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超高分辨質(zhì)量分析器——靜電場(chǎng)軌道阱 Orbitrap 簡(jiǎn)介

閱讀:10128      發(fā)布時(shí)間:2019-8-19
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 Exactive質(zhì)譜硬件結(jié)構(gòu)圖如下圖1。分析 物在Ion Source中經(jīng)過離子化后,將依次進(jìn)入 四極桿質(zhì)量分析器(Quadrupole)、C形阱(CTrap),以及靜電場(chǎng)軌道阱(Orbitrap)。如 果需要采集碎片,還將在進(jìn)入Orbitrap前在高 能碰撞池(HCD Collision Cell)中進(jìn)行碎裂。 Orbitrap的功能是進(jìn)行高精度質(zhì)量掃描。其不 但有高達(dá)140,000的超高分辨(ESI-TOF的 分辨率一般為50,000左右)與高精度性能,更 具有*的穩(wěn)定性。如果您詢問有Orbitrap使 用經(jīng)驗(yàn)的朋友使用感受,常聽到的一定是 “穩(wěn)定”這兩個(gè)字。Orbitrap是如何贏得出眾 的穩(wěn)定性口碑呢?主要有以下幾點(diǎn)原因:

 

1)當(dāng)您看到圖1中賽默飛Q Exactive圖的結(jié)構(gòu)時(shí), 您可能會(huì)驚訝的發(fā)現(xiàn)——Orbitrap的體積竟然 如此“嬌小”。確實(shí)Orbitrap質(zhì)量分析器的內(nèi)徑與日常使用的硬幣差不多。而小的體積正 是Orbitrap具有*穩(wěn)定性的一個(gè)關(guān)鍵因素。 我們知道,質(zhì)譜是必須在高真空下工作的, 真空度越好,靈敏度、分辨率、準(zhǔn)確度越高。 高真空度需要機(jī)械泵、分子渦輪泵等一些類 真空維持系統(tǒng)的不間斷高強(qiáng)度工作來實(shí)現(xiàn)。 Orbitrap僅有TOF體積的幾十分之一甚至更小, 這就極大地降低了真空維持系統(tǒng)的工作壓力, 從而極大地降低了故障率。

2)Orbitrap的*穩(wěn)定性還源于其數(shù)據(jù)記 錄模式。從表面看,Orbitrap與TOF的采集頻 率都為幾十赫茲。但實(shí)際上,TOF的離子飛行 是在納秒級(jí)完成的。但由于單張圖譜的信號(hào) 過于微弱,終直觀看到每一張TOF質(zhì)譜圖都 是由上百?gòu)垐D譜疊加而成。不間斷地納秒級(jí) 數(shù)據(jù)產(chǎn)出,造成了TOF數(shù)據(jù)記錄系統(tǒng)的巨大的工作壓力,這是TOF系統(tǒng)容易在數(shù)據(jù)采集時(shí)發(fā) 生文件損壞的重要原因。相比之下,Orbitrap 采用傅里葉變換算法采集處理數(shù)據(jù),數(shù)據(jù)記 錄系統(tǒng)的工作強(qiáng)度為毫秒級(jí),因此也具有了 更好的系統(tǒng)穩(wěn)定性。

 

3)TOF是以離子到達(dá)檢測(cè)器時(shí)間差來分辨 離子的,這個(gè)差別需要到皮秒(10-12 S) 甚至更低。因此環(huán)境溫度的一點(diǎn)點(diǎn)變化所引 起的飛行管金屬部件微小的熱脹冷縮都會(huì)導(dǎo) 致飛行距離的改變,以至于巨大地影響離子 到達(dá)檢測(cè)器的時(shí)間。正因?yàn)榇耍赥OF類儀器 設(shè)計(jì)時(shí),需要用到復(fù)雜的溫度補(bǔ)償校正,以 及外標(biāo)或內(nèi)標(biāo)的添加。而無論是補(bǔ)償校正還 是標(biāo)準(zhǔn)品添加,都需要通過安裝一系列硬件 和軟件來實(shí)現(xiàn)。我們知道,一個(gè)儀器組件越 多,整體出現(xiàn)故障的概率就越大,所以這也 大大地影響了TOF的穩(wěn)定性。而Orbitrap不存 在這些問題,并可在更為寬松的環(huán)境條件下 保持高穩(wěn)定性,并且無額外部件引起的故障 問題。以上是從儀器構(gòu)造及采集方式上比較賽默飛Q Exactive與TOF的穩(wěn)定性差異,那么實(shí)際中呢? 圖2中為近年來Nature、Science、Cell系列刊物 使用Orbitrap發(fā)表論文的數(shù)量——達(dá)到了

