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核酸電泳是分子生物學(xué)研究中的一項基本技術(shù),廣泛應(yīng)用于基因克隆、DNA指紋分析、RNA表達研究等領(lǐng)域。這項技術(shù)的核心在于利用電場驅(qū)動DNA或RNA分子通過凝膠基質(zhì),實現(xiàn)不同大小分子的分離。盡管核酸電泳的原理相對簡單,但其往往影響最終的成果展示。所以在實際操作過程中,如何提高電泳效率、獲得更清晰的條帶一直是研究人員追求的目標。小翌將分享一些實用的實驗室小竅門,以幫助各位科研小伙伴們提高電泳效率~
電泳槽
選擇合適的凝膠濃度和電泳緩沖液
凝膠濃度對電泳分離效率有著直接影響。瓊脂糖是常用的凝膠材料,其濃度通常在0.7%至2%之間選擇。濃度越高,凝膠的分子孔徑越小,DNA遷移速率越慢,但分辨率越高。反之,濃度越低,DNA遷移速率越快,但分辨率較低。電泳緩沖液的組成對DNA的遷移速度和分離效率同樣重要。因此,針對實驗?zāi)康牟煌x擇合適的凝膠濃度與適配的電泳緩沖液。
瓊脂糖濃度 | 有效分離范圍(bp) | 推薦緩沖液 |
0.5% | 2,000-50,000 | 1×TAE |
0.8% | 800-10,000 | 1×TAE |
1.0% | 400-8,000 | 1×TAE |
1.2% | 300-7,000 | 1×TAE |
1.5% | 200-3,000 | 1×TAE/0.5×TBE |
2.0% | 100-2,000 | 1×TAE/0.5×TBE |
3.0% | 25-1,000 | 0.5×TBE |
TAE緩沖液
TAE緩沖液含有乙酸(Acetic acid)、EDTA和Tris,適合用于快速電泳和大片段DNA的分離。乙酸的存在降低了凝膠的pH值,有助于提高電泳速度。
TBE緩沖液
TBE緩沖液含有硼酸(Boric acid)、EDTA和Tris,其離子強度較高,適合用于小片段DNA的高分辨率分離。硼酸根離子的存在增強了凝膠的穩(wěn)定性,有助于提高分離效率。因此凝膠濃度越大,需采用TEB緩沖液,便于分離條帶。
小翌有多種瓊脂糖,適合不同的應(yīng)用場景,供大家選擇~
樣品準備
DNA純化
確保DNA樣品的純度,避免蛋白質(zhì)、多糖和其它雜質(zhì)的污染,這可以通過適當(dāng)?shù)募兓襟E實現(xiàn)。純化的DNA樣品能夠提供清晰的電泳條帶,減少背景干擾。
DNA Marker
選擇背景干凈、帶型穩(wěn)定、大小精準的DNA Marker,如翌圣GoldBand系列DNA Marker(Cat#10501ES-10518ES)。
均勻加樣
加樣技巧
使用加樣器時保持平穩(wěn),右手執(zhí)移液槍,左手扶在移液槍前方細柄處,斜角45℃懸空插入點樣孔中2-3 mm處點樣。盡量避免戳破凝膠,避免樣品接觸凝膠表面,減少樣品擴散。均勻的加樣能夠確保DNA片段在凝膠中的一致遷移,避免條帶扭曲或模糊。
加樣量
控制適當(dāng)?shù)募訕恿?,過量的樣品會導(dǎo)致條帶模糊。適量的加樣能夠保證條帶的清晰度和可讀性,其上樣量與核酸電泳制膠時的梳子大小相關(guān)。
梳子厚度(mm) | 梳子孔寬(mm) | 每孔最大上樣量(μL) | 推薦上樣量(μL) |
1.0 | ~3 | ~15 | 5-10 |
1.5 | ~4.2 | ~25 | 10-15 |
1.5 | ~7 | ~50 | 20-40 |
2.0 | ~1.5 | ~200 | 80-150 |
電泳條件
電壓控制
根據(jù)凝膠長度和厚度調(diào)整電壓,過高的電壓會導(dǎo)致熱量積累,影響DNA的遷移。適宜的電壓設(shè)置有助于保持恒定的電泳速度,避免條帶扭曲。
恒壓電泳
優(yōu)先選擇恒壓電泳而非恒流電泳,以保持電場強度的穩(wěn)定。恒壓電泳能夠減少電泳過程中的熱效應(yīng),提高分離效率。但需注意電壓控制在110-130v為佳,過高電壓易造成不穩(wěn)定脈沖,影響電泳效果。
電壓過高造成的條帶模糊
預(yù)電泳
如果是新鮮配制的緩沖液,在加樣前進行預(yù)電泳,可以清除凝膠中的雜質(zhì)和氣泡,平衡凝膠孔隙中的離子濃度,減少樣品遷移過程中的阻力,提高電泳效率。預(yù)電泳時間一般建議5-10分鐘。
使用新鮮凝膠
避免重復(fù)使用
重復(fù)使用的凝膠可能會因緩沖液的滲入而改變孔隙大小,影響分離效果。新鮮凝膠能夠提供一致的孔隙率,保證電泳結(jié)果的可重復(fù)性。
核酸染料的選擇
安全染料
使用YeaRed(Cat#10202ES)或YeaGreen(Cat#10204ES)無毒核酸染料,避免使用EB等有毒染料,減少紫外光暴露風(fēng)險。安全染料不僅對操作人員更安全,而且對環(huán)境的影響更小。
小翌希望通過上述小竅門的實施,可以幫助大家顯著提高核酸電泳的分離效率和結(jié)果的清晰度,進一步提高實驗的效率和安全性~
產(chǎn)品推薦
產(chǎn)品名稱 | 產(chǎn)品編號 | 規(guī)格 |
YeaRed 核酸染料(10,000×水溶液) | 10202ES76 | 500 μL |
YeaGreen Nucleic Acid Gel Stain (10,000×in Water) 核酸染料 | 10204ES76 | 500 μL |
Agarose瓊脂糖 | 10208ES60/76 | 100 g/500 g |
GoldBand DL2,000 DNA Marker | 10501ES60/80 | 100 T/10×100 T |
GoldBand DL600 DNA Marker | 10502ES60/80 | 100 T/10×100 T |
GoldBand DL5,000 DNA Marker | 10504ES60/80 | 100 T/10×100 T |
GoldBand DL10000 DNA Marker | 10505ES60/80 | 100 T/10×100 T |
GoldBand 100 bp DNA ladder | 10507ES60/80 | 100 T/10×100 T |
GoldBand 1 kb DNA ladder | 10510ES60/80 | 100 T/10×100 T |
GoldBand Full-Scale DNA Ladder | 10511ES80 | 1 mL |
GoldBand 15000 DNA Marker | 10512ES60/80 | 100 T/10×100 T |
GoldBand 50bp DNA Ladder | 10515ES60/80 | 100 T/10×100 T |
GoldBand 100bp plus DNA Ladder | 10516ES60/80 | 100 T/10×100 T |
GoldBand 200 bp DNA Ladder | 10517ES60/80 | 100 T/10×100 T |
GoldBand 500 bp DNA Ladder | 10518ES60/80 | 100 T/10×100 T |