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精品推薦|NGS實驗小助手,純化、分選皆全能
進口磁珠用量大,價格高,實驗進展不下去?
翊圣DNA純化分選磁珠,滿足您的需求!
DNA///片段純化與分選是高通量測序中文庫制備的必要環(huán)節(jié)。目前,市面上的AMPure XP磁珠幾乎占據(jù)半壁江山,但其高昂的價格令許多測序公司感到巨大的壓力。翊圣生物匠心研發(fā)專為二代測序設(shè)計的簡單高效、高通量DNA純化分選精品—Hieff NGSTM DNA Selection Beads,可無縫替代AMPure XP產(chǎn)品,不僅性能優(yōu)異,而且質(zhì)優(yōu)價廉。
產(chǎn)品介紹
基于SPRI(Solid Phase Reversible Immobilization)原理,配合精心優(yōu)化的緩沖體系,可兼容不同品牌的DNA、RNA建庫試劑盒,使用方式相同,片段回收效率和文庫大小分布均與AMPure XP Beads高度吻合。主要應(yīng)用于二
代測序文庫構(gòu)建過程中的DNA///片段分選、純化。
圖1 翊圣磁珠特點
產(chǎn)品亮點
亮點1 精準(zhǔn)分選-分選精度
分選精度一般是雙輪分選后DNA///片段的分布準(zhǔn)確性。目前市場上各廠家磁珠的buffer配方不同,對各個DNA///片段的回收比例也不盡相同。因而評估磁珠的分選精度不適合各品牌平行比較,而應(yīng)是根據(jù)各廠家推薦的比例,完成對應(yīng)大小的DNA///片段篩選。
通??赏ㄟ^Agilent 2100檢測樣本分選后的片段分布。
磁珠分選實驗,模式樣本,用XP磁珠和翊圣磁珠做平行實驗,二者回收效率,片段大小基本一致。
圖2 翊圣磁珠不同分選比例峰圖
亮點2 高效純化-回收效率
磁珠回收效率一般是以回收后的DNA總量與初始的投入DNA總量的比值來計算。相同的DNA投入量,回收效率越高越好。但評估各品牌的磁珠回收效率首先要看磁珠回收的片段是否相同,只有在相同的回收效果時比較回收效率才有意義。
通??赏ㄟ^Qubit定量回收前后的DNA總量計算回收效率。
平行 | 樣本 | Input(ng) | 純化(1.8×) | ||
純化后(ng) | 回收率% | 平均回收率 | |||
平行1 | A-XP | 169.5 | 153.25 | 90.41% | 90.41% |
B-YS | 159.75 | 94.25% | 94.5% | ||
C-YS | 162 | 95.58% | |||
D-YS | 158.75 | 93.66% | |||
平行2 | A-XP | 156 | 92.04% | 92.04% | |
B-YS | 156.5 | 92.33% | 93.51% | ||
C-YS | 160 | 94.4% | |||
D-YS | 159 | 93.81% |
圖3 翊圣磁珠和AMPure XP磁珠回收效率對比
案例展示
實驗?zāi)康?/span>:核酸純化/分選
實驗方案:1.8×(DNA純化);0.65×/0.2×(DNA分選)
評估指標(biāo):純化/分選后磁珠回收效率
磁珠純化/分選后條帶分布
實驗結(jié)論:相同樣本,DNA打斷后初始濃度是13 ng/ul,投入量159 ng,分別用翊圣DNA磁珠與AMPure XP磁珠回收后,平均回收效率分別為104.55%和96.23%。0.65×/0.2×分選后,平均回收率基本一致。
綜上可知翊圣DNA磁珠與AMPure XP磁珠回收效率相近,回收效果以及分選效果高度一致。
品牌 | 樣本編號 | 1.8X純化后濃度(ng/μL) | 分選(0.65X/0.2X) | |||
投入量 | 回收量 | 回收率% | 平均回收率 | |||
XP | A1 | 6.40 | 148 ng | 30 ng | 20.27 | 21.28% |
A2 | 31.2 ng | 21.08 | ||||
A3 | 31.8 ng | 21.49 | ||||
A4 | 33 ng | 22.30 | ||||
翊圣 | B1 | 36.3 ng | 24.53 | 22.30% | ||
B2 | 34.5 ng | 23.31 | ||||
B3 | 30.9 ng | 20.88 | ||||
B4 | 30.3 ng | 20.47 |
圖4 翊圣磁珠和AMPure XP磁珠分選數(shù)據(jù)
圖5 翊圣磁珠和AMPure XP磁珠分選峰圖
綜合分析,翊圣磁珠在不同樣本的適用性、大小片段的回收效率、分選精度和批次穩(wěn)定性方面基本相當(dāng),但價格方面,翊圣磁珠優(yōu)勢明顯,可成為AMPure XP的*。
參數(shù) | Yeasen | AMPure XP |
樣本適用性 | ★★★ | ★★★ |
大片段回收效率 | ★★ | ★★★ |
小片段回收效率 | ★★★ | ★★★ |
DNA純化效率(NGS) | ★★★ | ★★☆ |
批間穩(wěn)定性 | ★★★ | ★★★ |
價格 | ★ | ★★★ |
分選精度 | —— | —— |
常見FAQ問答:
Q1:產(chǎn)品的原理是什么?
