兼容常規(guī)與鏈特異性mRNA文庫(kù)構(gòu)建
Hieff NGS® MaxUp II Dual-mode mRNA Library Prep Kit for Illumina
——兼容常規(guī)與鏈特異性mRNA文庫(kù)構(gòu)建
背景簡(jiǎn)介
RNA被認(rèn)為是生物信息傳遞的“橋梁”。而轉(zhuǎn)錄組測(cè)序可利用NGS技術(shù)對(duì)組織或者細(xì)胞中的RNA反轉(zhuǎn)錄之后的cDNA文庫(kù)測(cè)序,通過(guò)分析可計(jì)算不同RNA的表達(dá)量、發(fā)現(xiàn)新的轉(zhuǎn)錄本、進(jìn)行轉(zhuǎn)錄本定位、分析可變剪切、檢測(cè)基因融合等,提供全面的轉(zhuǎn)錄組信息。
圖 遺傳學(xué)中心法則
目前主流的mRNA建庫(kù)主要流程是mRNA純化,mRNA逆轉(zhuǎn)錄,雙鏈cDNA合成,末端修復(fù),A尾添加,接頭連接,純化/分選,文庫(kù)擴(kuò)增,時(shí)間上需要1.5 d甚至更久。
翊圣生物結(jié)合自身多年的分子酶創(chuàng)新研發(fā)經(jīng)驗(yàn),推出升級(jí)版快速mRNA建庫(kù)試劑盒,可在短的時(shí)間進(jìn)行建庫(kù)。助力獲得優(yōu)異的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)。
亮點(diǎn)一覽
1、建庫(kù)快速:完整建庫(kù)比主流方法縮減1.5-2 h,1 d內(nèi)獲得高質(zhì)量文庫(kù)。
圖 升級(jí)版建庫(kù)試劑盒建庫(kù)流程
2、兼容常規(guī)與鏈特異性文庫(kù)構(gòu)建
本產(chǎn)品搭配兩種二鏈合成buffer,即含dNTP(常規(guī)建庫(kù))與dUTP(鏈特異性建庫(kù)),可兼容兩種模式的mRNA文庫(kù)構(gòu)建。一個(gè)盒子兩種用處,不用再額外備貨。
3、逆轉(zhuǎn)錄酶,更適合復(fù)雜模板
RNaseH能特異的降解RNA-DNA雜交分子中RNA的特性,將RNA降解成小片段,影響反轉(zhuǎn)錄效率。YEASEN提供的第四代Hifair逆轉(zhuǎn)錄酶,去除RNase H活性,同時(shí)溫度的耐受性高達(dá)65℃,有利于復(fù)雜RNA模板二級(jí)結(jié)構(gòu)的打開,更利于逆轉(zhuǎn)錄的進(jìn)行。
硬核支撐
以1 μg的標(biāo)準(zhǔn)品RNA(Agilent#740000)為起始,分別構(gòu)建鏈特異性文庫(kù)和非鏈特異性文庫(kù),質(zhì)控后的文庫(kù)用illumina Hiseq X-10 PE150測(cè)序。
a. 優(yōu)異的測(cè)序質(zhì)量
b. 表達(dá)重復(fù)性高
c. 優(yōu)異的文庫(kù)均一性
d. rRNA殘留更低,有用數(shù)據(jù)更多
e. 鏈特異性建庫(kù):98.5%的Reads比對(duì)到正義鏈上
客戶案例
單位:廣州某生物公司J*
樣本:草莓,油菜,核盤菌
結(jié)論:高質(zhì)量文庫(kù),優(yōu)異的測(cè)序數(shù)據(jù)
a. 文庫(kù)報(bào)告
b. 測(cè)序質(zhì)量
c. 數(shù)據(jù)比對(duì)
d. 數(shù)據(jù)分布
e. 基因覆蓋度分析
單位:上海某生物公司O*
樣本:人,大鼠,西瓜
結(jié)論:高質(zhì)量文庫(kù),優(yōu)異的測(cè)序數(shù)據(jù)
a. 建庫(kù)報(bào)告
b. 測(cè)序質(zhì)量
c. 數(shù)據(jù)比對(duì)
d. 數(shù)據(jù)分布
e. 基因覆蓋度分析
相關(guān)產(chǎn)品:
類型 | 名稱 | 貨號(hào) | 規(guī)格 |
建庫(kù)試劑盒 | Hieff NGS® MaxUpⅡ Dual mode mRNA Library Prep Kit for Illumina® | 12300ES24/96 | 24/96 T |
mRNA富集磁珠 | Hieff NGS® mRNA Isolation Master Kit | 12603ES24/96 | 24/96 T |
rRNA去除試劑盒 | Hieff NGS® MaxUp rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat) | 12253ES24/96 | 24/96 T |
RNA純化磁珠 | Hieff NGS® RNA Cleaner | 12602ES56/75 | 60/450 mL |
相關(guān)產(chǎn)品
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