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雙熒光素酶報告基因檢測數(shù)據(jù)集
雙熒光素酶報告基因檢測系統(tǒng)因其具有靈敏度高、無細胞內(nèi)源性表達干擾等優(yōu)勢,現(xiàn)已被廣泛用于基因表達調(diào)控的研究中。該系統(tǒng)包括螢火蟲熒光素酶(Firefly luciferase)和海腎熒光素酶(Renilla luciferase),通過和底物的相互作用檢測基因的表達。通常海腎熒光素酶相對更多地被用作轉(zhuǎn)染效率的內(nèi)參,以消除細胞數(shù)量和轉(zhuǎn)染效率的差異,實驗結(jié)果為螢火蟲熒光素酶的熒光值和海腎熒光素酶的熒光值的比值。
雙報告檢測方法的應(yīng)用十分廣泛,如調(diào)控元件功能研究、轉(zhuǎn)錄因子研究、信號轉(zhuǎn)導通路、miRNA調(diào)控等。通常把靶基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控元件或5’啟動子區(qū)克隆在luciferase的上游,與海腎TK載體共轉(zhuǎn)染至細胞中,以研究啟動子的強弱或轉(zhuǎn)錄因子對啟動子的作用;或把3’-UTR區(qū)克隆在luciferase的下游,以研究miRNA對目的基因的調(diào)控作用。
該試劑盒主要應(yīng)用于動物細胞中,當然也有很多小伙伴用于植物中,小翊這邊收集到了一些原始數(shù)據(jù)與大家分享。在這里分成動物細胞和植物兩個part。以下案例均使用雙熒光素酶報告基因檢測試劑盒完成(Yeasen,CAT:11402)。
PartⅠ 動物細胞篇
1、驗證鞘磷脂代謝中關(guān)鍵酶A的活性是否受關(guān)注基因X的影響。
實驗方案:在293T、Caco-2和HIEC-6三種細胞中進行驗證。將A酶基因啟動子連接在Luc上,Luc-A、
Ren載體和X基因的過表達載體(空載作為對照)共轉(zhuǎn)染,通過promega_ GloMax Multi Plus酶標儀進行檢測。
實驗結(jié)果:
| 293T | Caco-2 | HIEC-6 | |||
| Con | Mars | Con | Mars | Con | Mars |
Luc | 79804 | 16397 | 3305 | 2160 | 1215 | 599 |
Ren | 132550 | 19912 | 57334 | 32021 | 11629 | 4694 |
Ratio | 0.609 | 0.856 | 0.058 | 0.070 | 0.104 | 0.128 |
實驗結(jié)論:從圖中結(jié)果可以看出,基因X過表達可以提高A酶活性,證明基因參與調(diào)節(jié)鞘磷脂代謝。
2、驗證cGAS150蛋白在293T里是否能激活干擾素通路。
實驗方案:構(gòu)建IFN-β-Luc質(zhì)粒,將其與Ren載體、cGAS150過表達載體共轉(zhuǎn)染293T細胞。使用Promega GLOMAX 20/20LUMINOMETER酶標儀進行后續(xù)檢測。
實驗結(jié)果:
| Luc | IFN-β-Luc | cGAS150 |
Luc | 240361 | 1028794 | 82904819 |
Ren | 50899 | 87816 | 693114 |
Ratio | 4.69 | 11.73 | 175.63 |
實驗結(jié)論:cGAS150蛋白可激活干擾素通路。
3、Poly(I:C)是雙鏈RNA的類似物,是一種干擾素的誘導劑。驗證其對干擾素X的調(diào)控作用。
實驗方案:構(gòu)建IFN-1-Luc載體,將其與Ren載體共轉(zhuǎn)染EPC細胞,給予Poly(I:C)處理24h。使用Promega;E5311酶標儀進行檢測。
實驗結(jié)果:
| IFN-1-Luc | IFN-1-Luc+Poly(I:C) |
Luc | 57451 | 1023987 |
Ren | 11690 | 15500 |
Ratio | 4.91 | 65.02 |
