RNA-seq即轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)，就是用高通量測序技術(shù)進(jìn)行測序分析，反映出mRNA,smallRNA,noncodingRNA等或者其中一些的表達(dá)水平。

在過去的十年中，RNA-Seq技術(shù)迅速發(fā)展，并成為了在轉(zhuǎn)錄組水平上分析差異基因表達(dá)/mRNA可變剪切的*的工具。隨著下一代測序技術(shù)的發(fā)展，RNA-Seq技術(shù)應(yīng)用范圍變得更加廣泛：一是在RNA生物學(xué)領(lǐng)域，RNA-Seq可以應(yīng)用于單細(xì)胞基因表達(dá)/蛋白質(zhì)表達(dá)/RNA結(jié)構(gòu)的分析；二是空間轉(zhuǎn)錄組的概念也逐漸興起。長讀長/直接RNA-Seq技術(shù)以及更好的數(shù)據(jù)分析計算工具有助于生物學(xué)家們利用RNA-seq加深對RNA生物學(xué)的理解——例如轉(zhuǎn)錄何時何地開始；體內(nèi)折疊和分子間作用如何影響RNA功能等問題。