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雙熒光素酶報告基因檢測數(shù)據(jù)集

2020-3-17  閱讀(2443)

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雙熒光素酶報告基因檢測數(shù)據(jù)集

 

雙熒光素酶報告基因檢測系統(tǒng)因其具有靈敏度高、無細胞內(nèi)源性表達干擾等優(yōu)勢,現(xiàn)已被廣泛用于基因表達調(diào)控的研究中。該系統(tǒng)包括螢火蟲熒光素酶(Firefly luciferase)和海腎熒光素酶(Renilla luciferase),通過和底物的相互作用檢測基因的表達。通常海腎熒光素酶相對更多地被用作轉(zhuǎn)染效率的內(nèi)參,以消除細胞數(shù)量和轉(zhuǎn)染效率的差異,實驗結(jié)果為螢火蟲熒光素酶的熒光值和海腎熒光素酶的熒光值的比值。

雙報告檢測方法的應(yīng)用十分廣泛,如調(diào)控元件功能研究、轉(zhuǎn)錄因子研究、信號轉(zhuǎn)導通路、miRNA調(diào)控等。通常把靶基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控元件或5’啟動子區(qū)克隆在luciferase的上游,與海腎TK載體共轉(zhuǎn)染至細胞中,以研究啟動子的強弱或轉(zhuǎn)錄因子對啟動子的作用;或把3’-UTR區(qū)克隆在luciferase的下游,以研究miRNA對目的基因的調(diào)控作用。

該試劑盒主要應(yīng)用于動物細胞中,當然也有很多小伙伴用于植物中,小翊這邊收集到了一些原始數(shù)據(jù)與大家分享。在這里分成動物細胞植物兩個part。以下案例均使用雙熒光素酶報告基因檢測試劑盒完成(Yeasen,CAT:11402)。

 

PartⅠ 動物細胞篇

 

1、驗證鞘磷脂代謝中關(guān)鍵酶A的活性是否受關(guān)注基因X的影響。

實驗方案:在293T、Caco-2和HIEC-6三種細胞中進行驗證。將A酶基因啟動子連接在Luc上,Luc-A、

Ren載體和X基因的過表達載體(空載作為對照)共轉(zhuǎn)染,通過promega_ GloMax Multi Plus酶標儀進行檢測。

實驗結(jié)果:

 

293T

Caco-2

HIEC-6

 

Con

Mars

Con

Mars

Con

Mars

Luc

79804

16397

3305

2160

1215

599

Ren

132550

19912

57334

32021

11629

4694

Ratio

0.609

0.856

0.058

0.070

0.104

0.128

 

 

實驗結(jié)論:從圖中結(jié)果可以看出,基因X過表達可以提高A酶活性,證明基因參與調(diào)節(jié)鞘磷脂代謝。

2、驗證cGAS150蛋白在293T里是否能激活干擾素通路。

實驗方案:構(gòu)建IFN-β-Luc質(zhì)粒,將其與Ren載體、cGAS150過表達載體共轉(zhuǎn)染293T細胞。使用Promega GLOMAX 20/20LUMINOMETER酶標儀進行后續(xù)檢測。

實驗結(jié)果:

 

Luc

IFN-β-Luc

cGAS150

Luc

240361

1028794

82904819

Ren

50899

87816

693114

Ratio

4.69

11.73

175.63

 

 

實驗結(jié)論:cGAS150蛋白可激活干擾素通路。

3、Poly(I:C)是雙鏈RNA的類似物,是一種干擾素的誘導劑。驗證其對干擾素X的調(diào)控作用。

實驗方案:構(gòu)建IFN-1-Luc載體,將其與Ren載體共轉(zhuǎn)染EPC細胞,給予Poly(I:C)處理24h。使用Promega;E5311酶標儀進行檢測。

實驗結(jié)果:

 

IFN-1-Luc

IFN-1-Luc+Poly(I:C)

Luc

57451

1023987

Ren

11690

15500

Ratio

4.91

65.02

 

實驗結(jié)論:Poly(I:C)會誘導IFN-1的表達。

4、驗證小鼠miR-1與靶基因3’UTR是否發(fā)生作用并進一步確定miR-1與靶基因3’UTR的作用位點。

實驗方案:構(gòu)建Luc-3UTR-WT載體和Luc-3UTR-mut載體,分別將它們與mimic NC/mimic miR共轉(zhuǎn)染293T細胞。使用Promega酶標儀進行檢測。

 

WT+mimic NC

WT+mimic miR

Mut+mimic NC

Mut+mimic miR

Luc

 182884

36516

177619

170722

Ren

  30279

32452

32489

30576

Radio

   6.08

1.11

5.47

5.58

實驗結(jié)果:

 

 

