詳細(xì)介紹
?
服務(wù)流程:
接受訂單及樣品——RNA提取——RNA質(zhì)量檢測——樣品cDNA合成——定量試驗(yàn)——數(shù)據(jù)分析——結(jié)果交付——售后服務(wù)。
產(chǎn)品名稱 | 產(chǎn)品規(guī)格 | 貨號 |
轉(zhuǎn)基因品系玉米676探針法qPCR試劑盒 | 50T | FS-L63979 |
實(shí)驗(yàn)注意事項:
1)RT-PCR可以檢測組織、細(xì)胞、血液、細(xì)菌等很多材料,不同的樣本有不同要求,實(shí)驗(yàn)前請充分溝通確認(rèn)實(shí)驗(yàn)方案和樣本情況;
2)客戶盡可能提供實(shí)驗(yàn)的背景信息、物種、基因準(zhǔn)確的名稱和ID號;
3)客戶盡量不要提供DNA或RNA樣品。
4)樣本保存于液氮或干冰,也可以保存于Trizol液中。
實(shí)時熒光定量PCR(quantitative real-time PCR,qPCR)是指在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團(tuán),利用熒光信號積累實(shí)時監(jiān)測整個PCR進(jìn)程,通過標(biāo)準(zhǔn)曲線對未知模板進(jìn)行定量分析的方法。實(shí)時熒光定量PCR的化學(xué)原理包括探針類和非探針類兩類,探針類是利用與靶細(xì)胞序列特異性雜交的探針來指示擴(kuò)增產(chǎn)物的增加,非探針類是利用熒光染料或者特異性設(shè)計的引物來指示擴(kuò)增的增加。運(yùn)用該技術(shù)可以對DNA、RNA樣品進(jìn)行定量(包括定量和相對定量)和定性分析。主要服務(wù):DNA或RNA的定量分析、基因表達(dá)差異分析、基因分型。
實(shí)驗(yàn)過程:
一、試劑準(zhǔn)備
1. DNA模板
2.對應(yīng)目的基因的特異引物(在PCR反應(yīng)中,新合成的DNA是要接在一小段序列上才能繼續(xù)按照模板DNA復(fù)制,而不能從無到有,憑空合成。這一小段序列就是你所要有設(shè)計的引物??梢允荄NA也可以是RNA,一般20多bp,需要根據(jù)你的模板鏈設(shè)計。因此,擴(kuò)增不同的基因需要設(shè)計不同的引物)
3.10×PCR Buffer
4.2mM dNTPmix:含dATP、dCTP、dGTP、dTTP各2mM
5.Taq酶
二、操作步驟
1.在冰浴中,按以下次序?qū)⒏鞒煞旨尤胍粺o菌0.5ml離心管中。
10×PCR buffer 5μl
dNTP mixl 4μl
引物1(10pM) 2μl
引物2(10PM) 2μl
Taq酶(2U/μl) 1μl
DNA模板(50ng-1μg/μl) 1 μl
加ddH2O至 50 μl
視PCR儀有無熱蓋,不加或添加石蠟油。
2.調(diào)整好反應(yīng)程序。將上述混合液稍加離心,立即置PCR儀上,執(zhí)行擴(kuò)增。一般:在93℃預(yù)變性3-5min,進(jìn)入循環(huán)擴(kuò)增階段:93℃ 40s → 58℃ 30s → 72℃ 60s,循環(huán)30-35次,后在72℃ 保溫7min。
3.結(jié)束反應(yīng),PCR產(chǎn)物放置于4℃待電泳檢測或-20℃長期保存。
4.PCR的電泳檢測:如在反應(yīng)管中加有石蠟油,需用100μlLuFang進(jìn)行抽提反應(yīng)混合液,以除去石蠟油;否則,直接取5-10μl電泳檢測。
檢測方法包括以下步驟:
(1)將參照基因與待測目的基因片段等比例連接,克隆到同一個質(zhì)粒載體上,構(gòu)建一種可同時用于參照基因以及待測目的基因擴(kuò)增檢測的標(biāo)準(zhǔn)品,并將所得標(biāo)準(zhǔn)品按照濃度梯度稀釋后同時用于繪制參照基因以及待測目的基因的標(biāo)準(zhǔn)曲線;