實驗結(jié)論:Poly(I:C)會誘導IFN-1的表達。
4、驗證小鼠miR-1與靶基因3’UTR是否發(fā)生作用并進一步確定miR-1與靶基因3’UTR的作用位點。
實驗方案:構(gòu)建Luc-3’UTR-WT載體和Luc-3’UTR-mut載體,分別將它們與mimic NC/mimic miR共轉(zhuǎn)染293T細胞。使用Promega酶標儀進行檢測。
| WT+mimic NC | WT+mimic miR | Mut+mimic NC | Mut+mimic miR |
Luc | 182884 | 36516 | 177619 | 170722 |
Ren | 30279 | 32452 | 32489 | 30576 |
Radio | 6.08 | 1.11 | 5.47 | 5.58 |
實驗結(jié)果:
實驗結(jié)論:miR-1的作用靶點是 3’UTR。
5、驗證轉(zhuǎn)錄因子NRF1的野生型以及突變體形式對于其靶基因A的啟動子序列的調(diào)控作用,比較NRF1野生型以及突變體的轉(zhuǎn)錄活性差異。
注:PGC-1α作為核轉(zhuǎn)錄輔助因子,可輔助NRF-1的轉(zhuǎn)錄調(diào)控,在一定程度上增加NRF-1的活性。A則是被PGC-1α和NRF-1共同作用轉(zhuǎn)錄激活后轉(zhuǎn)運至線粒體。研究發(fā)現(xiàn),NRF-1通過與A基因啟動區(qū)反應(yīng)原件結(jié)合,刺激A基因的轉(zhuǎn)錄。
實驗方案:構(gòu)建Luc-A載體,NRF1 WT/mut表達載體,PGC-1α表達載體,將它們共轉(zhuǎn)染至HEK293T細胞。使用Promega 9100-102(421)酶標儀進行檢測。
實驗結(jié)果:
| vector | PGC-1a | NRF1 WT+PGC1a | NRF1 WT+PGC1a | NRF1 mut1+PGC1a | NRF1 WT+PGC1a | NRF1 mut2+PGC1a |
Luc | 112317 | 91710 | 1453678 | 1618954 | 1577119 | 1890584 | 1700605 |
Ren | 57429 | 45074 | 252462 | 256203 | 296715 | 317458 | 326011 |
Ratio | 1.96 | 2.03 | 5.76 | 6.32 | 5.32 | 5.96 | 5.22 |
| NRF1 WT+PGC1a | NRF1 mut3+PGC1a | NRF1 WT+PGC1a | NRF1 mut4+PGC1a | NRF1 WT+PGC1a | NRF1 mut5+PGC1a |
|
Luc | 2058569 | 1955671 | 2264558 | 1867001 | 2363028 | 1973545 |
|
Ren | 356474 | 355662 | 351878 | 356324 | 365557 | 354973 |
|
Ratio | 5.77 | 5.50 | 6.44 | 5.24 | 6.46 | 5.56 |
|
實驗結(jié)論:NRF1的1,2,4,5號突變體對其轉(zhuǎn)錄活性有抑制作用。
6、驗證小分子化合物9-cis-RA(sigma)是否為RXR的激動劑。
實驗方案: 構(gòu)建pBind-RXR α-LBD載體, 將其與 pG5 質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染293T細胞,同時用不同濃度的9-cis-RA(sigma)處理細胞。使用GloMax® Discover Microplate Reader_GM3000酶標儀進行檢測。
實驗結(jié)果:
| con | 9-Cis-low | 9-Cis-high |
Luc | 1193 | 3952 | 44087 |
Ren | 7815 | 5609 | 7045 |
Ratio | 0.15 | 0.70 | 6.26 |