實驗結(jié)論:miR-1的作用靶點是 3’UTR。

5、驗證轉(zhuǎn)錄因子NRF1的野生型以及突變體形式對于其靶基因A的啟動子序列的調(diào)控作用,比較NRF1野生型以及突變體的轉(zhuǎn)錄活性差異。

注:PGC-1α作為核轉(zhuǎn)錄輔助因子,可輔助NRF-1的轉(zhuǎn)錄調(diào)控,在一定程度上增加NRF-1的活性。A則是被PGC-1α和NRF-1共同作用轉(zhuǎn)錄激活后轉(zhuǎn)運至線粒體。研究發(fā)現(xiàn),NRF-1通過與A基因啟動區(qū)反應(yīng)原件結(jié)合,刺激A基因的轉(zhuǎn)錄。

實驗方案:構(gòu)建Luc-A載體,NRF1 WT/mut表達載體,PGC-1α表達載體,將它們共轉(zhuǎn)染至HEK293T細胞。使用Promega 9100-102(421)酶標儀進行檢測。

實驗結(jié)果:

 

vector

PGC-1a

NRF1 WT+PGC1a

NRF1 WT+PGC1a

NRF1 mut1+PGC1a

NRF1 WT+PGC1a

NRF1 mut2+PGC1a

Luc

112317

91710

1453678

1618954

1577119

1890584

1700605

Ren

57429

45074

252462

256203

296715

317458

326011

Ratio

1.96

2.03

5.76

6.32

5.32

5.96

5.22

 

NRF1 WT+PGC1a

NRF1 mut3+PGC1a

NRF1 WT+PGC1a

NRF1 mut4+PGC1a

NRF1 WT+PGC1a

NRF1 mut5+PGC1a

 

Luc

2058569

1955671

2264558

1867001

2363028

1973545

 

Ren

356474

355662

351878

356324

365557

354973

 

Ratio

5.77

5.50

6.44

5.24

6.46

5.56

 

 

實驗結(jié)論:NRF1的1,2,4,5號突變體對其轉(zhuǎn)錄活性有抑制作用。

6、驗證小分子化合物9-cis-RA(sigma)是否為RXR的激動劑。

實驗方案: 構(gòu)建pBind-RXR α-LBD載體, 將其與 pG5 質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染293T細胞,同時用不同濃度的9-cis-RA(sigma)處理細胞。使用GloMax® Discover Microplate Reader_GM3000酶標儀進行檢測。

實驗結(jié)果:

 

con

9-Cis-low

9-Cis-high

Luc

1193

3952

44087

Ren

7815

5609

7045

Ratio

0.15

0.70

6.26

 

實驗結(jié)論:9-Cis-RA是RXR的激動劑,與文獻報道的相一致。

7、驗證IRF3轉(zhuǎn)錄因子與IFN-β啟動子的相互作用。

實驗方案: 構(gòu)建Luc-IFN-β載體,將其與IRF3表達載體、Ren載體共轉(zhuǎn)染HEK293T細胞。使用SpectraMax  L酶標儀進行檢測。

實驗結(jié)果:

 

Luc-IFN-β+pRL-TK

Luc-IFN-β+pRL-TK+IRF3

Luc

69576

462790

Ren

456979

16248

Ratio

0.15

26.14

 

 

實驗結(jié)論:轉(zhuǎn)錄因子IRF3對IFN-β啟動子正調(diào)控作用

8、驗證miR-375與A基因 3’UTR是否結(jié)合從而抑制A基因的表達。

實驗方案:分別構(gòu)建Luc-3UTR-WT載體和Luc-3UTR-mut載體。將它們與mimic NC/mimic miR共轉(zhuǎn)染MCF-7細胞。使用POLARstar Omega酶標儀進行檢測。

實驗結(jié)果:

 

WT+mimic-miR

mut+mimic-miR

WT+mimic NC

Luc

1430

914

650

Ren

41251

8206

5979

Ratio

0.041

0.11

0.10

 

實驗結(jié)論:3UTR-WT是miR-375的作用靶點。

9、驗證靶基因基因組中的部分基因片段是否發(fā)生作用并進一步確定這些基因與靶基因的作用位點。

實驗方案:構(gòu)建pGL-3 pro-Gene載體及Target gene表達載體,將它們與Ren載體共轉(zhuǎn)染至293T細胞中。通過BERTHOLD centro XS3 LB 900酶標儀進行檢測。

實驗結(jié)果:

 

Target gene

 

Gene1

Gene2

Gene3

Gene4

Gene5

pGL-3 pro-control

Luc

336072

634822

512443

153988

825272

1070842

Ren

464031

391284

417179

676539

572861

738308

Ratio

0.72

1.62

1.23

0.24

1.44

1.46

 

實驗結(jié)論:Target gene對Gene 1,4具有明顯的負向調(diào)控作用。

 

PartⅡ 植物篇

 

