上海單細胞分離日趨火爆的原因有哪些?
上海單細胞分離從異質(zhì)性的細胞群體中分離單細胞,目前主要有三種選擇:手動分離、熒光激活細胞分選和微流體技術(shù)。當然,除了成熟的方法,巧妙的新方法也在不斷涌現(xiàn),能以更高的準確性和特異性來分離單細胞。
如果你想要的細胞已經(jīng)處于懸浮狀態(tài)(比如循環(huán)腫瘤細胞),而且含量相對比較豐富,那么流式分選將是你的理想選擇。如果樣本是實體組織,我們可以用酶分解掉膠原和其他細胞外蛋白。不過,酶學消化對細胞影響較大,甚至可能改變基因轉(zhuǎn)錄情況。把組織細胞制備成懸液之后,我們就可以通過特異性的熒光標簽分離出自己想要的細胞。進一步拿到單細胞是比較棘手的一步,也許要借助微流體設(shè)備。
將細胞分散到懸液中,會失去它們在組織里的位置信息。如果你想了解單細胞所處的環(huán)境和它們以前的鄰居,就需要用到激光捕獲顯微切割技術(shù)。這種技術(shù)通過掃描組織切片來定位感興趣的細胞,并將其提取出來。操作者需要非常小心,以免切到細胞或細胞核。數(shù)量極為稀少的細胞只能用毛細管等器具手動獲取。
上海單細胞分離優(yōu)點:1. 細胞表面標志物的特異標記。2. 多個同時存在的標記可確保特定細胞的分離。3. 可將細胞分選至96孔或384孔板,純度接近100%
單細胞測序日趨火爆的原因很大程度上得益于單細胞分離技術(shù)的不斷完善。利用激光顯微切割儀,操作者可以將組織內(nèi)單一細胞或細胞群切割下來進行研究,避免間質(zhì)細胞及一些炎癥細胞造成背景“污染”,可以了解到細胞的位置信息。但該方法相鄰細胞容易污染,另外在組織固定及激光切割的過程中可能會破壞細胞的完整性,對細胞核酸損傷較大,從而影響后續(xù)的遺傳物質(zhì)的擴增。