A1:產(chǎn)品是基于SPRI(Solid phase reverse immobilization)原理制備的,其在特定條件下,可選擇性吸附不同片段大小的DNA。親和吸附分選。
Q2:產(chǎn)品的主要應(yīng)用是什么?
A2:產(chǎn)品主要應(yīng)用于高通量測序DNA///片段的純化和分選。對于PCR或者酶切DNA產(chǎn)物的純化也可以使用,可以有效去除dNTP,引物,引物二聚體,鹽離子等雜質(zhì)。
Q3:產(chǎn)品可以重復(fù)使用嗎?
A3:產(chǎn)品不可以重復(fù)使用,乙醇洗脫步驟將影響磁珠表面活性基團性能。
Q4:與AMPure XP相比,怎么樣?
A4:我們的產(chǎn)品制備原材料*進口,可以完美替代AMPure XP Beads。在使用方法,文庫大小分布和回收效率上,與AMPure XP Beads*一致,您可以直接按照AMPure XP Beads的操作方式使用,無需摸索條件。
Q5:DNA回收效率低。
A5:可能原因:DNA與磁珠比例不滿足分選要求;乙醇濃度低。80%乙醇需現(xiàn)用現(xiàn)配,放置時間過久,可能由于乙醇揮發(fā),造成濃度降低,影響洗脫效果;洗脫溶液體積不足;洗脫溶液孵育時間過短;磁珠過度干燥。
建議:按照分選推薦比例添加磁珠;80%乙醇現(xiàn)用現(xiàn)配;洗脫溶液需*覆蓋磁珠;磁珠應(yīng)于洗脫液中按規(guī)定時間孵育,常規(guī)為5分鐘;切勿室溫干燥磁珠大于10分鐘,過度干燥將降低洗脫效率。
Q6:純化后DNA在后續(xù)實驗中表現(xiàn)不理想。
A6:由乙醇?xì)埩粢?/span>,可能是操作時磁珠分離時間過短或磁力器磁力較弱,洗脫步驟中吸取上清速度過快等。建議確保在后一步洗滌結(jié)束后,溶液中無殘留乙醇。磁珠可于室溫干燥5-10分鐘,使乙醇*干燥。
訂購信息
名稱 | 貨號 | 規(guī)格 | 價格 | 優(yōu)惠價 |
Hieff NGS® DNA Selection Beads(Superior AMPure XP alternative) | 12601ES03/08/56/75 | 1/5/60/450 mL | 296/986/6286/26186 | 192/641/4086/17021 |
原價450ml,26186元 大包裝,更優(yōu)惠 | 1~5瓶,13500/瓶 6~10瓶,12000/瓶 11~20瓶,9800/瓶 21~50瓶,8000/瓶 51~100瓶,7000/瓶 (>100瓶,另議) |
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Hieff NGS® Smarter DNA Clean beads (50 bp以上) | 12600ES03/08/56/75 | 1/5/60/450 mL | 386/1386/7586/29886 | 251/901/4931/19426 | |
RNA | Hieff NGS® RNA Cleaner | 12602ES03/08/56/75 | 1/5/60/450 mL | 366/1066/4266/38566 | 238/693/2773/25068 |
Hieff NGS® mRNA Isolation Master Kit | 12603ES24/96 | 24/96 T | 616/2266 | 400/1473 |
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