(2)待測樣本與步驟(1)所述標(biāo)準(zhǔn)品經(jīng)同步進(jìn)行實(shí)時熒光定量PCR擴(kuò)增后,目的基因與參照基因按照各自的標(biāo)準(zhǔn)曲線計算各自的拷貝數(shù),計算待測樣本的目的基因與參照基因拷貝數(shù)比值,即得目的基因的拷貝數(shù)相對定量檢測結(jié)果。
其中步驟(1)為:將參照基因與待測目的基因片段等比例連接,克隆到同一個質(zhì)粒載體上,構(gòu)建一種可同時用于參照基因以及待測目的基因擴(kuò)增檢測的標(biāo)準(zhǔn)品,并將所得標(biāo)準(zhǔn)品按照濃度梯度稀釋后同時用于繪制參照基因以及待測目的基因的標(biāo)準(zhǔn)曲線。
其中所述參照基因?yàn)楸绢I(lǐng)域常規(guī)參照基因,較佳地管家基因,優(yōu)選地為RPPH1的擴(kuò)增區(qū)域,其中所述質(zhì)粒載體為本領(lǐng)域常規(guī)質(zhì)粒載體,較佳地為PCR克隆載體,優(yōu)選地為TA cloning載體,所述TA cloning載體較佳地為pMD18-T載體。其中所述標(biāo)準(zhǔn)品的核酸序列如序列表中SEQ ID NO:6所示。所述的等比例較佳地為1:1。由于標(biāo)準(zhǔn)品中待測目的基因與參照基因的比例為1:1,解決了目前相對標(biāo)準(zhǔn)曲線法應(yīng)用中目的基因與參照基因的濃度比例關(guān)系難以控制的問題,提高HER2基因擴(kuò)增檢測的可靠性。
步驟(2)為:待測樣本與步驟(1)所述標(biāo)準(zhǔn)品經(jīng)同步進(jìn)行實(shí)時熒光定量PCR擴(kuò)增后,目的基因與參照基因按照各自的標(biāo)準(zhǔn)曲線計算各自的拷貝數(shù),計算待測樣本的目的基因與參照基因拷貝數(shù)比值,即得目的基因的拷貝數(shù)相對定量檢測結(jié)果。
其中所述待測目的基因?yàn)楸绢I(lǐng)域常規(guī)待測目的基因,較佳地為腫瘤或者疾病的特異性基因,更佳地為HER2基因的擴(kuò)增區(qū)域,所述熒光定量PCR擴(kuò)增為本領(lǐng)域常規(guī)熒光定量PCR擴(kuò)增方法,所述熒光定量PCR擴(kuò)增方法較佳地為多通道熒光定量PCR擴(kuò)增,更佳地為雙通道熒光定量PCR擴(kuò)增。
儲存條件:
14℃或-20℃樣品收集、處理及保存方法
1. 血清:使用不含熱原和內(nèi)毒素的試管,操作過程中避免任何細(xì)胞刺激,收集血液后,3000 轉(zhuǎn)離心10 分鐘將血清和紅細(xì)胞迅速小心地分離。
2. 血漿:EDTA、檸檬酸鹽或肝素抗凝。3000 轉(zhuǎn)離心30 分鐘取上清。
3. 細(xì)胞上清液:3000 轉(zhuǎn)離心10 分鐘去除顆粒和聚合物。
4. 組織勻漿:將組織加入適量生理鹽水搗碎。3000 轉(zhuǎn)離心10 分鐘取上清。
5. 保存:如果樣本收集后不及時檢測,請按一次用量分裝,凍存于-20℃,避免反復(fù)凍融,在室溫下解凍并確保樣品均勻地充分解凍。
純化RNA樣品儲存液 anti-EPO antibody(anti-Erythropoietin antibody) 20 ul
mRNA純化樹脂再生 fFN(fetal Fibronectin) 100 ul
RNA比色法定量 LIPE(Hormone-sensitive lipase) 100 ul
RNA熒光(RiboGreen)定量 2, 5-OAS(2, 5-oligoadenylate synthetase) 100 ul
兩步法RT-PCR MDA(Malonyldehyde) 20 ul
