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DNA建庫磁珠——你選對了嗎？
背景介紹
磁珠是高通量測序過程產(chǎn)品，通過磁顆?；钚曰鶊F在一定條件下可與核酸結(jié)合和解離的原理，將樣本中目的片段分離?？蓪崿F(xiàn)對核酸樣本的高通量自動化操作，廣泛應(yīng)用于基因測序以及分子診斷領(lǐng)域。
商業(yè)化磁珠產(chǎn)品體系一般包含：磁珠、聚乙二醇（PEG）、鹽離子等。基于SPRI(Solid Phase Reversible Immobilization )技術(shù)， DNA在一定濃度的PEG存在條件下，NaCl或MgCl2促進條件下，DNA分子構(gòu)象會發(fā)生急劇變化，會暴露出磷酸骨架上大量的帶負電荷的磷酸基團，與表面帶負電荷的羧基磁珠結(jié)合。帶負電磷酸基團借由解離的鹽離子（如Na+）與羧基形成離子橋，使DNA被特異性吸附到羧基磁珠表面。利用磁珠的磁性，可通過外加磁場進行收集洗脫，不同長度的DNA片段可以被選擇性的沉淀出來。
圖1. 磁珠結(jié)構(gòu)示意圖與磁珠吸附DNA原理示意圖
產(chǎn)品描述
Hieff NGS® DNA Selection Beads基于SPRI (Solid Phase Reverse Immobilization)原理，配合精心優(yōu)化過的緩沖體系，可用于二代測序文庫構(gòu)建過程中的DNA片段分選、純化。本產(chǎn)品可適用于各品牌的DNA、RNA建庫試劑盒，和目前廣泛使用的AMPure XP Beads使用方式相同，片段回收效率和文庫大小分布均與AMPure XP Beads高度吻合。
產(chǎn)品特點
? *：采用進口原材料，品質(zhì)高度穩(wěn)定。
?無縫替換：產(chǎn)品原理，產(chǎn)品操作與實驗結(jié)果與AMPure XP保持高度一致。
?兼容性高：兼容目前市面上所有的DNA/RNA建庫試劑盒。
?批次穩(wěn)定：嚴(yán)格的批次性能與穩(wěn)定性質(zhì)控，單次能產(chǎn)20L。
操作流程
圖2. DNA分選操作示意圖
性能展示
? 回收效率與XP高度一致
相同小牛胸腺基因組DNA，分別使用Yeasen磁珠與進口XP磁珠，在不同分選比列條件下， 片段大小與回收產(chǎn)量高度一致。
品牌 | 磁珠比例 | 測試值1 | 測試值2 | 平均值 | 回收效率對比 |
XP | 1.8x | 14.4 | 14.8 | 14.6 | 0.99 |
Yeasen | 14.8 | 14 .8 | 14.8 | ||
XP | 0.8x | 13.2 | 13.1 | 13.15 | 1.04 |
Yeasen | 12.5 | 12.7 | 12.6 | ||
XP | 0.6x | 10.7 | 9.18 | 9.94 | 0.91 |
Yeasen | 11.0 | 10.8 | 10.9 | ||
XP | 0.5x | 9.26 | 9.88 | 9.57 | 1.27 |
Yeasen | 6.58 | 8.46 | 7.52 |
? 分選效果與XP一致
利用模式樣本，用XP磁珠和Yeasen磁珠做平行實驗，Yeasen磁珠分選效果與Beckman磁珠對比，二者回收效率，分選片段大小基本一致。
圖3. 磁珠分選效果與AMPure XP磁珠對比
? 批次間穩(wěn)定性好
Yeasen三個批次磁珠的回收效率高度一致，批間穩(wěn)定性佳。
樣本 | 測試人 | Input（ng） | 純化（1.8×） | ||
純化后（ng） | 回收率% | 平均回收率 | |||
B-YS | 測試人1 | 169.5 | 159.75 | 94.25% | 94.5% |
C-YS | 162 | 95.58% | |||
D-YS | 158.75 | 93.66% | |||
B-YS | 測試人2 | 169.5 | 155 | 91.45% | 91.94% |
C-YS | 154.25 | 91% | |||
D-YS | 158.25 | 93.36% | |||
? 性價比更高
相同規(guī)格產(chǎn)品，Yeasen磁珠價格遠低于AMPure XP價格，性價比更高。
價格對比
圖4. Yeasen磁珠與AMPure XP磁珠價格對比
訂購信息
類型 | 名稱 | 貨號 | 規(guī)格 |
替換XP | Hieff?NGS®?DNA Selection?Beads | 12601ES03 | 1 mL |
12601ES08 | 5 mL | ||
12601ES56 | 60 mL | ||
12601ES75 | 450 mL |
HB210802
