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Precellys Evolution—蛋白質(zhì)樣本制備理想方案

閱讀:1563        發(fā)布時間:2020-11-2

 

蛋白質(zhì)是生命的基石,它們幾乎在地球的每一種生物中都能被找到,對我們的生存很重要。一些蛋白質(zhì)例如抗體、酶、激素等會參與化學(xué)反應(yīng)免疫過程以及細(xì)胞活動。蛋白質(zhì)還在運(yùn)動、結(jié)構(gòu)支持、存儲能量、細(xì)胞消化、底物運(yùn)輸?shù)确矫嫫鹱饔?。蛋白質(zhì)由長鏈氨基酸組成,形成多種多樣,不同形狀大小的蛋白質(zhì)。蛋白質(zhì)因為其不同的長鏈氨基酸組成,每一種類型都有穩(wěn)定特別的三維結(jié)構(gòu)。這種特殊的結(jié)構(gòu)是至關(guān)重要的,每一個形狀的改變都會引起蛋白質(zhì)功能的變化。所以說像蛋白質(zhì)這種對熱敏感的分子,在分子下游分析過程之前的樣品制備就顯得格外重要。Precellys Evolution結(jié)合Cryolys Evolution冷卻系統(tǒng)能夠有效的在研磨過程中使研磨腔室溫度穩(wěn)定保持在4℃。

 

使用Precellys提高組織蛋白質(zhì)的提取量

 

APPNOTE 1:從大鼠皮膚組織提取蛋白質(zhì)沉淀和脂肪

APPNOTE 2:使用Minilys從小鼠心臟組織從提取蛋白質(zhì)

Protocol 1:大體積大腸桿菌中提取蛋白質(zhì)

Protocol 2: 96通道眼睛組織中提取蛋白質(zhì)

 

APPNOTE 1

從*勻質(zhì)的大鼠皮膚組織中提取蛋白質(zhì)沉淀和脂肪

 

本應(yīng)用中研究了從大鼠皮膚組織中提取蛋白質(zhì)沉淀和有生物活性的脂肪。本應(yīng)用中利用固相萃取與液相色譜質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)(LC-MS/MS)來測組織中脂肪含量。大鼠皮膚組織使用Precellys Evolution生物樣品研磨器和Cryolys冷卻系統(tǒng)進(jìn)行研磨,配合7mlCKMix50_研磨管。此外還測試了在大鼠組織整個研磨的過程結(jié)束后,樣本溫度都在40℃以下。

 

實驗材料

自動研磨器:Precellys Evolution生物樣品研磨器和Cryolys冷卻系統(tǒng);

研磨管:CKMix50_7ml(Cat #: KT03961-1-306.7);

組織樣本:大鼠皮膚組織(后足背側(cè)和腹側(cè));

干冰;

Buffer:甲醇。

 

實驗方法

20-90mg成年大鼠皮膚組織(后足背側(cè)和腹側(cè)),7ml研磨管加2.8mm和5.0mm陶瓷珠,500µL甲醇;轉(zhuǎn)速8000rpm,5個循環(huán),每個循環(huán)10s,循環(huán)之間間歇120s;Cryolys冷卻系統(tǒng)將腔室內(nèi)溫度降至5℃時開始研磨;研磨結(jié)束之后立即使用溫度探針檢測樣本管內(nèi)的溫度。

 

實驗結(jié)果

如下圖1、2所示,圖1中a、b分別為研磨前與研磨后效果對比,結(jié)果顯示皮膚樣本被充分研磨;圖2為樣本被勻質(zhì)后經(jīng)過固相萃取,用LC-MS/MS技術(shù)檢測,成功檢測到花生四烯酸,5-HETE、8-HETE、9-HETE的濃度分別為1.3 ±0.3、7.9±0.6和1.3 ± 0.4 ng/mg。

 

 

 

 

實驗結(jié)論

大鼠的后爪皮膚比背部皮膚厚,因此獲得其完整勻質(zhì)的難度更大,使用Precellys Evolution生物樣品研磨器,結(jié)合Precellys裂解試劑盒成功研磨大鼠后爪皮膚組織。本應(yīng)用同樣也展示了Cryolys冷卻系統(tǒng)能夠保證樣本溫度在40℃以下。

