一:eDNA采樣硬件選擇
在魚類資源調查中,國際上普遍認可的專業(yè)采樣設備為美國Smith公司生產的多通道水體基因采樣器或便攜式eDNA采樣器。
可參閱文獻:
eDNA Sampler: A fully integrated environmental DNAsampling system
多通道水體基因采樣器
便攜式eDNA采樣器
設備優(yōu)勢
1、可記錄采樣點流速、GPS、溫度等信息
2、內置計算機,可導出采樣日志、為每個樣品標注采樣編碼
3、采樣飽和后具有震動反饋功能,可設置定量采水
4、具備遠程藍牙遙控采水功能
5、可進行多通道的同步采樣
6、自封濾膜(技術):采用合成樹脂材料自動對樣本進行脫水處理,使DNA信息能在室溫下保存90天不降解(傳統(tǒng)采樣方式需要對樣品進行乙醇加注、冷凍、防腐等措施,費時費力,往往會在采樣點浪費大量時間)
①降低污染——傳統(tǒng)樣品處理方式需要現(xiàn)場對樣品進行防腐處理,會增加污染可能。
②提高DNA含量——與傳統(tǒng)使用乙醇相比,檢測到的DNA含量是其2倍。
③提高效率——現(xiàn)場無需準備乙醇及緩慢的過濾工作,無需準備冷凍措施低溫保存樣品,即便是沒有相關從業(yè)經驗的人員即可快速上手實現(xiàn)標準化的采樣工作。
設備標配自封濾膜套裝self-preserving packs——封裝后即可郵寄至我司合作實驗室分析
二:樣品(q)PCR分析并出具報告
樣品分析由上海蔚雨科技有限公司合作實驗室進行分析,用戶所使用的濾膜必須為廠家提供的自封式濾膜,郵寄至廠商接收點(常溫、無需使用乙醇等固定液),2周內即可獲取結題報告。
自封式濾膜可參閱文獻:
A self‐preserving, partially biodegradable eDNA filter
1、流程
環(huán)境DNA提取——設計合成引物接頭——PCR擴增產物純化——PCR產物定量均一化——測序文庫構建——高通量測序——生成報告
2、樣品報告包括但不限于:
相關產品
免責聲明
- 凡本網注明“來源:化工儀器網”的所有作品,均為浙江興旺寶明通網絡有限公司-化工儀器網合法擁有版權或有權使用的作品,未經本網授權不得轉載、摘編或利用其它方式使用上述作品。已經本網授權使用作品的,應在授權范圍內使用,并注明“來源:化工儀器網”。違反上述聲明者,本網將追究其相關法律責任。
- 本網轉載并注明自其他來源(非化工儀器網)的作品,目的在于傳遞更多信息,并不代表本網贊同其觀點和對其真實性負責,不承擔此類作品侵權行為的直接責任及連帶責任。其他媒體、網站或個人從本網轉載時,必須保留本網注明的作品第一來源,并自負版權等法律責任。
- 如涉及作品內容、版權等問題,請在作品發(fā)表之日起一周內與本網聯(lián)系,否則視為放棄相關權利。