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熒光原位雜交技術(shù)發(fā)展歷程與多元應用解析

來源:威尼德生物科技(北京)有限公司   2024年11月15日 13:36  

一、引言

熒光原位雜交技術(shù)作為一種強大的分子細胞遺傳學工具,在現(xiàn)代生物學和醫(yī)學研究中占據(jù)著至關(guān)重要的地位。它能夠在細胞水平上對特定的 DNA 或 RNA 序列進行可視化分析,將分子生物學與細胞形態(tài)學有機地結(jié)合起來。隨著科學技術(shù)的不斷發(fā)展,F(xiàn)ISH 技術(shù)從最初的簡單概念發(fā)展成為一個高度精確、廣泛應用的技術(shù)體系,為解決基因和染色體相關(guān)的研究問題提供了關(guān)鍵手段。無論是基礎(chǔ)研究中對基因結(jié)構(gòu)和功能的探索,還是臨床診斷中對疾病的早期檢測和分型,F(xiàn)ISH 技術(shù)都發(fā)揮了不可替代的作用。了解其發(fā)展歷程和應用領(lǐng)域?qū)τ谏钊胪诰蚱錆摿屯苿酉嚓P(guān)領(lǐng)域的進步具有深遠意義。

 

二、熒光原位雜交技術(shù)的發(fā)展歷程

(一)早期起源

FISH 技術(shù)的起源可以追溯到 20 世紀 60 年代的原位雜交技術(shù)(In situ hybridization,ISH)。當時,研究人員開始嘗試利用放射性標記的核酸探針來檢測細胞內(nèi)的特定核酸序列。這種方法雖然具有一定的特異性,但放射性物質(zhì)的使用存在諸多不便和安全隱患,如對實驗人員的輻射危害、放射性標記物的半衰期限制以及復雜的檢測步驟等。

 

(二)技術(shù)革新與熒光標記的引入

20 世紀 80 年代,隨著分子生物學和熒光標記技術(shù)的發(fā)展,研究人員開始探索用非放射性標記物替代放射性標記。熒光標記物的出現(xiàn)是一個重大突破,它具有高靈敏度、高特異性、安全性好且易于檢測等優(yōu)點。最早的熒光原位雜交技術(shù)采用了直接標記的熒光探針,即將熒光素直接與核酸探針結(jié)合。這種方法雖然簡化了檢測過程,但在信號強度和特異性方面還存在一些問題。

 

(三)技術(shù)完善與發(fā)展

隨后,間接標記法應運而生。間接標記的熒光原位雜交中,探針先與一些可以被后續(xù)識別的非熒光標記物(如生物素)結(jié)合,然后再通過與這些標記物特異性結(jié)合的熒光標記抗體或其他熒光親和物質(zhì)來進行檢測。這種方法大大增強了信號強度和特異性。同時,在探針設(shè)計方面,從最初的簡單序列探針發(fā)展到復雜的多色探針、染色體涂抹探針(Chromosome painting probes)等,使得可以同時檢測多個基因或染色體區(qū)域,提高了檢測效率和分辨率。此外,雜交反應條件、樣本處理方法等也在不斷優(yōu)化,使得 FISH 技術(shù)的準確性和可靠性不斷提高。

 

三、熒光原位雜交技術(shù)的原理與實驗流程

(一)技術(shù)原理

FISH 技術(shù)基于核酸分子的堿基互補配對原則。首先,將待檢測的細胞或組織樣本固定在載玻片上,保持細胞形態(tài)和核酸的完整性。然后,加入經(jīng)過標記(熒光標記)的核酸探針,這些探針能夠特異性地與目標核酸序列(DNA 或 RNA)互補結(jié)合。在適當?shù)碾s交條件下(如溫度、鹽濃度等),探針與目標序列形成穩(wěn)定的雜交體。最后,通過熒光顯微鏡觀察,可以看到熒光信號在細胞內(nèi)的位置,從而確定目標核酸序列在細胞中的分布情況。

