計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)-藥物虛擬篩選-昊然科研新方向

昊然生物科研新方向：計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)，包括藥物發(fā)現(xiàn)、藥物靶點(diǎn)預(yù)測(cè)、藥物靶標(biāo)發(fā)現(xiàn)、先導(dǎo)化合物篩選、藥物設(shè)計(jì)服務(wù)、靶標(biāo)預(yù)測(cè)服務(wù)、藥物虛擬篩選、藥物/小分子定制合成、化合物結(jié)構(gòu)優(yōu)化、活性/藥物篩選、虛擬新藥篩選服務(wù)。昊然生物小編分享藥物虛擬篩選一起來(lái)看：

虛擬篩選(virtual screening，vs)是指基于藥物設(shè)計(jì)理論，借助計(jì)算機(jī)的技術(shù)和專(zhuān)業(yè)應(yīng)用軟件，從大量化合物中挑選出一些有苗頭的化合物，進(jìn)行實(shí)驗(yàn)活性評(píng)價(jià)的一種方法，其目的是從幾十個(gè)乃至百萬(wàn)個(gè)分子中篩選出新的先導(dǎo)化合物。

從原理上來(lái)講，虛擬篩選可以分為兩類(lèi)，即基于受體( Receptor-based virtual screening )的虛擬篩選和基于配體(ligand-based virtual screening)的虛擬篩選。

基于配體的虛擬篩選：

藥效團(tuán)模型( pharmacophore modeling )、定量構(gòu)效關(guān)系(quantitative structure activity relationship ,QSAR)、結(jié)構(gòu)相似性方法（ structual similarity, SSIM)。

基于受體的虛擬篩選也稱(chēng)為基于結(jié)構(gòu)的虛擬篩選，利用分子對(duì)接技術(shù)，基于受體的三維結(jié)構(gòu)，在結(jié)合位點(diǎn)處自動(dòng)的匹配化合物數(shù)據(jù)庫(kù)中的小分子，然后對(duì)可能的結(jié)合模式運(yùn)用基于分子力場(chǎng)的打分函數(shù)進(jìn)行結(jié)合能計(jì)算，終得到化合物能量排名。

在新藥發(fā)現(xiàn)過(guò)程中,虛擬篩選的應(yīng)用可以富集活性化合物,降低篩選成本,提高藥物篩選的可行性,因此已成為新藥發(fā)現(xiàn)的重要方法。虛擬篩選與生物活性篩選的結(jié)合,可以?xún)?yōu)勢(shì)互補(bǔ),有效地促進(jìn)新藥的發(fā)現(xiàn)。

計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)相關(guān)內(nèi)容：

藥物發(fā)現(xiàn)

藥物靶點(diǎn)預(yù)測(cè)

藥物靶標(biāo)發(fā)現(xiàn)

先導(dǎo)化合物篩選

藥物設(shè)計(jì)服務(wù)

靶標(biāo)預(yù)測(cè)服務(wù)

藥物虛擬篩選

藥物/小分子定制合成

化合物結(jié)構(gòu)優(yōu)化

活性/藥物篩選

虛擬新藥篩選服務(wù)

昊然生物僅用于科研，RL2023.4