材料與儀器
磷酸鹽緩沖溶液 硫氰酸胍溶液 CsCl TES 緩沖液 乙酸鈉緩沖液 無水乙醇 經(jīng) DEFC 處理的水。
離心機(jī) 注射器及20W針頭
步驟
一 材料與設(shè)備
1) 磷酸鹽緩沖溶液 (PBS)
2) 硫氰酸胍溶液:4mol/L 硫氰酸胍,0.lmmol/LTris-HClpH7.5,1%β-巰基乙醇
3)CsCl5.7mol/:L(DEPC 處理)
4)TES 緩沖液:0.1%SDS,10 mmol/LTris-ClpH7.4,lmmol/LEDTA
5)3 mmol/L 乙酸鈉緩沖液 (PH5.2,DEPC 處理)
6) 無水乙醇
7) 經(jīng) DEFC 處理的水
8) 離心機(jī)
9)6 ml 注射器及 20W 針頭
二 操作方法
1. 單層培養(yǎng)細(xì)胞
1) 室溫下用 PBS 洗滌細(xì)胞,每平皿 5 ml 洗滌 2 次。
2) 在不超過 105 個(gè)細(xì)胞中加人 3.5 ml 硫氰酸胍溶液,使之遍布整個(gè)平皿。用橡膠細(xì)胞刮于擦刮平皿,回收黏稠的細(xì)胞裂解液,用裝有 20-G 針頭的注射器往返抽吸裂解物,舍并在一起
2. 懸浮培養(yǎng)細(xì)胞
1) 離心回收≤l08 個(gè)細(xì)胞,用相當(dāng)于 1/2 原有體積的 PBS 重懸之,并再次離心回收細(xì)胞。
2) 往離心管中加人 3.5 ml 硫氰酸胍溶液。
3) 用裝有 20-G 針頭的 6 ml 注射器將黏稠的細(xì)胞裂解液往返抽吸 4 次,并將其移至一個(gè)干凈的試管中。本步驟的重要性在于可對染色體 DNA 進(jìn)行剪切,以降低溶液的黏度,
4) 在經(jīng)硅化井高壓過的 13 mmX51 mm 的超速離心管中,加人 1.5 ml 5.7mol/LCsCl 并在 CsCl 層加人 3.5 ml 細(xì)胞裂解液,界面應(yīng)保持清晰。1)?4) 步的操作均在室溫進(jìn)行。
5) 于 18℃,150000g 離心 12?20 h(緩慢加速和減速)
6) 用巴斯德吸管的管尖在液面上吸取上清,管子隨液面的下降而下降。當(dāng)吸至僅剩約 100 ul 時(shí),小心倒置管子, 倒出剩余液體在界面處應(yīng)有一白色的 DNA 帶,必須仔細(xì)地wan全移去此帶,因?yàn)樗腥旧w DNA。
7) 晾于沉淀約 5?lOmin,然后以 360ul TES 溶液重溶沉淀,反復(fù)用吸管上下抽吸,如此在室溫逬行 5?l0 min,轉(zhuǎn)移溶液于另一干凈的微量離心管。
8) 加人 40u 13 mol/L pH5.2 的乙酸鈉緩沖液和 1 ml 無水乙醇,在干冰/乙醇中沉淀 30mim,離心 10?15 min, 用 360 ul 水重溶沉淀并重復(fù)沉淀過程。
9) 沉淀晾干 l0 min, 溶解于 20ul 水中,取 10ul 稀釋至 lml,測 A260 和 A280. 最后,以水溶液或乙醇沉淀的形式在一 70℃ 儲存 RNA。
注意事項(xiàng)
1) 要用足夠的時(shí)間去重溶沉淀,否則 RNA 的產(chǎn)量會有顯著下降。
2) 小 RNA 在 CsCl 中離心時(shí)不能有效地沉淀,因此不能用此方法制備 5SRNA 和 tRNA 等分子。
3) 乙醇可以洗去沉淀中的氯化銫. 使沉淀易于溶解
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