(二)實驗步驟

1. 樣本制備
對于不同類型的樣本,如細胞涂片、組織切片等,有不同的制備方法。以細胞樣本為例,首先收集細胞,然后進行固定,常用的固定劑有甲醇 - 醋酸混合液等。固定后的細胞可以通過離心等方法收集并涂片于載玻片上。對于組織樣本,需要經(jīng)過切片、脫蠟(如果是石蠟包埋組織)等處理,使其核酸暴露以便后續(xù)雜交。

2. 探針設(shè)計與標記
根據(jù)目標序列設(shè)計合適的核酸探針。探針的長度通常在幾百個堿基對到幾千個堿基對之間。對于基因特異性探針,需要精確選擇與目標基因互補的序列。在標記方面,可以采用直接熒光標記,如將熒光素(如 FITC、Cy3、Cy5 等)通過化學方法與探針的核苷酸結(jié)合。間接標記則是先將探針與生物素或等標記物結(jié)合,然后再通過熒光標記的親和物質(zhì)(如熒光標記的抗生物素抗體或抗體)來檢測。

3. 雜交反應
將標記好的探針加入到制備好的樣本上,在雜交緩沖液中進行雜交反應。雜交緩沖液中含有合適的鹽濃度、甲酰胺等成分,以調(diào)節(jié)雜交的嚴謹性。雜交溫度和時間根據(jù)探針和目標序列的特性而定,一般在 37℃ - 42℃之間,時間可以從幾個小時到過夜不等。嚴謹?shù)碾s交條件可以保證探針與目標序列的特異性結(jié)合,減少非特異性雜交信號。

4. 洗滌與檢測
雜交完成后,需要進行洗滌步驟,去除未結(jié)合的探針和非特異性結(jié)合的雜質(zhì)。洗滌條件根據(jù)雜交的嚴謹性來調(diào)整,一般采用不同濃度的鹽溶液在適當溫度下進行多次洗滌。對于直接標記的探針,可以直接在熒光顯微鏡下觀察。對于間接標記的探針,需要加入相應的熒光標記親和物質(zhì),孵育后再進行洗滌,然后在熒光顯微鏡下觀察。在熒光顯微鏡下,可以根據(jù)熒光信號的顏色、強度和位置來分析目標序列的情況。如果使用多色 FISH,則需要對不同顏色的熒光信號進行識別和分析,以獲取更復雜的信息。

四、熒光原位雜交技術(shù)的多元應用

(一)基因定位

在基因組研究中,FISH 技術(shù)可用于確定特定基因在染色體上的位置。通過設(shè)計針對目標基因的探針,并與染色體進行雜交,可以直觀地觀察到基因所在的染色體區(qū)域。這對于構(gòu)建基因圖譜、研究基因的連鎖關(guān)系以及了解基因在染色體上的排列順序具有重要意義。例如,在研究一些遺傳性疾病相關(guān)基因時,F(xiàn)ISH 技術(shù)可以幫助確定基因與已知染色體標記的相對位置,為進一步的基因克隆和功能研究提供線索。

(二)染色體異常檢測

1. 數(shù)目異常檢測
FISH 技術(shù)可用于檢測染色體的數(shù)目異常,如三體綜合征(如 21 - 三體綜合征、18 - 三體綜合征等)。通過使用針對特定染色體的著絲粒探針,在細胞中觀察熒光信號的數(shù)目,可以快速準確地判斷染色體的數(shù)目是否正常。與傳統(tǒng)的染色體核型分析相比,F(xiàn)ISH 技術(shù)具有更高的靈敏度和更快的檢測速度,尤其適用于產(chǎn)前診斷和腫瘤細胞染色體分析等領(lǐng)域。

2. 結(jié)構(gòu)異常檢測
對于染色體的結(jié)構(gòu)異常,如缺失、重復、易位、倒位等,FISH 技術(shù)也能有效檢測。例如,使用特定的基因探針或染色體片段探針,可以檢測基因的缺失或重復情況。在腫瘤研究中,染色體易位是一種常見的異?,F(xiàn)象,F(xiàn)ISH 技術(shù)可以通過設(shè)計針對易位斷點兩側(cè)序列的探針,觀察熒光信號的融合情況,來確定易位是否發(fā)生,為腫瘤的診斷、分型和預后評估提供依據(jù)。

