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翌圣生物科技（上海）股份有限公司
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微生物群落多樣主要包括物種多樣性、遺傳多樣性和功能多樣性3個(gè)方面，在環(huán)境、能源、食品與人體健康等諸多領(lǐng)域有著廣泛的研究與應(yīng)用。16SrRNA擴(kuò)增子測(cè)序技術(shù)是微生物群落多樣性檢測(cè)常用的組學(xué)技術(shù)之一，該技術(shù)無(wú)需對(duì)微生物分離培養(yǎng)，直接提取樣本里面所有微生物的基因組，利用合適的通用引物擴(kuò)增16S rDNA/18S rDNA /ITS等高變區(qū)或功能基因，采用高通量測(cè)序儀Miseq、Hiseq或Novaseq對(duì)其進(jìn)行測(cè)序，通過(guò)生物信息學(xué)分析可以獲得特定實(shí)驗(yàn)樣品中細(xì)菌、真菌或古菌等的物種組成、物種豐度、系統(tǒng)進(jìn)化、群落比較等諸多信息。
16S rDNA測(cè)序
16S rDNA為編碼原核生物核糖體小亞基rRNA的DNA序列，具有10個(gè)保守區(qū)域和9個(gè)可變區(qū)域，其中保守區(qū)在細(xì)菌間差異不大（反映了生物物種間的親緣關(guān)系），可變區(qū)具有屬或種的特異性。對(duì)16S rDNA某個(gè)可變區(qū)進(jìn)行測(cè)序，可用于研究微生物中細(xì)菌或古菌的群落結(jié)構(gòu)多樣性。
原核微生物的16S rRNA基因長(zhǎng)度約為1500 bp，二代測(cè)序平臺(tái)對(duì)應(yīng)擴(kuò)增引物一般選用V3-V4區(qū)域或V4區(qū)域，三代測(cè)序平臺(tái)可選用全長(zhǎng)擴(kuò)增引物（27F/1492R）。
圖1. 16S rDNA基因序列組成示意圖
（藍(lán)色為可變區(qū)，白色為保守區(qū)）
18S rDNA測(cè)序
18S rDNA為編碼真核生物核糖體小亞基rRNA的DNA序列。對(duì) 18S rDNA某個(gè)高變區(qū)進(jìn)行測(cè)序，用于研究環(huán)境樣本中真核微生物群落結(jié)構(gòu)多樣性。
真核微生物18S rRNA基因長(zhǎng)度1500-2000 bp，引物一般選用V4區(qū)域。
圖2. 18S rDNA基因序列組成示意圖
（藍(lán)色為可變區(qū)，白色為保守區(qū)）
ITS測(cè)序
ITS分為兩個(gè)區(qū)域：ITS1和 ITS2，ITS1位于真核生物rDNA序列18S和 5.8S之間，ITS2位于真核生物rDNA序列5.8S和28S之間。對(duì)ITS1（350 bp）或ITS2（400 bp）進(jìn)行測(cè)序，用于研究環(huán)境微生物中真菌群落結(jié)構(gòu)多樣性。
ITS區(qū)長(zhǎng)度則為400-900 bp，引物一般選用ITS1區(qū)域。
（藍(lán)色為可變區(qū)，白色為保守區(qū)）
宏條形碼測(cè)序
目標(biāo)區(qū)域擴(kuò)增子測(cè)序
產(chǎn)品介紹
16S rDNA文庫(kù)建庫(kù)試劑盒利用高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)16S rDNA中V3-V4或V4區(qū)片段進(jìn)行擴(kuò)增，結(jié)合生物信息學(xué)技術(shù)，檢測(cè)特定環(huán)境下的微生物，鑒定所檢細(xì)菌種類，提供環(huán)境樣本物種分類、物種豐度、種群結(jié)構(gòu)、系統(tǒng)進(jìn)化等諸多信息。試劑盒中包含進(jìn)行細(xì)菌16S rDNA擴(kuò)增的所有試劑、16S PCR擴(kuò)增引物F/R，組合Illumina 和MGI平臺(tái) Index 引物試劑盒用于16S rDNA片段的擴(kuò)增。
產(chǎn)品應(yīng)用
科學(xué)研究：進(jìn)行微生物群落結(jié)構(gòu)和功能研究；
臨床監(jiān)測(cè)：用于疾病診斷、感染控制和治療監(jiān)測(cè)；
環(huán)境監(jiān)測(cè)：評(píng)估環(huán)境樣本中的微生物多樣性和污染情況；
農(nóng)業(yè)研究：研究土壤微生物群落對(duì)作物生長(zhǎng)的影響；
能源領(lǐng)域：特殊功能的菌株、基因挖掘、工程菌的開(kāi)發(fā)；
食品相關(guān)監(jiān)測(cè)：檢測(cè)和控制食品中的微生物污染。
產(chǎn)品特點(diǎn)
適用多樣本類型：兼容大多數(shù)常見(jiàn)環(huán)境樣本，如土壤、糞便、水體、生物膜等；
高效率擴(kuò)增：靈敏度低至0.1 ng，特異性優(yōu)，均一性好；
測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量高：低背景、高覆蓋度、高均一性。
性能展示
產(chǎn)品信息
應(yīng)用方向 | 產(chǎn)品名稱 | 貨號(hào) | 規(guī)格 |
提取試劑盒 | MolPure® Mag Soil/Stool DNA Kit 磁珠法土壤/糞便DNA提取試劑盒 | 18526ES20 | 20 T |
18526ES50 | 50 T | ||
16S rDNA鑒定 |
16S（V3-V4）Bacterial AmpSeq Prep Kit ForIllumina | 12983ES08 | 8 T |
12983ES24 | 24 T | ||
12983ES96 | 96 T | ||
16S（V4）Bacterial Metagenomic Library Construction Kit For MGI | 12933ES08 | 8 T | |
12933ES24 | 24 T | ||
12933ES96 | 96 T | ||
16S/18S/ITS/宏條形碼/功能基因擴(kuò)增子等 | 2×Hieff NGS® HG MμLtiplex PCR Master Mix | 13283ES03 | 1 mL |
13283ES08 | 5×1mL | ||
16S 全長(zhǎng)多重?cái)U(kuò)增試劑 | 2×Hieff® Ultra-Long PCR Master Mix | 10158ES03 | 1 mL |