一步法RT-PCR IL-12RB1(Interleukin-12 receptor subunit beta-1 78) 10 mg
直接細(xì)胞克隆兩步法逆轉(zhuǎn)錄PCR NPTN(Neuroplastin) 100 ul
兩步法RT-PCR熒光定量 AP12(Apelin 12) 100 ul
逆轉(zhuǎn)錄RT HGS(Hepatocyte growth factor-regulated tyrosine kinase substRate) 100 ul
體外RNA轉(zhuǎn)錄合成 calprotectin 1 mg
體外加帽RNA轉(zhuǎn)錄合成 Thrombin 100 ul
RNasin(核糖核酸酶抑制劑) LPS IgG(lipopolysaccharide IgG) 100 ul
MMLV(H點(diǎn)突變) SCRG1(Scrapie responsive protein 1) 20 ul
Oligo(dT)18(500納克/微升) HGS(Hepatocyte growth factor-regulated tyrosine kinase substRate) 100 ul
Hexamer(隨機(jī)引物)(200納克/微升) AP12(Apelin 12) 20 ul
SOCS calprotectin 100 ul
轉(zhuǎn)基因品系玉米676探針法qPCR試劑盒蘇云金芽胞桿菌種屬: Bacillus│thuringiensis分離基物: 1-5cm土壤提供形式: 凍干物安全等級: 1模式菌株: no應(yīng)用領(lǐng)域: 科研研究培養(yǎng)基: 0002生長條件: 30℃存儲條件: -80℃冰箱凍結(jié)法;真空冷凍干燥法;礦物油法
Termitomyces│albuminosus提供形式: 斜面培養(yǎng)物安全等級: 1模式菌株: no培養(yǎng)基: 0014生長條件: 25℃存儲條件: 液氮超低溫凍結(jié)法;礦物油法;定期移植法
淺紫灰鏈霉菌種屬: Streptomyces│lavendulae分離基物: 窖泥提供形式: 凍干物安全等級: 1模式菌株: no培養(yǎng)基: 0012生長條件: 28-30℃存儲條件: 液氮超低溫凍結(jié)法;真空冷凍干燥法
Alternaria│sp.分離基物: 柏樹枝的韌皮部提供形式: 斜面培養(yǎng)物;凍干物安全等級: 1模式菌株: no應(yīng)用領(lǐng)域: 分類學(xué)及植物內(nèi)共生真菌的研究培養(yǎng)基: 14生長條件: 28℃存儲條件: 真空冷凍干燥法;礦物油法;定期移植法
黃曲霉柱頭變種種屬: Aspergillus│flavus var. columnaris提供形式: 凍干物安全等級: 2模式菌株: no培養(yǎng)基: 0015生長條件: 25-28℃存儲條件: 液氮超低溫凍結(jié)法;真空冷凍干燥法
Flammulina│vutipes提供形式: 斜面培養(yǎng)物安全等級: 1模式菌株: no應(yīng)用領(lǐng)域: 食用培養(yǎng)基: 0014生長條件: 25℃存儲條件: 液氮超低溫凍結(jié)法;礦物油法;定期移植法
Schizophyllum│commune Fr.分離基物: 基質(zhì)提供形式: 斜面培養(yǎng)物安全等級: 1模式菌株: no培養(yǎng)基: 14生長條件: 25存儲條件: 定期移植法
Acidithiobacillus ferrooxidans (Temple and Colmer 1951) Kly and Wood 2000模式菌株: 未知
Aspergillus│fumigatus var. lipticus分離基物: 土壤提供形式: 凍干物安全等級: 2模式菌株: no培養(yǎng)基: 0015生長條件: 25-28℃存儲條件: 液氮超低溫凍結(jié)法;真空冷凍干燥法