(三)腫瘤診斷與研究

1. 腫瘤診斷與分型
在腫瘤診斷中,FISH 技術(shù)可以檢測腫瘤細胞中的染色體異常和特定基因的改變。例如,在乳腺癌中,HER - 2 基因的擴增與腫瘤的惡性程度和預后密切相關(guān)。通過 FISH 技術(shù)檢測 HER - 2 基因的拷貝數(shù),可以準確判斷患者是否適合使用針對 HER - 2 的靶向治療藥物。此外,對于一些血液系統(tǒng)腫瘤,如慢性粒細胞白血病中 BCR - ABL 融合基因的檢測,F(xiàn)ISH 技術(shù)可以作為一種重要的診斷方法,區(qū)分不同類型的白血病。

2. 腫瘤預后評估
染色體異常和基因改變的情況也可以作為腫瘤預后的重要指標。例如,某些染色體片段的缺失或特定基因的異常表達可能預示著腫瘤患者的預后較差。FISH 技術(shù)可以對腫瘤組織進行多參數(shù)分析,綜合評估腫瘤的預后情況,為臨床治療方案的制定提供參考。

(四)病原體檢測

FISH 技術(shù)可以用于檢測細胞內(nèi)的病原體,如病毒、細菌、支原體等。通過設(shè)計針對病原體特異性核酸序列的探針,可以在感染細胞中觀察到病原體的存在。例如,在檢測人乳頭瘤病毒(HPV)感染時,F(xiàn)ISH 技術(shù)可以在宮頸細胞中檢測 HPV 的 DNA,確定病毒的感染狀態(tài)和病毒類型。與傳統(tǒng)的病原體檢測方法相比,F(xiàn)ISH 技術(shù)具有更高的特異性和能夠直接在細胞水平觀察病原體的優(yōu)勢,有助于深入了解病原體與宿主細胞的相互作用。

(五)產(chǎn)前診斷

在產(chǎn)前診斷領(lǐng)域,FISH 技術(shù)是一種重要的檢測手段。它可以用于檢測胎兒細胞中的染色體異常,如常見的染色體數(shù)目異常。通過采集羊水細胞、絨毛細胞或胎兒有核紅細胞等樣本,利用 FISH 技術(shù)可以快速獲得檢測結(jié)果,為孕婦和家庭提供及時的診斷信息。與傳統(tǒng)的羊水穿刺染色體核型分析相比,F(xiàn)ISH 技術(shù)具有檢測時間短、對樣本要求相對較低等優(yōu)點,尤其適用于一些需要快速診斷的情況,如高齡孕婦、有染色體異常家族史的孕婦等。

五、結(jié)論

熒光原位雜交技術(shù)經(jīng)歷了漫長的發(fā)展歷程,從早期的原位雜交技術(shù)發(fā)展而來,通過引入熒光標記和不斷優(yōu)化實驗方法,已經(jīng)成為一種成熟且廣泛應用的分子細胞遺傳學技術(shù)。其原理基于核酸的堿基互補配對,通過精心設(shè)計的實驗流程,包括樣本制備、探針設(shè)計與標記、雜交反應、洗滌與檢測等步驟,可以準確地在細胞水平上檢測特定的核酸序列。FISH 技術(shù)在基因定位、染色體異常檢測、腫瘤診斷與研究、病原體檢測、產(chǎn)前診斷等多個領(lǐng)域展現(xiàn)出了更好的應用價值。隨著技術(shù)的不斷進步,如探針設(shè)計的進一步創(chuàng)新、檢測儀器的改進等,F(xiàn)ISH 技術(shù)有望在未來的生命科學和醫(yī)學研究中發(fā)揮更加重要的作用,為人類健康和疾病研究做出更大的貢獻。同時,我們也需要不斷探索和優(yōu)化 FISH 技術(shù),以滿足日益增長的科學研究和臨床診斷需求。

 


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