的2-3篇/天。我們知道,作為科學(xué)領(lǐng)域的 刊物,這三個(gè)系列期刊對(duì)稿件質(zhì)量要求*— —不但要求數(shù)據(jù),更要求大量實(shí)驗(yàn)的反復(fù) 驗(yàn)證。如此高頻率地文獻(xiàn)發(fā)表,正證明 了Orbitrap面對(duì)海量分析任務(wù)時(shí),在滿足高數(shù) 據(jù)質(zhì)量的要求下,表現(xiàn)出了*的穩(wěn)定性。 而穩(wěn)定性對(duì)于生物醫(yī)藥企業(yè)成本風(fēng)險(xiǎn)控制的 重要性是不言而喻的。

 

當(dāng)然,穩(wěn)定只代表儀器的耐用性,對(duì)于儀 器性能方面,Orbitrap是否同樣能帶給分析人 員驚喜呢?答案是肯定的。從上面提到的在 Nature 、 Science 、 Cell 系列刊物中 , Orbitrap的高頻使用率就可見一斑。更為直觀 的是當(dāng)對(duì)比圖譜數(shù)據(jù),特別是當(dāng)比較Orbitrap 與 TOF 二級(jí)碎片質(zhì)譜圖譜時(shí) , 可以發(fā)現(xiàn) Orbitrap的碎片信息更為豐富和清晰。這一方 面是由Orbitrap的超高分辨能力,以及與之相 伴的高準(zhǔn)確度所帶來的。另一方面,Orbitrap 的高靈敏是又一重要原因(高靈敏度是獲得 高信噪比與高分辨率數(shù)據(jù)的重要基礎(chǔ))。 Orbitrap系列質(zhì)譜出眾的靈敏度源于以下幾個(gè) 因素的綜合作用。 

 

1)如前所述Orbitrap的腔體體積僅為TOF 的幾十分之一甚至更低。這不但減輕了維持 系統(tǒng)的工作壓力,更利于獲得超高的真空度。 相比TOF,Orbitrap內(nèi)的真空度為10-10mBar量 級(jí),而TOF為10-6至10-7mBar。無論是Orbitrap 還是TOF質(zhì)量分析器,離子在其腔體內(nèi)進(jìn)行檢 測(cè)時(shí),都存在待分析離子與殘留氣體分子碰 撞而造成離子損失,從而導(dǎo)致靈敏度降低。 相比之下Orbitrap具有高達(dá)三個(gè)數(shù)量級(jí)的真空 度優(yōu)勢(shì),離子損失大大減少,成為其獲得更 高靈敏度的重要原因之一。


 