1、驗證在Y1H篩選后的6個不同轉(zhuǎn)錄因子,對目標基因的調(diào)控作用。

實驗方案:構(gòu)建Luc-目標基因啟動子載體和TF表達載體,將它們與Ren載體轉(zhuǎn)化至擬南芥的原生質(zhì)體中。通過MiKro Win2000酶標儀進行檢測。

實驗結(jié)果:

 

Con

TF1

TF2

TF3

TF4

TF5

TF6

Luc

305

972

914

1519

446

400

299

Ren

179498

57786

53551

113107

51685

56714

491297

Ratio

0.002

0.017

0.018

0.014

0.009

0.007

0.001

 

實驗結(jié)論:TF1-5對目標基因上調(diào),而TF6對目標基因起抑制作用。Luc數(shù)值偏低,可以調(diào)整質(zhì)粒的轉(zhuǎn)化比例、提高原生質(zhì)體和底物的使用量)

2、驗證預測的3個擬轉(zhuǎn)錄因子對目標基因的調(diào)控作用。

實驗方案:構(gòu)建Luc-目的基因啟動子載體和TF表達載體,將它們與Ren載體轉(zhuǎn)化至擬南芥的原生質(zhì)體中。通過MiKro Win2000酶標儀進行檢測。

實驗結(jié)果:

 

Con

DE4

GA16

TX2

Luc

621

177

2583

141

Ren

111199

282269

26308

97342

Ratio

0.006

0.001

0.099

0.002

 

 

實驗結(jié)論:GA16對目的基因起正向調(diào)控作用;DE4和TX2起負向調(diào)控作用。(Luc數(shù)值偏低,建議見上述案例

3、采用煙草葉片瞬時表達的方法檢測TF在體內(nèi)的轉(zhuǎn)錄活性。

實驗方案:報告載體含有5× GAL4激活域,其下游連接 Luc 基因;效應(yīng)載體含有TF基因,其上游連接GAL4 DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域,形成融合轉(zhuǎn)錄因子。將兩種載體轉(zhuǎn)化至農(nóng)桿菌,侵染煙草葉片。侵染24-36h后,將葉片打孔成1.5cm左右的葉盤。在2mL的EP管中放入3片左右的葉盤,加入液氮,放入預冷的小鋼珠進行研磨。加入裂解液,使用 SoftMax Pro Software(Molecular devices)酶標儀進行檢測。

 

實驗結(jié)果:

 

pBD

pBD-VP16

pBD-TF

Luc

18833

7291

50667

Ren

14333

3855

12012

Ratio

1.33

1.91

4.30

 

實驗結(jié)論:煙草雙熒光素酶檢測結(jié)果顯示,含有pBD-TF效應(yīng)載體的熒光值顯著高于陰性對照pBD陽性對照(pBD-VP16)熒光值。結(jié)果表明TF是活性很高的轉(zhuǎn)錄激活因子。

4、驗證轉(zhuǎn)錄因子X能否結(jié)合到基因A和B的啟動子區(qū)域從而激活其表達。

實驗方案:構(gòu)建Luc-A/B和TFX表達載體。將它們共轉(zhuǎn)化至農(nóng)桿菌中,侵染煙草葉片。2天后,將葉片打孔成1cm左右的葉盤。取3片放入2mL EP管中,加入液氮進行研磨。之后加入裂解液進行處理。用Mithras(LB940)酶標儀進行測定。

實驗結(jié)果:

 

A-Con

A-TFX

B-Con

B-TFX

Luc

386

397

373

411

Ren

1493602

1290175

25508

7345

Ratio

0.00026

0.00032

0.01507

0.05708

實驗結(jié)論: 轉(zhuǎn)錄因子X能結(jié)合到基因B的啟動子區(qū)域并激活其表達(p<0.005),但是無法結(jié)合到基因A的啟動子區(qū)域。Luc數(shù)值偏低,要確保研磨*,加大裂解液的使用量)

 

以上就是小翊收集到的雙熒光素酶相關(guān)數(shù)據(jù)了,希望對您有幫助。

 

相關(guān)產(chǎn)品

 

產(chǎn)品名稱

貨號

規(guī)格

價格(元)

*(元)

Dual Luciferase Reporter Gene Assay Kit 雙熒光素酶報告基因檢測試劑盒

11402ES60

100T

1265.00

752.00

Dual Luciferase Reporter Gene Assay Kit 雙熒光素酶報告基因檢測試劑盒

11402ES80

1000T

9965.00

6852.00

Luciferase Reporter Gene Assay Kit 螢火蟲熒光素酶報告基因檢測試劑盒

11401ES60

100T

349.00

/

Luciferase Reporter Gene Assay Kit 螢火蟲熒光素酶報告基因檢測試劑盒

11401ES76

500T

969.00

/

Luciferase Reporter Gene Assay Kit 螢火蟲熒光素酶報告基因檢測試劑盒

11401ES80

1000T

1748.00

/

 

HB200308

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