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引物探針的使用方法有哪些?

閱讀:138      發(fā)布時(shí)間:2024-11-14
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一、引物探針的使用步驟?

引物探針使用步驟一:

?設(shè)計(jì)引物和探針?:首先需要根據(jù)目標(biāo)DNA序列設(shè)計(jì)特異性引物和探針。引物的長(zhǎng)度一般為20-25個(gè)核苷酸,探針的長(zhǎng)度一般為15-25個(gè)核苷酸。設(shè)計(jì)時(shí)要注意避免非特異性擴(kuò)增,確保引物的特異性和探針的Tm值比引物Tm值高8-10°C?

引物探針使用步驟二:

?提取模板DNA?:從待測(cè)樣本中提取DNA,作為PCR反應(yīng)的模板。確保模板DNA的質(zhì)量和濃度,以獲得可靠的實(shí)驗(yàn)結(jié)果?。

引物探針使用步驟三:

?配制PCR反應(yīng)體系?:根據(jù)實(shí)驗(yàn)需求,配制含有引物、探針、dNTPsDNA聚合酶等試劑的PCR反應(yīng)體系。調(diào)整各試劑的濃度和比例,確保反應(yīng)體系的準(zhǔn)確性?

引物探針使用步驟四:

?PCR擴(kuò)增?:將PCR反應(yīng)體系放入PCR儀中,進(jìn)行擴(kuò)增。一般包括以下步驟:94℃預(yù)變性5分鐘;94℃變性30秒,退火溫度(一般為55℃)退火30秒,72℃延伸30秒,進(jìn)行30-40個(gè)循環(huán);最后72℃延伸5分鐘?

引物探針使用步驟五:

?分析PCR產(chǎn)物?:將PCR產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,觀察擴(kuò)增條帶的大小和亮度,初步判斷實(shí)驗(yàn)結(jié)果。然后通過(guò)熒光檢測(cè)儀分析熒光信號(hào),實(shí)現(xiàn)對(duì)目標(biāo)序列的定量分析?。

二、?引物探針的設(shè)計(jì)原則和注意事項(xiàng)?

1. ?引物長(zhǎng)度?:一般為18-24 bp,過(guò)長(zhǎng)或過(guò)短都會(huì)影響擴(kuò)增效率?

2. ?Tm?:熒光定量PCR引物的Tm一般介于59~68°C之間,上下游引物的Tm值相差最好不超過(guò)2°C?。

3. ?GC含量?:引物的GC含量應(yīng)在40%~60%之間,上下游引物的GC含量不能相差太大?。

4. ?避免二級(jí)結(jié)構(gòu)?:擴(kuò)增產(chǎn)物不能形成二級(jí)結(jié)構(gòu),選擇擴(kuò)增片段時(shí)最好避開(kāi)模板的二級(jí)結(jié)構(gòu)區(qū)域?

5. ?引物自身及引物之間不應(yīng)存在互補(bǔ)序列?:引物自身及引物之間不應(yīng)存在超過(guò)4個(gè)連續(xù)互補(bǔ)的堿基,以防止引物二聚體的形成?

通過(guò)掌握這些基本步驟和設(shè)計(jì)原則,可以確保引物探針驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)的準(zhǔn)確性和高效性。如需購(gòu)買(mǎi)探針請(qǐng)聯(lián)系——天津益元利康生物科技有限公司!

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