實驗結(jié)論:9-Cis-RA是RXR的激動劑,與文獻報道的相一致。
7、驗證IRF3轉(zhuǎn)錄因子與IFN-β啟動子的相互作用。
實驗方案: 構(gòu)建Luc-IFN-β載體,將其與IRF3表達載體、Ren載體共轉(zhuǎn)染HEK293T細胞。使用SpectraMax L酶標儀進行檢測。
實驗結(jié)果:
| Luc-IFN-β+pRL-TK | Luc-IFN-β+pRL-TK+IRF3 |
Luc | 69576 | 462790 |
Ren | 456979 | 16248 |
Ratio | 0.15 | 26.14 |
實驗結(jié)論:轉(zhuǎn)錄因子IRF3對IFN-β啟動子起正調(diào)控作用。
8、驗證miR-375與A基因 3’UTR是否結(jié)合從而抑制A基因的表達。
實驗方案:分別構(gòu)建Luc-3’UTR-WT載體和Luc-3’UTR-mut載體。將它們與mimic NC/mimic miR共轉(zhuǎn)染MCF-7細胞。使用POLARstar Omega酶標儀進行檢測。
實驗結(jié)果:
| WT+mimic-miR | mut+mimic-miR | WT+mimic NC |
Luc | 1430 | 914 | 650 |
Ren | 41251 | 8206 | 5979 |
Ratio | 0.041 | 0.11 | 0.10 |
實驗結(jié)論:3’UTR-WT是miR-375的作用靶點。
9、驗證靶基因與基因組中的部分基因片段是否發(fā)生作用并進一步確定這些基因與靶基因的作用位點。
實驗方案:構(gòu)建pGL-3 pro-Gene載體及Target gene表達載體,將它們與Ren載體共轉(zhuǎn)染至293T細胞中。通過BERTHOLD centro XS3 LB 900酶標儀進行檢測。
實驗結(jié)果:
| Target gene | |||||
| Gene1 | Gene2 | Gene3 | Gene4 | Gene5 | pGL-3 pro-control |
Luc | 336072 | 634822 | 512443 | 153988 | 825272 | 1070842 |
Ren | 464031 | 391284 | 417179 | 676539 | 572861 | 738308 |
Ratio | 0.72 | 1.62 | 1.23 | 0.24 | 1.44 | 1.46 |
實驗結(jié)論:Target gene對Gene 1,4具有明顯的負向調(diào)控作用。
PartⅡ 植物篇
1、驗證在Y1H篩選后的6個不同轉(zhuǎn)錄因子,對目標基因的調(diào)控作用。
實驗方案:構(gòu)建Luc-目標基因啟動子載體和TF表達載體,將它們與Ren載體轉(zhuǎn)化至擬南芥的原生質(zhì)體中。通過MiKro Win2000酶標儀進行檢測。
實驗結(jié)果:
| Con | TF1 | TF2 | TF3 | TF4 | TF5 | TF6 |
Luc | 305 | 972 | 914 | 1519 | 446 | 400 | 299 |
Ren | 179498 | 57786 | 53551 | 113107 | 51685 | 56714 | 491297 |
Ratio | 0.002 | 0.017 | 0.018 | 0.014 | 0.009 | 0.007 | 0.001 |
實驗結(jié)論:TF1-5對目標基因上調(diào),而TF6對目標基因起抑制作用。(Luc數(shù)值偏低,可以調(diào)整質(zhì)粒的轉(zhuǎn)化比例、提高原生質(zhì)體和底物的使用量)
2、驗證預測的3個擬轉(zhuǎn)錄因子對目標基因的調(diào)控作用。
實驗方案:構(gòu)建Luc-目的基因啟動子載體和TF表達載體,將它們與Ren載體轉(zhuǎn)化至擬南芥的原生質(zhì)體中。通過MiKro Win2000酶標儀進行檢測。
實驗結(jié)果:
| Con | DE4 | GA16 | TX2 |
Luc | 621 | 177 | 2583 | 141 |