2)從儀器結(jié)構(gòu)看,在Orbitrap系列質(zhì)譜 中,還存在了一個(gè)在TOF類質(zhì)譜中并不具備的 組件——C trap(圖3)。C trap組件除了負(fù)責(zé) 向Orbitrap傳遞離子外,其還有一個(gè)重要的功 能:蓄積離子。在離子進(jìn)入Orbitrap之前,先 要有C trap對(duì)離子進(jìn)行“點(diǎn)數(shù)”。如要對(duì)某特 定肽段進(jìn)行分析時(shí),C trap會(huì)將此肽段的離子 數(shù)積蓄到一個(gè)設(shè)定的數(shù)量(如106個(gè)離子)后 再傳遞給Orbitrap。也就是說通過C trap實(shí)現(xiàn)了 離子濃度的提高。這無疑對(duì)高靈敏度起到了 巨大的貢獻(xiàn),這種優(yōu)勢(shì)在獲取真實(shí)樣本中的 低濃度離子的二級(jí)碎片信息上表現(xiàn)地更為明 顯。而TOF質(zhì)量分析器, 不能使用類似于C trap的技術(shù)將離子大量聚集,提高離子濃度。 這是因?yàn)椋?)在TOF分析起始的瞬間,不同 的離子需要聚中壓平在一起,也就是說需要 濃縮在一個(gè)極小的空間內(nèi),這樣才能保證各 種離子在同一個(gè)起跑線上,具有盡可能相同 的飛行距離。但由于離子具有同性電荷相互 排斥的問題,因此TOF無法在分析時(shí)大量蓄積 離子后再做分析;2)由于TOF檢測(cè)器采用碰撞檢測(cè)的方式,大量離子的同時(shí)到達(dá)很容 易造成檢測(cè)器過飽和,造成飛行時(shí)間計(jì)算誤 差。這是TOF不能通過大量蓄積離子提高靈敏 度的又一個(gè)原因。

此外, Q Exactive質(zhì)譜并不存在離子阱質(zhì) 量分析器的“三分之一效應(yīng)”問題。三分之 一效應(yīng)是指離子阱對(duì)某個(gè)特定離子進(jìn)行碎裂并進(jìn)行碎片質(zhì)量測(cè)量時(shí),碎片質(zhì)量在母離子 質(zhì)量前三分之一范圍內(nèi)的碎片將無法被記錄。 這在肽段分析中將可能導(dǎo)致丟失肽段的b1、 b2、y1、y2等小質(zhì)量碎片。而Orbitrap系列質(zhì) 譜 , 采用了在 HCD 碰撞池 ( High Collision Energy Collision Cell)中進(jìn)行碎裂,在Orbitrap 中完成質(zhì)量掃描的方式。在碎裂及質(zhì)量掃描 的過程中都沒有離子阱的參與,因此無三分 之一效應(yīng)。事實(shí)上,通過PQD和Trap-HCD技術(shù) (Pulsed - Q Dissociation),Thermo也已經(jīng)解 決了離子阱質(zhì)譜的三分之一效應(yīng)問題。

 

3)信噪比是與靈敏度相輔相成的,而在 信噪比指標(biāo)上,Orbitrap同樣具有先天優(yōu)勢(shì)。 圖4是在完整蛋白分析時(shí),TOF與Orbitrap的原 始數(shù)據(jù)對(duì)比圖??梢园l(fā)現(xiàn)即使在兩者的分辨 率近似的數(shù)據(jù)中,Orbitrap獲得了更高的信噪 比及圖譜質(zhì)量。這是因?yàn)槟壳捌毡椴捎玫?質(zhì)譜分辨率的計(jì)算方法是使用質(zhì)譜峰的質(zhì)荷 比值除以其峰高一半處的峰寬。如某離子測(cè) 得質(zhì)荷比為1000m/z,其質(zhì)譜峰峰高的一半處 峰寬為0.1m/z,則其分辨率為10 000。可以看 出在這種*的質(zhì)譜分辨率計(jì)算方法中,只 考慮了質(zhì)譜峰高一半處的圖譜質(zhì)量,而對(duì)更 接近信號(hào)基線的圖譜質(zhì)量不作考量。而在這 一點(diǎn)上正是Orbitrap能夠產(chǎn)生的圖譜質(zhì)量 的關(guān)鍵因素之一:高信噪比。相似的分辨率, 不同的圖譜質(zhì)量是由什么原因造成的呢?當(dāng) 有物質(zhì)撞擊TOF質(zhì)量分析器飛行管的末端的檢 測(cè)器時(shí),一個(gè)信號(hào)將被記錄。這里需要指出 的是,不僅是離子,中性雜質(zhì)分子的撞擊同 樣會(huì)產(chǎn)生信號(hào)。觀察任何一個(gè)ESI-TOF類串聯(lián) 質(zhì)譜就會(huì)發(fā)現(xiàn),在此類質(zhì)譜結(jié)構(gòu)中,含有多 個(gè)轉(zhuǎn)彎結(jié)構(gòu)。這些轉(zhuǎn)彎結(jié)構(gòu)重要的作用就是在轉(zhuǎn)彎處甩出中性分子,避免對(duì)檢測(cè)器 的干擾,否則將會(huì)對(duì)信噪比產(chǎn)生巨大的影響。 (雖然在Orbitrap質(zhì)譜中也有轉(zhuǎn)彎設(shè)計(jì),但這 些轉(zhuǎn)彎主要是為了減小儀器長(zhǎng)度、簡(jiǎn)化清洗 操作而設(shè)計(jì)的,并不必考慮中性分子對(duì)檢測(cè) 信號(hào)信噪比的影響。)這個(gè)優(yōu)勢(shì)是由Orbitrap 檢測(cè)原理所帶來的。當(dāng)離子進(jìn)入Orbitrap腔體 中,同類離子將發(fā)生同步化旋轉(zhuǎn),根據(jù)電磁 效應(yīng),離子旋轉(zhuǎn)將產(chǎn)生磁場(chǎng),產(chǎn)生的電磁信 號(hào)被檢測(cè)器記錄,不同離子電磁信息特征不 同,因而被分辨。顯而易見,中性分子是不 能產(chǎn)生離子那樣的電磁效應(yīng)的,因而不會(huì)造 成干擾,而使Orbitrap具有更好的信噪比。這 是在相近分辨率情況下,Orbitrap之所以能更 有效地實(shí)現(xiàn)質(zhì)譜信號(hào)基線分辨,獲得更高質(zhì) 量質(zhì)譜數(shù)據(jù)的一個(gè)重要原因。

