SP6核糖核酸聚合酶的知識(shí)背景與應(yīng)用研究!
一、知識(shí)背景
SP6核糖核酸聚合酶也被稱為SP6 RNA聚合酶,是一種由大腸桿菌中的噬菌體SP6產(chǎn)生的酶。這種酶具有在體外合成RNA分子的能力,因此,它常被用于體外轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn),廣泛應(yīng)用于合成特定的RNA分子。
SP6核糖核酸聚合酶的主要特點(diǎn)是能夠高度特異識(shí)別SP6啟動(dòng)子序列,是一種DNA依賴的5'→3'RNA聚合酶。它催化單鏈或雙鏈DNA SP6啟動(dòng)子下游NTP的摻入,合成與SP6啟動(dòng)子下游的模板DNA互補(bǔ)的RNA。此外,SP6 RNA聚合酶還能識(shí)別修飾的NTP,例如生物素標(biāo)記、熒光素標(biāo)記的NTP,這使得它在各種標(biāo)記RNA的合成中具有應(yīng)用價(jià)值。
在科研實(shí)驗(yàn)中,利用SP6核糖核酸聚合酶合成的RNA有多種應(yīng)用,如制備雜交探針、進(jìn)行基因組DNA序列分析、核糖核酸酶保護(hù)測(cè)定、反義RNA合成、作為體外翻譯的RNA模板、RNA剪接研究的底物、RNA二級(jí)結(jié)構(gòu)和RNA-蛋白質(zhì)相互作用研究,以及核酸擴(kuò)增分析等。此外,它還可以用于合成siRNA、miRNA等小RNA。
值得注意的是,使用SP6核糖核酸聚合酶時(shí),必須以SP6 DNA或克隆在SP6啟動(dòng)子下游的DNA作為合成模板,并且該酶需要在特定的條件下儲(chǔ)存,一般是-20°C。
二、應(yīng)用研究
SP6核糖核酸聚合酶可以用于FasL基因的克隆化及其mRNA在肺癌組織中的表達(dá)分布:
通過采用反轉(zhuǎn)錄多聚酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)技術(shù)和分子克隆技術(shù)克隆人FasL基因片段,制備互補(bǔ)核糖核酸(cRNA)探針,采用原位雜交的方法觀察FasL mRNA在肺癌組織細(xì)胞中的表達(dá)分布情況,并探討其臨床意義。
方法:分離健康人外周血單核細(xì)胞(PBMC),終濃度為50mM,用植物血凝素-P(PHA-P)激活15分鐘,誘導(dǎo)FasL基因表達(dá),用人全血總RNA提取試劑盒(QIAamp RNA Blood Mini kit)提取總RNA,特異性引物反轉(zhuǎn)錄制備互補(bǔ)脫氧核糖核酸(cDNA),聚合酶鏈反應(yīng)擴(kuò)增FasL基因片段,產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳,顯示在≈328bp處呈現(xiàn)1條與預(yù)期產(chǎn)物分子量大小相符的DNA擴(kuò)增條帶,按照QIAquick凝膠提取試劑盒說明進(jìn)行膠上PCR產(chǎn)物回收,予以擴(kuò)增、純化,用PstI、EcoRI雙酶切PCR產(chǎn)物和質(zhì)粒pSPT19,使PCR產(chǎn)物和質(zhì)粒DNA兩端互補(bǔ),用T4連接酶將其定向克隆入質(zhì)粒中,轉(zhuǎn)化感受態(tài)大腸桿菌JM109,在涂抹有氨芐青霉素的LB平板上進(jìn)行藍(lán)白篩選,獲取有重組質(zhì)粒的陽性轉(zhuǎn)化子,插入的FasL cDNA經(jīng)DAN測(cè)序證實(shí)與Genebank中FasL序列相同,用PstI酶酶切重組質(zhì)粒,使之線性化,經(jīng)SP6核糖核酸聚合酶體外轉(zhuǎn)錄制備標(biāo)記的FasL cRNA探針(Dig-FasL cRNA)。