Ren | 111199 | 282269 | 26308 | 97342 |
Ratio | 0.006 | 0.001 | 0.099 | 0.002 |
實驗結(jié)論:GA16對目的基因起正向調(diào)控作用;DE4和TX2起負向調(diào)控作用。(Luc數(shù)值偏低,建議見上述案例)
3、采用煙草葉片瞬時表達的方法檢測TF在體內(nèi)的轉(zhuǎn)錄活性。
實驗方案:報告載體含有5× GAL4激活域,其下游連接 Luc 基因;效應(yīng)載體含有TF基因,其上游連接GAL4 DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域,形成融合轉(zhuǎn)錄因子。將兩種載體轉(zhuǎn)化至農(nóng)桿菌,侵染煙草葉片。侵染24-36h后,將葉片打孔成1.5cm左右的葉盤。在2mL的EP管中放入3片左右的葉盤,加入液氮,放入預冷的小鋼珠進行研磨。加入裂解液,使用 SoftMax Pro Software(Molecular devices)酶標儀進行檢測。
實驗結(jié)果:
| pBD | pBD-VP16 | pBD-TF |
Luc | 18833 | 7291 | 50667 |
Ren | 14333 | 3855 | 12012 |
Ratio | 1.33 | 1.91 | 4.30 |
實驗結(jié)論:煙草雙熒光素酶檢測結(jié)果顯示,含有pBD-TF效應(yīng)載體的熒光值顯著高于陰性對照pBD和陽性對照(pBD-VP16)熒光值。結(jié)果表明TF是活性很高的轉(zhuǎn)錄激活因子。
4、驗證轉(zhuǎn)錄因子X能否結(jié)合到基因A和B的啟動子區(qū)域從而激活其表達。
實驗方案:構(gòu)建Luc-A/B和TFX表達載體。將它們共轉(zhuǎn)化至農(nóng)桿菌中,侵染煙草葉片。2天后,將葉片打孔成1cm左右的葉盤。取3片放入2mL EP管中,加入液氮進行研磨。之后加入裂解液進行處理。用Mithras(LB940)酶標儀進行測定。
實驗結(jié)果:
| A-Con | A-TFX | B-Con | B-TFX |
Luc | 386 | 397 | 373 | 411 |
Ren | 1493602 | 1290175 | 25508 | 7345 |
Ratio | 0.00026 | 0.00032 | 0.01507 | 0.05708 |
實驗結(jié)論: 轉(zhuǎn)錄因子X能結(jié)合到基因B的啟動子區(qū)域并激活其表達(p<0.005),但是無法結(jié)合到基因A的啟動子區(qū)域。(Luc數(shù)值偏低,要確保研磨*,加大裂解液的使用量)
以上就是小翊收集到的雙熒光素酶相關(guān)數(shù)據(jù)了,希望對您有幫助。
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產(chǎn)品名稱 | 貨號 | 規(guī)格 | 價格(元) | *(元) |
Dual Luciferase Reporter Gene Assay Kit 雙熒光素酶報告基因檢測試劑盒 | 11402ES60 | 100T | 1265.00 | 752.00 |
Dual Luciferase Reporter Gene Assay Kit 雙熒光素酶報告基因檢測試劑盒 | 11402ES80 | 1000T | 9965.00 | 6852.00 |
Luciferase Reporter Gene Assay Kit 螢火蟲熒光素酶報告基因檢測試劑盒 | 11401ES60 | 100T | 349.00 | / |
Luciferase Reporter Gene Assay Kit 螢火蟲熒光素酶報告基因檢測試劑盒 | 11401ES76 | 500T | 969.00 | / |
Luciferase Reporter Gene Assay Kit 螢火蟲熒光素酶報告基因檢測試劑盒 | 11401ES80 | 1000T | 1748.00 | / |
HB200308