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T4核酸內(nèi)切酶V(T4 Endonuclease V),也被稱為T4 PDG(嘧啶二聚體糖基酶),是一種具有雙重活性的DNA 糖基化酶,結(jié)合了DNA N-糖基化酶和AP裂解酶活性。它可識別并結(jié)合因紫外線照射形成的cis-syn型環(huán)丁烷嘧啶二聚體,在嘧啶二聚體的5’端切割糖苷鍵,從而釋放出二聚體并留下一個AP位點,隨后AP裂解酶活性通過 β 消除切割 AP 位點,與 3'-α、β-不飽和醛和5'-磷酸末端形成1個核苷酸DNA間隙(圖1)。
圖1. T4 Endonuclease V反應(yīng)原理示意圖[1]
T4 Endonuclease V可用于:
1、彗星實驗(單細胞凝膠電泳)中增強對特定類型的DNA損傷,使損傷明顯檢測;
2、檢測和定量DNA損傷(比如RADAR-seq技術(shù) [2],引入一段含有能被測序檢測的甲基化堿基序列作為標(biāo)記,以實現(xiàn)對損傷位點的檢測、定位和定量);
3、FFPE樣本修復(fù)中識別并切割含有氧化損傷堿基的DNA鏈以啟動DNA修復(fù)。
翌圣T4 Endonuclease V產(chǎn)品數(shù)據(jù)展示
翌圣酶研發(fā)團隊潛心研發(fā),成功推出市售T4 Endonuclease V(Cat#14542ES)。翌圣T4 Endonuclease V來源于T4 噬菌體,蛋白純度≥95%(SDS-PAGE法),不含非特異性DNA酶殘留,大腸桿菌宿主gDNA殘留<0.05 copies/1U。
20 μL反應(yīng)體系中,加入3個批次的3 U T4 Endonuclease V和 0.5 μg λDNA-HindⅢ digest,37℃孵育16 h,瓊脂糖凝膠電泳DNA譜帶不發(fā)生變化,表明翌圣Endonuclease IV不含非特異性DNase殘留。
圖2. 非特異性DNase殘留檢測
對3個批次的翌圣T4 Endonuclease V進行宿主(E.coli)基因組DNA殘留檢測,結(jié)果顯示翌圣Endonuclease IV的宿主gDNA殘留<0.05 copies/1 U。
圖3. 宿主gDNA殘留
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產(chǎn)品定位 | 產(chǎn)品名稱 | 產(chǎn)品貨號 |
DNA損傷修復(fù)酶 | Endonuclease IV | 14543ES |
T4 Endonuclease V | 14542ES | |
Endonuclease VIII | 14536ES |
參考文獻:
[1] Cafardi JA, Elmets CA. T4 endonuclease V: review and application to dermatology. Expert Opin Biol Ther. 2008 Jun;8(6):829-38. doi: 10.1517/14712598.8.6.829. PMID: 18476794.
[2] Selvam K, Sivapragasam S, Poon GMK, Wyrick JJ. Detecting recurrent passenger mutations in melanoma by targeted UV damage sequencing. Nat Commun. 2023 May 11;14(1):2702. doi: 10.1038/s41467-023-38265-3. PMID: 37169747; PMCID: PMC10175485.