LncRNA芯片定制檢測服務
實驗技術簡介:長鏈非編碼RNA (long non-coding RNA, IncRNA) 是一類轉錄本長度超過200nt、 不編碼蛋白的RNA。IncRNA起初被認為是基因組轉錄的“噪音”,不具有生物學功能。然而,近年來的研究表明IncRNA能在表觀遺傳、轉錄及轉錄后水平上調控基因表達,參與了X染色體沉默、基因組印記以及染色質修飾、轉錄激活、轉錄干擾、核內運輸?shù)榷喾N重要的調控過程,與人類疾病的發(fā)生、發(fā)展和防治都有著密切聯(lián)系。
雖然越來越多的IncRNA被發(fā)現(xiàn),但是人們現(xiàn)在了解到的IncRNA只是冰山一角,絕大部分的IncRNA的功能仍然是不清楚的。目前主要通過IncRNA芯片或新-代測序等方法對IncRNA進行功能研究。 現(xiàn)階段,基因芯片技術發(fā)展趨于成熟穩(wěn)定,在此平臺上,通過設計不同的IncRNA探針,可以更加快速、高通量地篩選出疾病或特定生物學過程中差異表達的IncRNA和mRNA信息,終找到IncRNA的靶基因 位點深入分析調控機制。
實驗操作流程:
1、樣品RNA抽屜、質檢
2、cDNA/aRNA樣品合成和標記
3、芯片雜交
4、洗滌、染色、掃描
5、圖像采集和數(shù)據(jù)分析
IncRNA芯片數(shù)據(jù)- -IncRNA差異 表達基因的篩選一對IncRNA重新注釋mRNA差異表達基因的篩選-→G0分析,pathway分析IncRNA與mRNA共表達分析
客戶提供:
1、實驗對象為組織樣品,取適量(50-100mg) 新鮮組織樣品或正確保存的組織樣品,使用
BioPulverizerTM冰凍粉碎組織,加1m的RNA抽提試劑TRIzol (Invitrogen),使用Mini-Bead-Beater-16勻漿后抽提RNA。
2、實驗對象為細胞樣品,每份樣品取1x106 ~ 1x107細胞,加1m的RNA抽提試劑TRIzol (樣品為貼壁細胞,每10cm2培養(yǎng)皿TRIzo使用量為1m),裂解后抽提RNA。
交付標準:
1、芯片檢測數(shù)據(jù)
2、完整的實驗操作規(guī)程、實驗報告 (含軟件分析結果)以及實驗材料
實驗代做服務:
| |||
|
| ||
| |||
|