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干貨 | DNA電泳優(yōu)化寶典,讓條帶清晰可見!

2024-10-15  閱讀(181)

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核酸電泳是分子生物學(xué)研究中的一項基本技術(shù),廣泛應(yīng)用于基因克隆、DNA指紋分析、RNA表達研究等領(lǐng)域。這項技術(shù)的核心在于利用電場驅(qū)動DNA或RNA分子通過凝膠基質(zhì),實現(xiàn)不同大小分子的分離。盡管核酸電泳的原理相對簡單,但其往往影響最終的成果展示。所以在實際操作過程中,如何提高電泳效率、獲得更清晰的條帶一直是研究人員追求的目標。小翌將分享一些實用的實驗室小竅門,以幫助各位科研小伙伴們提高電泳效率~

 

電泳槽

 

 

小竅門1
 

選擇合適的凝膠濃度和電泳緩沖液

凝膠濃度對電泳分離效率有著直接影響。瓊脂糖是常用的凝膠材料,其濃度通常在0.7%至2%之間選擇。濃度越高,凝膠的分子孔徑越小,DNA遷移速率越慢,但分辨率越高。反之,濃度越低,DNA遷移速率越快,但分辨率較低。電泳緩沖液的組成對DNA的遷移速度和分離效率同樣重要。因此,針對實驗?zāi)康牟煌x擇合適的凝膠濃度與適配的電泳緩沖液。

 

瓊脂糖濃度

有效分離范圍(bp)

推薦緩沖液

0.5%

2,000-50,000

1×TAE

0.8%

800-10,000

1×TAE

1.0%

400-8,000

1×TAE

1.2%

300-7,000

1×TAE

1.5%

200-3,000

1×TAE/0.5×TBE

2.0%

100-2,000

1×TAE/0.5×TBE

3.0%

25-1,000

0.5×TBE

 

 

TAE緩沖液

TAE緩沖液含有乙酸(Acetic acid)、EDTA和Tris,適合用于快速電泳和大片段DNA的分離。乙酸的存在降低了凝膠的pH值,有助于提高電泳速度。

 
 
 
 

TBE緩沖液

TBE緩沖液含有硼酸(Boric acid)、EDTA和Tris,其離子強度較高,適合用于小片段DNA的高分辨率分離。硼酸根離子的存在增強了凝膠的穩(wěn)定性,有助于提高分離效率。因此凝膠濃度越大,需采用TEB緩沖液,便于分離條帶。

 
 
 

 

小翌有多種瓊脂糖,適合不同的應(yīng)用場景,供大家選擇~

 

 

 

小竅門2
 

樣品準備

 

DNA純化

確保DNA樣品的純度,避免蛋白質(zhì)、多糖和其它雜質(zhì)的污染,這可以通過適當(dāng)?shù)募兓襟E實現(xiàn)。純化的DNA樣品能夠提供清晰的電泳條帶,減少背景干擾。

 
 
 
 

DNA Marker

選擇背景干凈、帶型穩(wěn)定、大小精準的DNA Marker,如翌圣GoldBand系列DNA Marker(Cat#10501ES-10518ES)。

 

 
 
 

 

 

小竅門3
 

均勻加樣

 

加樣技巧

使用加樣器時保持平穩(wěn),右手執(zhí)移液槍,左手扶在移液槍前方細柄處,斜角45℃懸空插入點樣孔中2-3 mm處點樣。盡量避免戳破凝膠,避免樣品接觸凝膠表面,減少樣品擴散。均勻的加樣能夠確保DNA片段在凝膠中的一致遷移,避免條帶扭曲或模糊。

 
 
 
 

加樣量

控制適當(dāng)?shù)募訕恿?,過量的樣品會導(dǎo)致條帶模糊。適量的加樣能夠保證條帶的清晰度和可讀性,其上樣量與核酸電泳制膠時的梳子大小相關(guān)。

 

梳子厚度mm

梳子孔寬mm

每孔最大上樣量μL)

推薦上樣量(μL)

1.0

~3

~15

5-10

1.5

~4.2

~25

10-15

1.5

~7

~50

20-40

2.0

~1.5

~200

80-150

 
 
 

 

 

小竅門4
 

電泳條件

 

電壓控制

根據(jù)凝膠長度和厚度調(diào)整電壓,過高的電壓會導(dǎo)致熱量積累,影響DNA的遷移。適宜的電壓設(shè)置有助于保持恒定的電泳速度,避免條帶扭曲。

 
 
 
 

恒壓電泳

優(yōu)先選擇恒壓電泳而非恒流電泳,以保持電場強度的穩(wěn)定。恒壓電泳能夠減少電泳過程中的熱效應(yīng),提高分離效率。但需注意電壓控制在110-130v為佳,過高電壓易造成不穩(wěn)定脈沖,影響電泳效果。

 

電壓過高造成的條帶模糊

 
 
 

 

 

小竅門5
 

預(yù)電泳

如果是新鮮配制的緩沖液,在加樣前進行預(yù)電泳,可以清除凝膠中的雜質(zhì)和氣泡,平衡凝膠孔隙中的離子濃度,減少樣品遷移過程中的阻力,提高電泳效率。預(yù)電泳時間一般建議5-10分鐘。

 

 

小竅門6
 

使用新鮮凝膠

 

避免重復(fù)使用

重復(fù)使用的凝膠可能會因緩沖液的滲入而改變孔隙大小,影響分離效果。新鮮凝膠能夠提供一致的孔隙率,保證電泳結(jié)果的可重復(fù)性。

 

 

小竅門7
 

核酸染料的選擇

 

安全染料

使用YeaRed(Cat#10202ES)或YeaGreen(Cat#10204ES)無毒核酸染料,避免使用EB等有毒染料,減少紫外光暴露風(fēng)險。安全染料不僅對操作人員更安全,而且對環(huán)境的影響更小。

 

 
 
 

 

小翌希望通過上述小竅門的實施,可以幫助大家顯著提高核酸電泳的分離效率和結(jié)果的清晰度,進一步提高實驗的效率和安全性~

 

 

產(chǎn)品推薦

 

產(chǎn)品名稱

產(chǎn)品編號

規(guī)格

YeaRed 核酸染料(10,000×水溶液)

10202ES76

500 μL

YeaGreen Nucleic Acid Gel Stain (10,000×in Water) 核酸染料

10204ES76

500 μL

Agarose瓊脂糖

10208ES60/76

100 g/500 g

GoldBand DL2,000 DNA Marker

10501ES60/80

100 T/10×100 T

GoldBand DL600 DNA Marker

10502ES60/80

100 T/10×100 T

GoldBand DL5,000 DNA Marker

10504ES60/80

100 T/10×100 T

GoldBand DL10000 DNA Marker

10505ES60/80

100 T/10×100 T

GoldBand 100 bp DNA ladder

10507ES60/80

100 T/10×100 T

GoldBand 1 kb DNA ladder

10510ES60/80

100 T/10×100 T

GoldBand Full-Scale DNA Ladder

10511ES80

1 mL

GoldBand 15000 DNA Marker

10512ES60/80

100 T/10×100 T

GoldBand 50bp DNA Ladder

10515ES60/80

100 T/10×100 T

GoldBand 100bp plus DNA Ladder

10516ES60/80

100 T/10×100 T

GoldBand 200 bp DNA Ladder

10517ES60/80

100 T/10×100 T

GoldBand 500 bp DNA Ladder

10518ES60/80

100 T/10×100 T

 


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