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艾美捷CUT&Tag技術:信噪比高,重復性好
  • 艾美捷CUT&Tag技術:信噪比高,重復性好

貨物所在地:湖北武漢市

更新時間:2024-06-08 21:00:07

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CUT&Tag In-Place-Sequencing,用于快速富集與蛋白質(zhì)結(jié)合的DNA,并繪制全基因組蛋白質(zhì)/DNA相互作用圖。具有“兩高一低"的優(yōu)勢:高分辨、高時效以及低輸入。

CUT&Tag是蛋白質(zhì)-DNA互作關系研究的新方法,2019年弗雷德哈欽森癌癥研究中心的Henikoff博士在Nature Communication公開了該技術的詳細結(jié)果與實驗方案。與以往的ChIP-SeqpA-MNase等方法相比,這種技術方法簡便易行,信噪比高,重復性好,需要的細胞數(shù)量少至60個細胞,且有望將ChIP-Seq做到單細胞水平。

 

開發(fā)的技術,使用核酸酶在靶標下切割和釋放(CUT&RUN-sequencing)以及在靶標下切割和標記(CUT&Tag-sequencing),用于從低輸入材料來繪制蛋白質(zhì)-DNA相互作用,并顯著提高了映射分辨率。然而,這兩種技術的成本都較高。CUT&RUN-sequencing使用昂貴的 pA/MNase融合蛋白,該蛋白具有顯著的A/T序列偏差,導致目標蛋白結(jié)合的DNA 區(qū)域譜受到MNase消化水平的嚴重影響。CUT&Tag-sequencing顯示出相同的消化偏差,并且由于Tn5轉(zhuǎn)座酶導致染色質(zhì)的脫靶可及性,因此特異性較低。

 

為解決這些問題,EpiGentek開發(fā)了兩種新技術—CUT&RUN FastCUT&Tag In-Place-Sequencing,用于快速富集與蛋白質(zhì)結(jié)合的DNA,并繪制全基因組蛋白質(zhì)/DNA相互作用圖。新技術具有“兩高一低"的優(yōu)勢:高分辨、高時效以及低輸入。

 

艾美捷 EpiGente CUT&RUN和CUT&Tag技術來了。特別是 EpiQuik CUT&RUN M6A RNA富集試劑盒(P-9018)和EpiNext CUT&RUN M6A RNA-Seq試劑盒(P-9016),可以在zui小的非特異性背景水平上,從低輸入RNA樣本中特異性捕獲和富集含有m6A修飾的RNA片段。富集的 RNA 特別適用于快速構建非條形碼(單重)和條形碼(多重)文庫,允許以更小的偏差和高分辨率繪制 m6A 區(qū)域。

 

結(jié)果展示:

艾美捷 CUT&Tag技術 相關研究工具:

cat# 名稱   時長

P-2028 EpiNext CUT&RUN Fast Kit  <3小時

P-9018 EpiQuik CUT&RUN m6A RNA Enrichment (MeRIP) Kit  <3小時


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