含量高的難處理的土壤樣品,如堆肥和糞肥;

3.使用OSROrganic Substance Removal)溶液去除有機物質;

4.從DNA樣本中去除所有腐殖酸;

5.使用快速離心柱形式進行快速簡便的處理;

6.從包括細菌、真菌和藻類在內(nèi)的各種微生物中分離出高質量的總DNA;

7.純化的DNA質量很高,*兼容下游PCR應用,因為在分離過程中去除了腐殖酸物質和PCR抑制劑。

 

艾美捷土壤DNA提取試劑盒樣品使用量與DNA產(chǎn)出數(shù)據(jù)參考:

 

土壤zui大上樣量

250mg

處理的土壤類型

所有土壤類型

純化柱zui大結合載量

50 ug

純化柱-zui大液體輸入體積

650 uL

10個樣品的純化時間

30 minutes

 

艾美捷土壤DNA提取試劑盒操作流程圖:

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來源:艾美捷


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