收集青島大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院胸外科手術(shù)切除的肺癌新鮮標(biāo)本(經(jīng)病理證實(shí),其中鱗狀細(xì)胞癌3例,腺癌2例,小細(xì)胞癌1例),置于無菌Ep管中,經(jīng)液氮速凍運(yùn)輸,轉(zhuǎn)移至-70℃冰箱中備用,標(biāo)本經(jīng)4%多聚甲醛和15%蔗糖處理后制備成冰凍切片,厚度為6μm,再經(jīng)多聚甲醛后固定,非離子型去污劑處理細(xì)胞膜,在切片上用cRNA探針進(jìn)行原位雜交,經(jīng)四唑氮藍(lán)(NBT/BCIP)顯色,鏡下觀察FasLmRNA在肺癌細(xì)胞中的表達(dá)分布情況。結(jié)果:DNA測(cè)序證實(shí)重組質(zhì)粒中插入的FasL cDNA序列準(zhǔn)確無誤;標(biāo)記的FasL cRNA探針經(jīng)標(biāo)記效率檢測(cè),標(biāo)記效率滿意;鏡下觀察發(fā)現(xiàn)三種病理類型的肺癌細(xì)胞胞漿中均可檢測(cè)到藍(lán)紫色雜交信號(hào),表明肺癌細(xì)胞中存在FasL mRNA的表達(dá)。結(jié)論:FasL基因的克隆化成為肺癌細(xì)胞凋亡研究的工具;標(biāo)記的FasL mRNA探針為進(jìn)一步研究FasL mRNA在肺癌細(xì)胞中的表達(dá)分布提供了有效手段:FasL作為促細(xì)胞凋亡基因與肺癌的發(fā)生、發(fā)展有重要關(guān)系。
標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)資源平臺(tái),本站羅列了國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)及本公司自行研制的標(biāo)準(zhǔn)品,對(duì)照品及化學(xué)試劑,方便了客戶對(duì)標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)及化學(xué)試劑的查詢!所接所有訂單全部由上門自取改為快遞統(tǒng)一發(fā)貨,既快捷了外地客戶對(duì)產(chǎn)品的使用,又規(guī)范了公司內(nèi)部的庫(kù)房結(jié)構(gòu)!讓一站式標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)的購(gòu)買更加精準(zhǔn),高效!
相關(guān)產(chǎn)品
免責(zé)聲明
- 凡本網(wǎng)注明“來源:化工儀器網(wǎng)”的所有作品,均為浙江興旺寶明通網(wǎng)絡(luò)有限公司-化工儀器網(wǎng)合法擁有版權(quán)或有權(quán)使用的作品,未經(jīng)本網(wǎng)授權(quán)不得轉(zhuǎn)載、摘編或利用其它方式使用上述作品。已經(jīng)本網(wǎng)授權(quán)使用作品的,應(yīng)在授權(quán)范圍內(nèi)使用,并注明“來源:化工儀器網(wǎng)”。違反上述聲明者,本網(wǎng)將追究其相關(guān)法律責(zé)任。
- 本網(wǎng)轉(zhuǎn)載并注明自其他來源(非化工儀器網(wǎng))的作品,目的在于傳遞更多信息,并不代表本網(wǎng)贊同其觀點(diǎn)和對(duì)其真實(shí)性負(fù)責(zé),不承擔(dān)此類作品侵權(quán)行為的直接責(zé)任及連帶責(zé)任。其他媒體、網(wǎng)站或個(gè)人從本網(wǎng)轉(zhuǎn)載時(shí),必須保留本網(wǎng)注明的作品第一來源,并自負(fù)版權(quán)等法律責(zé)任。
- 如涉及作品內(nèi)容、版權(quán)等問題,請(qǐng)?jiān)谧髌钒l(fā)表之日起一周內(nèi)與本網(wǎng)聯(lián)系,否則視為放棄相關(guān)權(quán)利。