 

讀到這里,您可能想到了一個(gè)詞“兩全其 美”。是的,Orbitrap系列質(zhì)譜實(shí)現(xiàn)了*穩(wěn) 定性與的性能的統(tǒng)一。于是水到渠成, Orbitrap系列質(zhì)譜已經(jīng)成為蛋白質(zhì)質(zhì)譜分析領(lǐng) 域*高的質(zhì)譜品牌。Orbitrap于 2005年推出,適逢蛋白質(zhì)組學(xué)爆發(fā)拐點(diǎn)。十 年間,Orbitrap經(jīng)受住了蛋白質(zhì)組學(xué)表達(dá)譜、 修飾譜、定量蛋白質(zhì)組學(xué)、結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)組學(xué), 以及糖組學(xué)等嚴(yán)酷分析需求的琢磨與考驗(yàn)。 這些領(lǐng)域的工作內(nèi)容不但*覆蓋了蛋白質(zhì) 藥物質(zhì)譜分析的所有需求,在分析難度上更 是遠(yuǎn)遠(yuǎn)超出——蛋白質(zhì)組學(xué)的分析目標(biāo)蛋白數(shù) 少則數(shù)百多則至萬。因此,無論是全蛋白分 子量測(cè)定、肽圖分析、修飾定量、二硫鍵發(fā) 現(xiàn)、糖基化解析等針對(duì)蛋白藥物自身結(jié)構(gòu)的 表征分析,還是代謝定量、雜質(zhì)蛋白鑒定等 復(fù)雜背景中的質(zhì)量研究,Orbitrap通過長(zhǎng)達(dá)十年的方法開發(fā)與經(jīng)驗(yàn)積累,已經(jīng)*具備了 各種蛋白質(zhì)藥物所需的全部質(zhì)譜分析方法與 解決方案。并在與其它類型高分辨質(zhì)譜的比 較中表現(xiàn)出了極大的應(yīng)用優(yōu)勢(shì)。

 

穩(wěn)定的品質(zhì)、的性能、全面的應(yīng)用, 賽默飛Q Exactive的這些優(yōu)點(diǎn),無疑會(huì)為身在激烈的產(chǎn) 業(yè)競(jìng)爭(zhēng)環(huán)境中的使用者提供為有力、保障的支持。

 

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