 

APPNOTE 2

使用Minilys從小鼠心臟組織中提取蛋白質(zhì)

 

開曼化學(xué)研究和生產(chǎn)抗體,為了營造更好的研究市場。為了保證質(zhì)量,需要合適的組織裂解產(chǎn)物來確保我們的產(chǎn)品達(dá)到或者超過我們質(zhì)量控制的標(biāo)準(zhǔn)。我們很多目標(biāo)蛋白都是多通道跨膜受體,因此需要一個非常強(qiáng)力的裂解系統(tǒng)。

 

實驗材料

Minilys生物樣品研磨器;CKMix 2mL (KT03961-1-009.2)研磨管;920mg小鼠心臟組織;裂解Buffer:920µL M-PER (Mammalian Protein Extraction Reagent, Pierce)。

 

實驗方法

Minilys研磨參數(shù):研磨速率5000rpm;4個循環(huán),每個循環(huán)20s,循環(huán)之間間歇5s;

分析方法:使用Minilys研磨樣本之后,從中提取細(xì)胞質(zhì)和膜蛋白;HEK 293細(xì)胞(S1P3轉(zhuǎn)染和未轉(zhuǎn)染)在細(xì)胞培養(yǎng)板上培養(yǎng),隨后提取蛋白質(zhì);所有的蛋白通過BCA法測定,溶菌產(chǎn)物通過Western Blot分析。

 

結(jié)果如圖所示:圖1為使用S1P3多克隆抗體;一列為3µLMark,第二列為2.5μgS1P3轉(zhuǎn)染過的HEK293細(xì)胞裂解產(chǎn)物,第三列為5μgS1P3轉(zhuǎn)染過的HEK293細(xì)胞裂解產(chǎn)物,第4列為50μg小鼠心臟膜蛋白裂解產(chǎn)物。結(jié)果顯示均有很好的條帶,研磨提取效果好。圖2為使用一種視神經(jīng)多克隆抗體(C-Terminal);一列為3µLMark,第二列為60μgHEK293細(xì)胞裂解產(chǎn)物,第三列為40μgHEK293細(xì)胞裂解產(chǎn)物,第四列為50μg小鼠心臟細(xì)胞質(zhì)裂解產(chǎn)物,第五列為小鼠心臟膜蛋白裂解產(chǎn)物,結(jié)果顯示均有很好條帶,研磨提取效果好。

 

實驗結(jié)論

Minilys生物樣品研磨器結(jié)構(gòu)緊湊,使用方便,Minilys提供了更純凈、更濃縮的裂解產(chǎn)物,對目標(biāo)蛋白分析有很高的重復(fù)性。Minilys可同時研磨3個樣本,可用2ml或0.5ml研磨管,是低通量實驗的理想選擇。

 

Protocol 1

大體積大腸桿菌中提取蛋白質(zhì)方案

 

 

研磨管:7ml VKMix_或15mlVK05_

樣本量:5ml或10ml(OD600下為50)

研磨參數(shù):7ml:轉(zhuǎn)速9000rpm,6個循環(huán),每個循環(huán)30s,循環(huán)間歇60s;15ml:轉(zhuǎn)速9900rpm,6個循環(huán),每個循環(huán)60s,循環(huán)間歇60s

 

Protocol 2

96通道從眼組織中提取蛋白質(zhì)

 

 

 

研磨管:CKMix_WP

樣本:視網(wǎng)膜神經(jīng)或眼杯

Buffer:50µL M-PER

研磨參數(shù):視網(wǎng)膜:轉(zhuǎn)速5500rpm,3個循環(huán),每個循環(huán)30s,循環(huán)間歇30s;眼杯:轉(zhuǎn)速8200rpm,3個循環(huán),每個循環(huán)30s,循環(huán)間歇30s。

 

 

Precellys生物樣品研磨器:

超快速: up to 10 000 rpm

超靈活: 0.5, 2, 7和 15mL研磨管

超高效: 強(qiáng)力3D振動

超保護(hù): Cryolys Evolution新型冷卻技術(shù),無需液氮和壓縮空氣

 

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